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nucleotide-transformer

Transformer驱动的基因组语言及单核苷酸序列分割模型

nucleotide-transformer项目提供了九种预训练基因组语言模型和两种SegmentNT分割模型。基于Transformer的基因组模型综合了3,200个人类基因组和850个不同物种的基因组数据,能够高精度预测分子表型。Agro NT模型专用于农作物基因组,在基因调控和表达预测上表现优异。这些模型可以实现对DNA序列基因组元素的单核苷酸分辨率分割。

Nonstationary_Transformers - 创新时间序列预测方法应对非平稳数据
GithubNon-stationary Transformers开源项目时间序列预测模型架构注意力机制深度学习
Non-stationary Transformers项目开发了新型时间序列预测方法,采用系列平稳化和去平稳注意力机制处理非平稳数据。该方法在多个基准数据集上展现出优异性能,并能有效提升现有注意力模型的预测效果。项目开源了完整代码和实验脚本,为时间序列预测研究和应用提供了重要参考。
rinalmo - 基于BERT的非编码RNA预训练模型助力RNA结构预测
GithubHuggingfaceRNA模型RiNALMo序列分析开源项目模型深度学习生物信息学
RiNALMo是一种基于BERT架构的非编码RNA预训练语言模型。该模型在3600万条独特ncRNA序列上使用掩码语言建模进行训练,可有效应用于RNA结构预测。模型包含33层、1280个隐藏单元和20个注意力头,总参数量达6.5亿。RiNALMo可用于RNA序列特征提取、序列和核苷酸级别的分类回归任务,以及RNA接触预测等多种下游应用。
iTransformer - 先进的时间序列预测模型,打造SOTA性能
GithubiTransformer人工智能开源项目时间序列预测注意力网络深度学习
iTransformer是一种基于注意力机制的时间序列预测模型,由清华大学和蚂蚁集团研究人员开发。该模型采用倒置Transformer结构,支持多变量和多步长预测。iTransformer引入了可逆实例归一化等技术,旨在提高预测准确性和处理长序列数据的能力。这个开源项目为时间序列分析提供了新的研究方向。项目提供Python实现,支持使用PyTorch框架。用户可通过pip安装并轻松集成到现有的时间序列分析工作流程中。该项目还包括实验性功能,如二维注意力和傅里叶变换增强版本,为研究人员提供了探索和改进的空间。
iTransformer - 用于多变量时间序列预测的iTransformer模型
GithubTransformer模型iTransformer多变量预测开源项目时间序列预测高效注意力机制
iTransformer是一种用于多变量时间序列预测的开源模型,无需修改任何Transformer模块。它在处理大规模数据时表现出色,具备显著的性能提升和强大的泛化能力。iTransformer已在多种基准测试中表现优异,支持静态协变量和概率发射头。用户可通过pip安装,并使用项目提供的详细训练和评估脚本。更多信息请参阅官方论文。
prot_bert - BERT蛋白质序列模型助力破解生命密码
GithubHuggingfaceProtBert开源项目掩码语言建模模型氨基酸序列生物信息学蛋白质语言模型
ProtBert是一种基于BERT架构的蛋白质序列预训练语言模型,在2.17亿个蛋白质序列上进行自监督学习。该模型能捕获序列中的关键生物物理特性,可用于蛋白质特征提取或下游任务微调。在二级结构预测和亚细胞定位等任务中表现优异,为解析蛋白质功能提供新工具。ProtBert展现了人工智能在生命科学领域的应用潜力。
hardware-aware-transformers - 瞄准多硬件平台优化的自然语言处理Transformer模型
GithubHATNLPPyTorchTransformer开源项目硬件感知
HAT项目提供基于PyTorch的硬件感知Transformer,模型大小减小至原来的3.7倍,且性能无损。通过SuperTransformer搜索优化的SubTransformer,大幅降低搜索成本,并在不同硬件平台例如Raspberry Pi和Intel Xeon上实现显著加速。支持多种机器翻译任务,并提供预处理数据和预训练模型的直接下载。
subnet9_track2_1 - Transformer模型使用指南及相关风险和技术限制
GithubHuggingfacetransformers开源项目技术规格模型模型细节环境影响用途
本页面概述Transformer模型的使用说明,包含潜在风险和技术限制,指导用户在直接或下游应用中采用最佳实践,规避偏见和误用。
Anomaly-Transformer - 创新时间序列异常检测模型的新方法
Anomaly-TransformerGithub开源项目异常检测无监督学习时间序列注意力机制
Anomaly-Transformer是一种时间序列异常检测模型,利用关联差异作为可区分标准,并结合Anomaly-Attention机制和极小极大策略提高检测效果。该模型在多个基准数据集上展现出优秀性能,为无监督时间序列异常检测领域提供了新的解决方案。
v3_1_pt_ep1_sft_5_based_on_llama3_1_8b_final_data_20241019 - 探索先进的自然语言处理开源模型及其实际应用
GithubHuggingfacetransformers开源项目模型模型卡环境影响训练细节语言模型
了解先进自然语言处理开源模型的信息,包括用途、评估方法及风险提示。虽然详细信息未完全披露,但以上内容可为开发和应用提供重要参考。
subnet9_Aug30_c - 深入了解最新Transformers模型的特性与潜在应用
GithubHuggingfacetransformers使用指南开源项目模型模型卡片评价指标语言模型
页面介绍了最新Transformer模型的详细信息,包括使用方法、训练细节及初步评估结果。开发者资料、语言支持、许可信息等细节有待完善。用户可参考代码示例以便快速入门,并了解模型的直接及潜在应用。页面同时提示模型存在的偏见、风险和技术限制,建议使用者在应用时加以考虑。
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