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scrnaseq

单细胞RNA测序数据分析流程 支持多种工具的开源项目

nf-core/scrnaseq是一个开源的单细胞RNA测序数据分析流程。该项目集成了Alevin-Fry、STARSolo、Kallisto等多种分析工具,可处理10x Genomics等平台产生的数据。流程提供详细文档和灵活的参数设置,支持多种运行环境。用户可根据需求选择合适的分析方法,输出h5ad、Seurat或mtx格式结果。项目持续更新,旨在为单细胞转录组分析提供标准化和可重复的解决方案。

awesome-bioie - 免费工具和方法助力提取非结构化生物医学数据中的信息
BERTBioIEGithubLLMs开源项目生物医学数据自然语言处理
这个开源项目提供了一系列无需付费且许可要求低的资源,旨在从非结构化生物医学数据和文本中提取结构化信息。随着语言模型如BERT和GPT-4的引入,生物信息提取方法得到了显著优化。项目涵盖多个方面,包括研究概述、活跃群组、工具和数据集,所有资源均公开且积极维护。
naas - Jupyter笔记本驱动的开源数据处理平台
AIGithubJupyterNaas开源项目数据分析自动化
Naas是基于Jupyter笔记本的开源数据处理平台,为数据分析师、科学家和工程师提供强大的数据引擎。通过模板、驱动和功能三个低代码层,Naas实现数据工作自动化、报告生成、数据连接和生产环境转换。该平台集成自动化、分析和AI功能,支持快速创建数据任务和报告,连接各类数据源和机器学习算法。Naas将Jupyter笔记本转化为生产就绪环境,提供任务调度、资源共享和通知等功能,作为Google Colab的社区驱动替代方案,为用户提供更灵活的数据处理能力。
flow-forecast - 开源时间序列深度学习框架,支持最新模型和云端集成
Flow ForecastGithubtransformer开源开源项目时间序列预测深度学习
Flow Forecast 是一个开源时间序列预测深度学习框架,提供最新的Transformer、注意力模型、GRU等技术,并具有易于理解的解释指标、云集成和模型服务功能。该框架是首个支持Transformer模型的时间序列框架,适用于流量预测、分类和异常检测。
scikeras - Keras与Scikit-Learn的无缝集成工具
GithubKerasPythonSciKerasScikit-Learn开源项目机器学习
SciKeras是一个开源项目,旨在为Keras模型提供Scikit-Learn兼容的包装器。作为tf.keras.wrappers.scikit_learn的继任者,SciKeras保持API兼容性的同时,提供了更多功能。该项目支持TensorFlow,可通过pip轻松安装。SciKeras不仅提供详细文档,还有完整的迁移指南,方便用户从原有框架过渡。项目基于scikit-learn 1.4.1post1及以上版本和Keras 3.2.0及以上版本,为机器学习实践者提供了一个强大的集成工具。
instill-core - 一款用于数据、模型和管道编排的全栈 AI 基础设施工具
AI基础设施GithubInstill CloudInstill Core开源项目数据管道模型编排
探索instill-core,该全栈AI基础架构工具旨在简化AI驱动应用的数据、模型及数据流水线编排。了解更多详情,请参阅官方文档。
DNABERT - DNABERT:用于基因组DNA语言处理的双向编码器模型
BERTDNABERTGPUGithub基因组开源项目预训练模型
DNABERT提供完整的源码、使用示例、预训练和微调模型,适用于各类基因组DNA语言处理任务。该项目利用Huggingface的扩展工具,增添了多任务支持和高效的可视化功能。最新版DNABERT-2不仅提升了多物种基因组的处理能力,还发布了全面的Genome Understanding Evaluation (GUE)基准测试,涵盖28个数据集。
biocypher - 生命科学知识图谱构建和管理工具
BioCypherGithub开源软件开源项目数据集成生物信息学知识图谱
BioCypher是一款专为生命科学领域设计的知识图谱工具,旨在简化创建和维护过程。它提供了灵活的数据存储、集成和推理功能,支持复杂数据的探索和分析。BioCypher可应用于人工智能研究,并具有用户友好的界面。该工具提供全面的文档和教程,帮助研究人员轻松构建和管理知识图谱。作为开源项目,BioCypher不断发展,为生物医学研究提供有力支持。
spark - 统一分析引擎 支持多语言API及丰富工具集
Apache SparkGithub分布式计算大数据处理开源项目数据分析机器学习
Apache Spark是一个大规模数据处理的统一分析引擎,提供Scala、Java、Python和R的高级API。它支持多种高级工具,如Spark SQL、pandas API on Spark、MLlib、GraphX和Structured Streaming,分别用于SQL查询、pandas操作、机器学习、图处理和流处理。Spark的优化引擎支持通用计算图,适用于多种大数据分析场景。
spark-nlp-workshop - Python和Scala自然语言处理实践资源
GithubPythonScalaSpark NLP开源项目机器学习自然语言处理
Spark NLP Workshop是一个开源项目,提供丰富的Jupyter笔记本和教程,展示如何在Python和Scala中使用Spark NLP进行自然语言处理。项目涵盖注释、评估和训练等方面,并包含适用于不同开发环境的Databricks笔记本。此资源库支持本地和Google Colab环境的简易设置,为数据科学家和开发者提供了实用的NLP工具和示例。
synapse - 开源工作流管理系统
GithubSynapse工作流管理系统开源开源项目无服务器工作流社区驱动
Synapse是开源工作流管理系统,实现Serverless Workflow规范。支持本地、Docker和Kubernetes部署,提供GUI仪表板和CLI工具。系统包含管理、监控和运行时API,采用多种实现方式。Synapse作为社区项目,旨在构建无供应商锁定的工作流生态系统。
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豆包 MarsCode 是一款革命性的编程助手,通过AI技术提供代码补全、单测生成、代码解释和智能问答等功能,支持100+编程语言,与主流编辑器无缝集成,显著提升开发效率和代码质量。

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Suno AI是一个革命性的AI音乐创作平台,能在短短30秒内帮助用户创作出一首完整的歌曲。无论是寻找创作灵感还是需要快速制作音乐,Suno AI都是音乐爱好者和专业人士的理想选择。

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稿定设计 是一个多功能的在线设计和创意平台,提供广泛的设计工具和资源,以满足不同用户的需求。从专业的图形设计师到普通用户,无论是进行图片处理、智能抠图、H5页面制作还是视频剪辑,稿定设计都能提供简单、高效的解决方案。该平台以其用户友好的界面和强大的功能集合,帮助用户轻松实现创意设计。

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