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#基因组比对
Chromap: 快速处理染色质数据的对齐与预处理工具
2 个月前
Chromap是一款专门用于高通量染色质测序数据的超快速比对和预处理工具。它能够高效处理ChIP-seq、ATAC-seq和Hi-C等染色质相关数据,大大提高了分析效率。
Chromap
基因组比对
高通量测序
生物信息学
染色质分析
Github
开源项目
2 个月前
相关项目
chromap
Chromap是一款开源的染色质分析数据处理工具,专门用于高通量测序数据的快速对齐和预处理。它可处理ChIP-seq、ATAC-seq、scATAC-seq和Hi-C等多种数据类型,具备测序接头修剪、基因组比对和重复序列去除等功能。Chromap在保持高准确度的同时,将处理速度提升了10-20倍。该工具提供多种预设参数以适应不同实验类型,并支持BED、SAM和pairs等多种输出格式。
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