LightDock是一款基于萤火虫群优化算法的蛋白质对接框架，支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽段和蛋白质-DNA的对接。该框架具有高度灵活性，允许用户自定义评分函数，支持局部无梯度最小化，并能限制模拟以聚焦特定相互作用区域。LightDock还支持受体和配体的残基限制，为分子对接研究提供了多功能且强大的工具。