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#蛋白质结构压缩
Foldcomp: 高效压缩和索引蛋白质结构的创新工具
2 个月前
Foldcomp是一种新型的蛋白质结构压缩算法和索引系统,可以有效地压缩和处理大规模的蛋白质结构数据。它通过编码骨架和侧链的扭转角来实现高效压缩,显著减少了存储空间需求,同时保持了结构信息的准确性。
Foldcomp
蛋白质结构压缩
生物信息学
数据存储
氨基酸编码
Github
开源项目
2 个月前
相关项目
foldcomp
Foldcomp是一个开源的蛋白质结构压缩和索引工具。通过编码主链和侧链的扭转角,它将每个氨基酸残基压缩至13字节,大幅降低存储需求。Foldcomp支持单链PDB文件压缩,提供命令行和Python API接口,可进行压缩、解压缩、序列提取等操作。此外,Foldcomp还提供了多个预构建的大规模蛋白质结构数据库,如AlphaFoldDB和ESMAtlas,便于研究人员使用。
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