#pyfaidx

pyfaidx是一个Python模块,实现了高效的FASTA文件索引和操作功能。该模块提供纯Python类,兼容samtools faidx,支持快速随机访问大型FASTA文件中的任意子序列,同时最小化内存使用。pyfaidx的API兼容pygr seqdb模块,并提供命令行工具进行复杂的FASTA文件处理。该模块支持Python 3.7+版本,可通过PyPI安装。