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TransBTS

使用Transformer实现多模态脑肿瘤医学图像分割

TransBTS与TransBTSV2采用Transformer技术显著提升多模态脑肿瘤与医学图像体积分割的效率与准确性。项目包括详细的模型实现和相关文献,支持BraTS、LiTS、KiTS等医学图像数据集,并利用Python和Pytorch进行数据预处理、模型训练和测试,支持分布式训练。适用于需要高效精准医学图像分割解决方案的研究人员和工程师。

segformer-b4-finetuned-ade-512-512 - 512x512分辨率下SegFormer的高效Transformer语义分割实现
ADE20kGithubHuggingfaceSegFormerTransformer图像处理开源项目模型语义分割
本项目展示了SegFormer模型如何应用在ADE20k数据集上,以512x512分辨率进行微调。该模型采用分层Transformer编码器与轻量级全MLP解码头的设计,并在ImageNet-1k预训练后用于语义分割。其适用于多个基准测试如ADE20K和Cityscapes,为视觉分割提供强大而灵活的工具。用户可以使用该模型进行图像的语义分割,或选择适合特定任务的微调版本。
BitNet - 高效压缩大型语言模型的1比特变压器实现
1比特变换器BitNetGithubPyTorch实现大语言模型开源项目模型压缩
BitNet是一种创新的1比特变压器实现,通过BitLinear层替换标准线性投影,实现大型语言模型的高效压缩。该项目提供PyTorch实现,包含BitLinear、BitNetTransformer和BitAttention等核心组件,支持推理和Hugging Face模型集成。BitNet还探索了视觉任务应用,展现了多模态领域的潜力。项目包括训练脚本、性能基准测试和CUDA优化,为研究人员和开发者提供了全面的工具集。
SuPreM - 基于大规模数据集的三维医学影像分析预训练模型套件
3D模型GithubSuPreM医学影像分析大规模数据集开源项目迁移学习
SuPreM是一套基于大规模数据集和每体素标注的预训练3D模型,在多种医学影像任务中展现出优秀的迁移能力。该项目结合AbdomenAtlas 1.1数据集(9,262个带注释CT扫描)和多个先进AI模型,为三维医学图像分析提供了基础数据集和模型,有助于提升该领域的研究效率和算法性能。
SyntheticTumors - 合成肿瘤数据助力AI提升真实肿瘤分割效果
AIGithub医学影像合成肿瘤开源项目深度学习肿瘤分割
SyntheticTumors项目开发了创新策略生成合成肝脏肿瘤数据,用于训练AI模型。研究发现,使用合成肿瘤数据训练的模型在真实肿瘤分割任务中表现优于使用真实肿瘤数据训练的模型。项目提供了多个合成肿瘤示例,展示了其与真实肿瘤的视觉相似性。这种方法为医学影像分析和AI辅助诊断提供了新的研究方向。
HuatuoGPT-Vision - 大规模医疗视觉知识赋能多模态语言模型
GithubHuatuoGPT-VisionPubMedVision医学VQA数据集医学视觉知识多模态大语言模型开源项目
HuatuoGPT-Vision项目致力于增强多模态语言模型的医疗视觉理解能力。该项目推出了包含130万高质量医疗视觉问答对的PubMedVision数据集,显著提升了模型在医疗领域的多模态表现。研究团队基于此开发了HuatuoGPT-Vision-7B和34B两个版本的医疗多模态语言模型,在多项医疗视觉问答基准测试中均取得了优异成绩。这一项目不仅为医疗人工智能领域提供了宝贵的数据资源和先进模型,还有望推动医疗影像分析和诊断技术的进步。
BiomedVLP-CXR-BERT-specialized - 胸部X光领域专用语言模型 优化生物医学视觉语言处理
CXR-BERTGithubHuggingface医疗影像多模态学习开源项目模型胸部X光自然语言处理
BiomedVLP-CXR-BERT-specialized是专为胸部X光领域开发的语言模型。通过优化词汇表、创新预训练方法、权重正则化和文本增强技术,该模型在放射学自然语言推理和掩码语言模型预测等任务中表现优异。它还能应用于零样本短语定位和图像分类等视觉-语言处理任务。此外,该模型与ResNet-50图像模型联合训练,可用于短语定位。作为生物医学视觉-语言处理研究的重要工具,BiomedVLP-CXR-BERT-specialized为相关领域提供了新的可能性。
repeat - 开源自然语言处理库
GithubHuggingfacetransformers人工智能开源项目机器学习模型深度学习自然语言处理
Transformers是一个开源的自然语言处理库,提供了多种预训练模型和工具。该库支持文本分类、命名实体识别和机器翻译等任务,具有良好的文档支持和定期更新特性。研究人员和开发者可以使用Transformers构建和部署NLP应用。
single-cell-transformer-papers - Transformer模型在单细胞组学分析中的应用概览
GithubTransformers单细胞组学基因表达开源项目细胞注释预训练模型
本项目汇总了单细胞组学数据分析中的Transformer模型,包括论文、代码、数据模态等关键信息。通过全面概述单细胞Transformer模型,展示了该领域的最新进展和发展趋势。项目内容持续更新,为研究人员提供了宝贵的参考资源。项目内容涵盖了各Transformer模型的核心要素,如数据模态、预训练数据集、模型架构和任务类型等。这种系统性的整理使研究人员能够快速了解和比较不同模型的特点,为单细胞组学研究提供了有力支持。
transformer-debugger - 深入洞察小型语言模型行为的自动化调试工具
GithubTransformer Debugger开源项目神经元查看器稀疏自编码器自动可解释性语言模型
Transformer Debugger是一款由OpenAI超级对齐团队开发的工具,专门用于分析小型语言模型的特定行为。该工具结合了自动化解释技术和稀疏自编码器,无需编写代码即可快速探索模型行为。它能识别影响特定行为的关键组件,自动生成解释,并追踪组件间的连接,从而揭示神经元回路。通过支持对前向传播的干预和观察,Transformer Debugger为研究人员提供了深入分析语言模型内部机制的强大功能。
DNABERT-2-117M - 多物种基因组分析的先进Transformer模型
DNABERT-2GithubHuggingface医学基因组开源项目模型深度学习生物学
DNABERT-2-117M是一个创新的多物种基因组分析工具,基于先进的Transformer架构。它整合了MosaicBERT技术,实现了DNA序列的高效嵌入计算。用户可以通过简单的Python代码调用模型,获取DNA序列的向量表示。这一功能为生物信息学和医学基因组学研究提供了强大支持,有望推动多种基因组分析任务的进展。
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