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基于关系原则的科学工作流管理框架 DataJoint

DataJoint for Python作为开源科学工作流管理框架,基于关系数据模型设计。框架提供一致的数据组织、计算和查询方法,适用于处理大规模实验数据。项目始于2009年,现已被多个实验室采用。DataJoint支持简便安装,提供完善的文档和教程资源,并包含针对神经科学的示例管道。该框架致力于优化数据处理流程,提高科研工作效率。

DOI 覆盖率状态 PyPI版本 Slack

欢迎使用Python版DataJoint!

DataJoint for Python是一个基于关系原理的科学工作流管理框架。DataJoint建立在关系数据模型的基础之上,提供了一种一致的方法来组织、填充、计算和查询数据。

DataJoint最初由Dimitri Yatsenko于2009年在贝勒医学院Andreas Tolias实验室开发,用于分布式处理和管理来自常规实验的大量数据流。从2011年开始,DataJoint作为一个开源项目向公众开放,被其他实验室采用,并通过多位开发者的贡献得到改进。目前,DataJoint开源软件的主要开发者是DataJoint公司(https://datajoint.com)。

数据流水线示例

流水线

Yatsenko et al., bioRxiv 2021

入门指南

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