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S-PubMedBert-MS-MARCO

医疗文本信息检索专用BERT模型

S-PubMedBert-MS-MARCO是一个针对医疗和健康文本领域优化的信息检索模型。它基于PubMedBERT,并通过MS-MARCO数据集微调,可将文本映射为768维向量。该模型适用于语义搜索和文本聚类,支持Sentence-Transformers和HuggingFace Transformers框架,为医疗文本分析提供了有效工具。

MedCAT - 从电子健康记录中提取信息并链接到生物医学术语库
GithubMedCATSNOMED-CTUMLS开源项目生物医学本体论电子健康记录
MedCAT是一款用于从电子健康记录(EHR)中提取信息并将其链接到生物医学术语库(如SNOMED-CT和UMLS)的工具。它支持多个模型,包括UMLS小型模型、完整的SNOMED国际模型和荷兰UMLS模型等。用户可以通过UMLS用户认证下载最新的模型包。项目持续更新,新增功能包括医疗文本否定检测和患者时间线深度生成建模。此外,还发布了多篇相关研究论文。安装简单,可选择支持GPU或CPU。
spacy-transformers - 在 spaCy 中使用 BERT、XLNet 和 GPT-2 等预训练转换器
BERTGPT-2GithubXLNetspaCytransformers开源项目
spacy-transformers通过Hugging Face的transformers实现预训练模型如BERT、XLNet和GPT-2的集成,提升spaCy的功能。支持多任务学习、转换器输出自动对齐等,兼容Python 3.6以上版本,需要PyTorch v1.5+和spaCy v3.0+。
DNABERT - DNABERT:用于基因组DNA语言处理的双向编码器模型
BERTDNABERTGPUGithub基因组开源项目预训练模型
DNABERT提供完整的源码、使用示例、预训练和微调模型,适用于各类基因组DNA语言处理任务。该项目利用Huggingface的扩展工具,增添了多任务支持和高效的可视化功能。最新版DNABERT-2不仅提升了多物种基因组的处理能力,还发布了全面的Genome Understanding Evaluation (GUE)基准测试,涵盖28个数据集。
Huatuo-Llama-Med-Chinese - 基于中文医学知识的指令微调大语言模型
GithubHuaTuo中文医学知识大语言模型开源项目指令微调本草
本项目通过对LLaMA、Alpaca-Chinese、Bloom等大语言模型进行指令微调,提升其在医疗问答领域的效果。利用医学知识图谱和文献,结合ChatGPT API构建数据集,开源了包括活字和Bloom在内的多种微调模型。适用于智慧医疗,模型在心肌梗塞、肝胆管结石等疾病的诊断和治疗方案建议方面表现优异,支持个性化微调和应用。
BertWithPretrained - 基于PyTorch实现的BERT模型及相关下游任务
BERTGithubPyTorchTransformer中文文本分类开源项目英文文本分类
该项目基于PyTorch实现了BERT模型及其相关下游任务,详细解释了BERT模型和每个任务的原理。项目支持分类、翻译、成对句子分类、多项选择、问答和命名实体识别等任务,涵盖中文和英语的自然语言处理。此外,项目还含有丰富的数据集和预训练模型配置文件。
text2vec - 多模型文本向量化工具,支持多语言文本匹配分析
BERTGithubText2vec开源项目文本向量化文本相似度模型训练
text2vec工具实现了多种文本向量表示和相似度计算模型,如Word2Vec、BERT、Sentence-BERT和CoSENT。最新版本增加了多卡推理和命令行工具,方便用户批量处理文本向量化。它在中英文测试集上的表现优秀,尤其新版中文匹配模型在短文本区分上有显著提升。该工具为中文和多语言文本匹配提供了丰富的支持,能够满足各种文本语义分析任务的需求。
swift-coreml-transformers - 实现GPT-2和BERT等Transformer模型
CoreMLGithubSwiftTransformers开源项目模型转换自然语言处理
swift-coreml-transformers项目提供了GPT-2、DistilGPT-2、BERT和DistilBERT等Transformer模型的Swift Core ML实现。项目包括预训练模型、转换脚本、分词器实现和演示应用。开发者可在iOS设备上部署这些自然语言处理模型,实现文本生成和问答功能。该开源项目展示了如何将先进NLP技术应用于移动设备。
Sunsimiao - 中文医疗大模型,提供全面诊疗建议
CMB-ExamGithubQwen2-7BSunsimiao中文医疗大模型开源项目高质量医疗数据
孙思邈中文医疗大模型结合孙思邈的医学理念和高质量中文医疗数据,旨在提供广泛的诊疗建议。该模型在多个医疗考试中表现出色,由华东理工大学发起,得到多家组织支持。训练数据涵盖医疗文献、教材、诊断数据和问诊对话,持续更新并通过人工与自动化处理以确保高质量。
BianQue - 中文医疗健康大模型
AIBianQue-2.0Github中文医疗对话健康大模型开源项目扁鹊
华南理工大学未来技术学院及广东省数字孪生人重点实验室基于ProactiveHealthGPT系统开发的BianQue项目,利用千万级中文健康对话数据,专注于提高大模型的医疗问询能力和多轮对话交互性。该项目致力于解决多轮交互问题,为慢性病及心理咨询领域的科研提供重要支持。
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