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EHRSHOT: 一个用于少样本评估电子健康记录基础模型的基准数据集

2024年09月05日
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相关项目
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MedCAT

MedCAT是一款用于从电子健康记录(EHR)中提取信息并将其链接到生物医学术语库(如SNOMED-CT和UMLS)的工具。它支持多个模型,包括UMLS小型模型、完整的SNOMED国际模型和荷兰UMLS模型等。用户可以通过UMLS用户认证下载最新的模型包。项目持续更新,新增功能包括医疗文本否定检测和患者时间线深度生成建模。此外,还发布了多篇相关研究论文。安装简单,可选择支持GPU或CPU。

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openemr

OpenEMR是一个功能全面的开源医疗信息系统,集成电子健康记录、医疗实践管理、排程、电子账单等功能。支持多平台运行,提供国际化和社区支持。该项目致力于提升医疗保健质量,欢迎各界专业人士参与贡献。

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ehrshot-benchmark

EHRSHOT基准包含6,739名患者的完整电子健康记录和15个分类任务,用于评估EHR基础模型的少样本学习能力。项目发布了一个在大规模患者数据上预训练的临床基础模型,并提供相关资源,旨在推动EHR深度学习研究的发展和可重复性。

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awesome-healthcare

awesome-healthcare汇集了精选的开源医疗软件、库和资源。涵盖电子健康记录、医学影像、处方系统等多个领域的高质量项目。所有链接均经审核,确保项目活跃且实用。面向医疗机构、服务提供者、开发者、政策专家和研究人员,促进医疗信息技术的创新与共享。

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Bio_Discharge_Summary_BERT

Bio_Discharge_Summary_BERT模型基于BioBERT进行初始化,专注于分析MIMIC III数据库的出院小结文本。经过专业的数据预处理和基于Google BERT的训练,该模型在医疗文本处理任务中展现出优异表现,可以通过transformers库加载,用于医疗研究和实际应用。

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