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#scRNAseq
scrnaseq - 单细胞RNA测序数据分析流程 支持多种工具的开源项目
scRNAseq
nf-core
单细胞测序
生物信息学
Nextflow
Github
开源项目
nf-core/scrnaseq是一个开源的单细胞RNA测序数据分析流程。该项目集成了Alevin-Fry、STARSolo、Kallisto等多种分析工具,可处理10x Genomics等平台产生的数据。流程提供详细文档和灵活的参数设置,支持多种运行环境。用户可根据需求选择合适的分析方法,输出h5ad、Seurat或mtx格式结果。项目持续更新,旨在为单细胞转录组分析提供标准化和可重复的解决方案。
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