#VSEARCH

VSEARCH是一款开源的生物序列分析软件,支持去冗余、聚类和嵌合体检测等功能。它利用SIMD矢量化和多线程并行技术,可处理大型数据库。VSEARCH采用全局最优比对算法,精度高于USEARCH。软件支持多种CPU架构和操作系统,可读取压缩文件,是USEARCH的免费开源替代方案。此外,VSEARCH还支持全长和前缀去冗余、重复、反向互补、掩蔽、全局比对搜索等功能。可用于FASTQ文件分析、过滤、转换和合并配对末端读取。