GPUMD

GPU加速的分子动力学模拟和机器学习势能开发工具

GPUMD是一款在GPU上实现的高效分子动力学模拟工具。它支持神经进化势能(NEP)的训练和使用,提供热传导计算、光谱分解等功能。该工具性能高效,易于使用,适用于Linux和Windows系统。GPUMD提供丰富的教程、文档和相关Python包,便于进行大规模原子模拟和数据分析。

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介绍相关项目

genie - 创新算法实现蛋白质从头设计开源项目助力生物技术突破

GenieGithub开源项目氨基酸残基深度学习等变扩散蛋白质设计

Genie是一个开源的人工智能蛋白质设计项目，利用机器学习算法自动生成新型蛋白质结构。它提供完整的代码库，支持模型训练、结构采样和性能评估。研究人员可使用Genie设计长度为50至128个氨基酸的蛋白质，应用于生物技术、医药研发和材料科学等领域。项目集成了多种评估工具，为蛋白质工程提供了创新解决方案，为研究人员带来新的可能性。

chroma - 用于蛋白质设计的可编程生成模型

ChromaGithub开源项目扩散模型条件控制生成模型蛋白质设计

Chroma是一个创新的蛋白质设计生成模型,结合了扩散建模、等变图神经网络和条件随机场技术。它提供多种蛋白质条件器,用于控制子结构、对称性和形状等,并支持自定义条件器开发。Chroma可高效采样全原子结构,实现骨架序列生成、侧链打包等蛋白质建模任务。在普通GPU上,Chroma能快速生成大型蛋白质复合物,为蛋白质设计领域带来新的可能性。

AmadeusGPT - 自然语言驱动的动物行为分析工具

AmadeusGPTGithub动物行为开源项目机器学习自然语言接口行为分析

AmadeusGPT是一款创新的自然语言接口，能将动物行为描述转换为可执行代码。该项目运用大型语言模型连接自然语言和行为分析，为研究人员提供无需编程的动物视频数据分析平台。功能涵盖兴趣区域绘制、社交互动分析和多视频查询等。AmadeusGPT简化了行为量化和分析流程，使用户无需深入了解动物行为学或机器学习即可进行复杂分析。

MegEngine - 高效、可扩展且易于使用的深度学习框架

GithubMegEngine开源项目深度学习框架硬件需求训练与推理高性能

MegEngine是一个高效、可扩展且易于使用的深度学习框架，具有统一的训练和推理框架、低硬件要求和跨平台高效推理的三大关键特性。支持x86、Arm、CUDA、RoCM等多种平台，兼容Linux、Windows、iOS、Android等系统。通过DTR算法和Pushdown内存规划器，大幅降低GPU内存使用。适用于模型开发到部署的各个环节，致力于构建开放友好的AI社区。

nccl-rdma-sharp-plugins - NCCL插件，支持RDMA和SHARP的GPU通信优化工具

CUDAGithubMOFEDNCCLRDMASHARP开源项目

nccl-rdma-sharp-plugins是NVIDIA NCCL库的扩展插件，为GPU通信提供RDMA和SHARP支持。该项目依赖MOFED、CUDA等组件，使用GNU autotools进行构建。通过优化GPU间数据交换，该插件可提升分布式深度学习等场景的通信效率。项目开源，适合需要高性能GPU通信的开发者和研究人员使用。

PowerInfer - 消费级GPU上大型语言模型高效推理引擎

GPU加速GithubPowerInfer大语言模型局部性设计开源项目混合CPU/GPU使用

PowerInfer是一款在个人电脑上针对消费级GPU设计的高效大型语言模型(LLM)推理引擎。它结合激活局部性原理和CPU/GPU混合技术，通过优化热/冷激活神经元的处理方式，显著提高推理速度并降低资源消耗。软件还融入了适应性预测器和神经元感知技术，优化了推理效率和精度，支持快速、低延迟的本地模型部署。

gpytorch - 基于PyTorch实现的灵活高斯过程建模工具

GPU加速GPyTorchGaussian processGithubKISS-GPPyTorch开源项目

GPyTorch是一个基于PyTorch实现的高斯过程库，旨在简便地创建可扩展、灵活的高斯过程模型。它通过数值线性代数技术实现了显著的GPU加速，并集成了如SKI/KISS-GP和随机Lanczos展开等先进算法，同时能与深度学习框架无缝结合。支持Python 3.8及以上版本。更多信息、示例和教程请参阅官方文档。

ppl.llm.kernel.cuda - 优化大语言模型计算的CUDA内核库

AI计算CUDAGPU加速GithubPPL LLM开源项目深度学习

ppl.llm.kernel.cuda是PPL.LLM系统的核心组件，为大语言模型提供CUDA内核实现。该项目针对Ampere和Hopper架构优化，支持x86_64和arm64平台。它提供简单的构建流程，包含NCCL和JIT编译选项，便于性能调优。作为开源项目，ppl.llm.kernel.cuda旨在提高大规模语言模型的计算效率，为AI开发提供底层支持。

gpu_poor - LLM运行所需GPU内存及每秒处理Token数计算工具

GPU memoryLLM

该工具计算GPU/CPU运行任意LLM所需的内存和每秒处理的Token数，并提供详细的训练和推理内存分配。支持多种量化及推理框架，适用于评估GPU运行特定LLM的能力、调整量化方式及优化GPU内存使用。

GPBoost - 融合树提升与高斯过程的先进机器学习库

GPBoostGithub开源项目机器学习树提升混合效应模型高斯过程

GPBoost是一个创新机器学习库，融合树提升、高斯过程和分组随机效应模型。它支持独立应用树提升、高斯过程和广义线性混合效应模型，主要用C++编写，提供C接口及Python和R包。GPBoost算法结合树提升和潜在高斯模型优势，提高预测函数学习效率，优化高基数分类变量处理，并适用于空间或时空数据建模。这使其成为非线性建模和复杂依赖结构分析的理想工具。

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