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R Markdown 动态分析文档创建工具 集成代码输出与文本

rmarkdown是一款用于创建动态分析文档的R包。它集成了代码、渲染输出和文本内容,支持HTML、PDF、Word等多种输出格式。使用rmarkdown,用户可专注于内容创作,无需过多关注文档呈现。该工具适用于数据科学分析、研究复现、代码协作和结果展示等场景,提高了数据分析和报告的效率。

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R-CMD-check CRAN release Codecov test coverage

rmarkdown包帮助您创建动态分析文档,结合代码、渲染输出(如图表)和文本。您提供数据、代码和想法,R Markdown将您的内容渲染成精美的文档,可用于:

  • 在RStudio IDE中进行交互式数据科学分析,
  • 复现您的分析,
  • 与他人协作和共享代码,以及
  • 向他人传达您的结果。

R Markdown文档可以渲染为多种输出格式,包括HTML文档、PDF、Word文件、幻灯片等,让您专注于内容,而R Markdown负责处理展示。

书籍

R Markdown: The Definitive Guide R Markdown Cookbook

入门指南中了解更多信息。

安装

安装rmarkdown包最简单的方法是在RStudio IDE中进行,但您不需要显式安装或加载它,因为RStudio在需要时会自动完成这两项操作。还需要较新版本的Pandoc(>= 1.12.3);如果您计划在RStudio IDE中使用rmarkdown,RStudio也会自动包含Pandoc,所以您不需要下载Pandoc。

如果您想在RStudio之外使用rmarkdown包,可以从CRAN安装:

install.packages("rmarkdown")

如果您想使用rmarkdown包的开发版本(无论是否使用RStudio),可以通过remotes从GitHub安装:

# install.packages("pak")
pak::pak('rstudio/rmarkdown')

如果不使用RStudio IDE,您需要安装较新版本的Pandoc(>= 1.12.3);请参阅Pandoc安装说明获取帮助。

使用方法

创建新的R Markdown文档最简单的方法是在RStudio中进行。转到"文件 > 新建文件 > R Markdown"。在新建文件向导中,您可以:

  • 提供文档标题(可选但建议)
  • 提供作者姓名(可选但建议)
  • 选择默认输出格式 - 推荐HTML格式用于编写,您可以随时切换输出格式(必选)
  • 点击"确定"(必选)

在新的.Rmd文件中,您会看到一些包含代码块的样板文本。使用RStudio IDE中的"Knit"按钮一键渲染文件并预览输出,或使用键盘快捷键Cmd/Ctrl + Shift + K。

您也可以删除YAML前置元数据下的所有文本,填写自己的.Rmd内容:

  • 添加代码块(键盘快捷键:Ctrl + Alt + I;OS X:Cmd + Option + I
  • 使用Markdown格式编写文本
  • 通过点击RStudio中的运行按钮图标交互式运行每个代码块

您还可以再次点击"Knit to HTML"来渲染包含所有代码块的完整文档。要获取R Markdown入门的更多帮助,请访问R Markdown网站或使用本页顶部的"入门"链接。

获取帮助

有两个主要的获取帮助的地方:

  1. Posit社区是询问有关rmarkdown和R Markdown系列包的任何问题的友好场所。

  2. Stack Overflow是获取常见rmarkdown问题答案的绝佳来源。一旦您创建了一个说明问题的可复现示例,它也是获得帮助的好地方。

行为准则

请注意,rmarkdown项目发布时附带贡献者行为准则。通过为该项目做出贡献,您同意遵守其条款。

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