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whylogs

开源数据日志库 追踪分析数据变化与质量

whylogs是一款开源数据日志库,可生成数据集摘要(whylogs profiles)。它能追踪数据变化、设置约束条件、快速可视化关键统计信息。whylogs profiles具有高效、可定制、可合并的特点,支持多种数据类型。该库集成了AWS S3、Apache Airflow等工具,可用于数据漂移检测、质量验证和探索性分析等任务,为数据科学家和工程师提供有力支持。


数据日志记录的开放标准

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许可证 PyPi 版本 代码风格:black PyPi 下载量 CI 可维护性

什么是 whylogs

whylogs 是一个用于记录任何类型数据的开源库。通过 whylogs,用户能够生成其数据集的摘要(称为 whylogs 概况),可用于:

  1. 跟踪数据集的变化
  2. 创建 数据约束 以了解数据是否符合预期
  3. 快速可视化数据集的关键统计摘要

这三个功能为数据科学家、机器学习工程师和数据工程师提供了多种用例:

  • 检测模型输入特征的数据漂移
  • 检测训练-服务偏差、概念漂移和模型性能下降
  • 验证模型输入或数据管道中的数据质量
  • 对海量数据集进行探索性数据分析
  • 跟踪机器学习实验的数据分布和数据质量
  • 实现组织范围内的数据审计和治理
  • 标准化组织内的数据文档实践
  • 等等
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Python 快速入门

使用 pip 包管理器安装 whylogs 非常简单,只需在终端中运行 pip install whylogs 即可。

从这里开始,您可以快速记录数据集:

import whylogs as why
import pandas as pd

#数据框
df = pd.read_csv("path/to/file.csv")
results = why.log(df)

就是这样,您现在有了一个 whylogs 概况。要了解更多关于 whylogs 概况是什么以及您可以用它做什么,请继续阅读。

目录

whylogs 概况

什么是概况

whylogs 概况是 whylogs 库的核心。它们捕获数据的关键统计属性,如分布(远超简单的均值、中位数和标准差测量)、缺失值的数量以及广泛的可配置自定义指标。通过捕获这些统计摘要,我们能够准确地表示数据,并实现引言中描述的所有用例。

whylogs 概况具有三个特性,使其成为理想的数据日志记录工具:它们是高效的可定制的可合并的


**高效**: whylogs配置文件能够高效地描述它们所代表的数据集。这种对数据集的高保真表示使得whylogs配置文件成为数据的有效快照。正如我们在博文《数据日志记录:采样与分析》中所讨论的那样,它们比样本更能捕捉数据集的特征,而且非常紧凑。

可定制: whylogs配置文件收集的统计数据很容易配置和定制。这很有用,因为不同的数据类型和用例需要不同的指标,而whylogs用户需要能够轻松定义这些指标的自定义跟踪器。正是whylogs的可定制性使我们能够实现文本、图像和其他复杂数据跟踪器。


可合并: whylogs配置文件最强大的特性之一是它们的可合并性。可合并性意味着whylogs配置文件可以组合在一起,形成代表其组成配置文件总和的新配置文件。这使得分布式和流式系统的日志记录成为可能,并允许用户查看任何时间粒度的汇总数据。


如何生成配置文件

安装whylogs后,在Python和Java环境中都可以轻松生成配置文件。

要在Python中从Pandas数据框生成配置文件,只需运行:

import whylogs as why
import pandas as pd

#数据框
df = pd.read_csv("path/to/file.csv")
results = why.log(df)

配置文件可以做什么

生成whylogs配置文件后,可以做几件事:

在本地Python环境中,你可以设置数据约束或可视化配置文件。对配置文件设置数据约束允许你在数据不符合预期时得到通知,从而进行数据单元测试和基本的数据监控。使用Profile Visualizer,你可以直观地探索数据,了解数据并确保你的ML模型已准备好投入生产。

此外,你可以将whylogs配置文件发送到SaaS ML监控和AI可观察性平台WhyLabs。使用WhyLabs,你可以自动为机器学习模型设置监控,获得数据质量和数据变化问题(如数据漂移)的通知。如果你有兴趣尝试WhyLabs,可以查看永久免费的Starter版本,无需信用卡即可体验整个平台的功能。

WhyLabs

WhyLabs是一个托管服务,旨在帮助用户充分利用他们的whylogs配置文件。通过WhyLabs,用户可以摄取配置文件并设置自动监控,以及全面观察他们的数据和ML系统。使用WhyLabs,用户可以确保数据和模型的可靠性,并调试出现的任何问题。

将whylogs配置文件摄取到WhyLabs很简单。从平台获取访问凭证后,你需要在Python环境中设置它们,记录数据集,并将其写入WhyLabs,如下所示:

import whylogs as why
import os

os.environ["WHYLABS_API_KEY"] = "YOUR-API-KEY"
os.environ["WHYLABS_DEFAULT_DATASET_ID"] = "model-0" # 选定的模型项目"MODEL-NAME"为"model-0"

results = why.log(df)

results.writer("whylabs").write()

image

如果你有兴趣尝试WhyLabs,可以查看永久免费的Starter版本,无需信用卡即可体验整个平台的功能。

数据约束

约束是基于whylogs配置文件构建的一个强大功能,使你能够快速轻松地验证数据是否符合预期。你可以对数据设置多种类型的约束(例如,数值数据始终在特定范围内,文本数据始终为JSON格式等),如果数据集未能满足约束,你可以使单元测试或CI/CD管道失败。

设置和测试约束的简单示例如下:

import whylogs as why
from whylogs.core.constraints import Constraints, ConstraintsBuilder
from whylogs.core.constraints.factories import greater_than_number

profile_view = why.log(df).view()
builder = ConstraintsBuilder(profile_view)
builder.add_constraint(greater_than_number(column_name="col_name", number=0.15))

constraints = builder.build()
constraints.report()

要了解更多关于约束的信息,请查看: 约束示例

配置文件可视化

除了能够自动获得关于数据潜在问题的通知外,手动检查数据也很有用。使用配置文件可视化工具,你可以在Jupyter笔记本环境中直接生成关于配置文件的交互式报告(单个配置文件或比较配置文件)。这使得探索性数据分析、数据漂移检测和数据可观察性成为可能。

要访问配置文件可视化工具,请在终端中运行pip install "whylogs[viz]"安装whylogs的[viz]模块。我们可以创建的一种配置文件可视化是漂移报告;以下是分析两个配置文件之间漂移的简单示例:

import whylogs as why

from whylogs.viz import NotebookProfileVisualizer

result = why.log(pandas=df_target)
prof_view = result.view()

result_ref = why.log(pandas=df_reference)
prof_view_ref = result_ref.view()

visualization = NotebookProfileVisualizer() visualization.set_profiles(目标_profile_view=prof_view, 参考_profile_view=prof_view_ref)

visualization.summary_drift_report()


![image](https://yellow-cdn.veclightyear.com/ab5030c0/e0c58253-4a34-4c2d-b2ed-74729a3ea8a7.png)

要了解更多关于可视化配置文件的信息,请查看:[可视化器示例](https://bit.ly/whylogsvisualizerexample)

## 数据类型<a name="data-types" />

whylogs 支持结构化和非结构化数据,具体包括:

| 数据类型 | 功能 | Notebook 示例 |
| -------- | ---- | ------------- |
| 表格数据 | ✅   | [结构化数据入门](https://github.com/whylabs/whylogs/blob/mainline/python/examples/basic/Getting_Started.ipynb) |
| 图像数据 | ✅   | [图像入门](https://github.com/whylabs/whylogs/blob/mainline/python/examples/advanced/Image_Logging.ipynb) |
| 文本数据 | ✅   | [字符串特征](https://github.com/whylabs/whylogs/blob/maintenance/0.7.x/examples/String_Features.ipynb) |
| 嵌入     | ✅   | [嵌入距离记录](https://github.com/whylabs/whylogs/blob/mainline/python/examples/experimental/embeddings/Embeddings_Distance_Logging.ipynb) |
| 其他数据类型 | ✋ | 您是否有未在此列出的数据类型请求?提出问题或加入我们的 Slack 社区并提出请求!我们随时乐意帮助 |

## 集成

![current integration](https://yellow-cdn.veclightyear.com/ab5030c0/9773ac33-23bc-4d9a-8476-21c625eae5bb.png)

whylogs 可以无缝地与数据和 ML 管道中的不同工具交互。我们目前已经与以下工具集成:

- AWS S3
- Apache Airflow
- Apache Spark
- Mlflow
- GCS

以及更多!

如果您想查看我们的完整列表,请参阅我们的[集成示例](https://github.com/whylabs/whylogs/tree/mainline/python/examples/integrations)页面。

## 示例

有关我们示例的完整集合,请查看[示例文件夹](https://github.com/whylabs/whylogs/tree/mainline/python/examples)。

## whylogs 的基准测试

根据设计,whylogs 直接在数据管道中或在边车容器中运行,并使用高度可扩展的流式算法来计算统计数据。由于使用 whylogs 进行数据记录发生在处理原始数据的相同基础设施中,因此考虑计算开销很重要。对于大多数用例,开销是最小的,通常低于 1%。对于具有数千个特征和 10M+ QPS 的非常大的数据量,它可能会增加约 5% 的开销。然而,对于大数据量,客户通常处于分布式环境中,如 Ray 或 Apache Spark。这意味着他们受益于 whylogs 的并行化——以及 whylogs 配置文件的可映射可归约属性,将计算开销保持在最低水平。
以下是基准测试,以演示 whylogs 在使用默认配置(跟踪分布、缺失值、计数、基数和模式)处理表格数据时的效率。这种方法的两个重要优势是并行化加快了计算速度,并且 whylogs 随特征数量而不是行数而扩展。在[这里](https://docs.whylabs.ai/docs/scaling)了解更多关于 whylogs 如何扩展的信息。

| 数据量                       |       运行 whylogs 的总成本        |                   实例类型                    | 集群大小 |                                       处理时间 |
| ---------------------------- | :--------------------------------: | :-------------------------------------------: | -------: | ---------------------------------------------: |
| 10 GB ~34M 行 x 43 列        | ~ $ 0.026 每 10 GB,或 $2.45 每 TB | c5a.2xlarge,8 CPU 16GB RAM,每小时 $0.308 按需价格 |  2 个实例 | 每个实例 2.6 分钟配置时间(并行运行) |
| 10 GB,~34M 行 x 43 列       | ~ $0.016 每 10 GB,估计 $1.60 每 TB | c6g.2xlarge,8 CPU 16GB RAM,每小时 $0.272 按需价格 |  2 个实例 | 每个实例 1.7 分钟配置时间(并行运行) |
| 10 GB ~34M 行 x 43 列        |           ~ $ 0.045 每 10 GB            | c5a.2xlarge,8 CPU 16GB RAM,每小时 $0.308 按需价格 | 16 个实例 |  每个实例 33 秒配置时间(并行运行) |
| 80 GB,83M 行 x 119 列       |            ~ $0.139 每 80 GB            | c5a.2xlarge,8 CPU 16GB RAM,每小时 $0.308 按需价格 | 16 个实例 | 每个实例 1.7 分钟配置时间(并行运行) |
| 100 GB,290M 行 x 43 列      |           ~ $0.221 每 100 GB            | c5a.2xlarge,8 CPU 16GB RAM,每小时 $0.308 按需价格 | 16 个实例 | 每个实例 2.7 分钟配置时间(并行运行) |

## 使用统计<a name="whylogs-profiles" />

从 whylogs v1.0.0 开始,whylogs 默认收集有关用户环境的匿名信息。这些使用统计不包括有关用户或他们正在分析的数据的任何信息,仅包括用户运行 whylogs 的环境。

要了解更多关于 whylogs 收集的使用统计信息,请查看相关[文档](https://docs.whylabs.ai/docs/usage-statistics/)。

要关闭使用统计,只需将 `WHYLOGS_NO_ANALYTICS` 环境变量设置为 True,如下所示:

```python
import os
os.environ['WHYLOGS_NO_ANALYTICS']='True'

社区

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贡献

如何贡献

我们欢迎对whylogs的贡献。请查看我们的贡献指南开发指南以了解详情。

贡献者

使用contrib.rocks制作。

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