该资源列表汇集了单细胞数据分析的软件包和方法，包括RNA-seq、ATAC-seq等数据类型。涵盖质量控制、基因网络识别、细胞聚类、降维和轨迹推断等分析步骤。同时提供教程、工作流程、网络门户和相关文献链接。列表持续更新，为单细胞研究提供全面参考。