#药物发现
deepchem - 深度学习在药物发现、材料科学中的开源工具链
DeepChem深度学习药物发现材料科学量子化学Github开源项目
DeepChem是一个高质量的开源工具链,致力于推动深度学习在药物发现、材料科学、量子化学和生物学中的应用。支持Python 3.7至3.10,兼容TensorFlow、PyTorch、JAX等框架。用户可通过pip或conda安装,或使用Docker镜像。项目包含丰富的教程和实例,适合从新手到专家。社区活跃,提供Discord和讨论论坛,欢迎科学家、开发者和爱好者的参与。
Graphormer - 优化分子科学中的AI研究和应用
GraphormerAzure Quantum Elements分子建模药物发现材料科学Github开源项目
Graphormer是一个深度学习包,用于加速分子科学中的AI研究和应用,如材料发现和药物发现。它支持PyG、DGL、OGB和OCP的数据接口,并采用fairseq框架。提供PCQM4M和PCQM4Mv2的预训练模型,特别适合大规模分子建模任务。优化的预训练版本可在Azure Quantum Elements上使用。
misato-dataset - 大规模蛋白质-配体复合物数据集助力AI驱动的药物发现
MISATO药物发现蛋白质-配体复合物AI模型分子动力学Github开源项目
MISATO是一个专为结构化药物发现设计的机器学习数据集,包含高质量的蛋白质-配体复合物数据。数据集涵盖了19000多个配体的量子力学计算结果和16000多个蛋白质-配体结构的分子动力学模拟。MISATO旨在提高配体分子精确度、合理表示系统动力学,并促进创新AI药物发现模型的开发。研究人员可免费下载MISATO数据集,使用提供的PyTorch数据加载器进行AI训练和预测。
TDC - 人工智能助力药物研发的开源平台
TDC机器学习药物发现人工智能数据集Github开源项目
Therapeutics Data Commons (TDC) 是一个开源的人工智能平台,旨在促进药物发现和开发领域的技术创新。该平台提供多样化的AI任务、数据集和基准测试,覆盖从靶点识别到药物安全评估的全过程。TDC为研究人员提供便捷的数据加载工具和高效的数据处理功能,同时建立了透明的评估体系。这一开放科学倡议正在推动人工智能在治疗科学中的应用和验证,重塑药物研发流程。
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