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Graphormer

优化分子科学中的AI研究和应用

Graphormer是一个深度学习包,用于加速分子科学中的AI研究和应用,如材料发现和药物发现。它支持PyG、DGL、OGB和OCP的数据接口,并采用fairseq框架。提供PCQM4M和PCQM4Mv2的预训练模型,特别适合大规模分子建模任务。优化的预训练版本可在Azure Quantum Elements上使用。

Graphormer 项目介绍

项目概述

Graphormer 是一个深度学习软件包,专为分子建模任务而设计,帮助研究人员和开发者训练定制化的模型。其主要目标是加速人工智能在分子科学领域的研究和应用,涉及到材料发现、药物发现等领域。Graphormer 提供的预训练模型还可以通过 Azure Quantum Elements 独家获得,为用户提供更多的计算资源和优化模型。

Graphormer v2.0 亮点

  • Graphormer 支持 Open Catalyst Challenge 中使用的模型、代码和脚本。
  • 提供了 PCQM4M 和 PCQM4Mv2 上的预训练模型,未来会有更多预训练模型上线。
  • 支持 PyG、DGL、OGB 和 OCP 的接口和数据集。
  • 兼容 fairseq 框架。
  • 文档已上线,方便用户查阅。

最新动态

  • 2022年3月10日:上传了一份技术报告,改进了 PCQM4M 和 Open Catalyst Project 的基准测试。
  • 2021年12月22日:Graphormer v2.0 正式发布。
  • 2021年12月10日:Graphormer 在 Open Catalyst Challenge 中获胜,相关技术演讲可在线查看。
  • 2021年9月30日:Graphormer 被 NeurIPS 2021 接受。
  • 2021年6月16日:在 KDD CUP 2021 的 Open Graph Benchmark 大规模挑战中荣获量子预测项目的第一名。

快速开始

Graphormer 的主要文档可以通过 graphormer.readthedocs.io 获取。该文档提供了入门指南,包含如何训练新模型以及如何使用新的模型类型和任务扩展 Graphormer。

安装需求和方法

可以通过 Conda 进行安装,具体步骤如下:

bash install.sh

贡献和社区

Graphormer 项目欢迎贡献与建议。大多数贡献需要签署一个贡献者许可协议(CLA),以确认你有权利并同意授予我们使用你的贡献的权利。提交拉取请求时,CLA 机器人将自动判断是否需要你提供 CLA 并做相关标记。

商标声明

本项目可能包含有关项目、产品或服务的商标或标志。使用微软商标或标志须遵循微软的商标和品牌指南进行授权使用。本项目修改版本中使用的微软商标或标志不应造成混淆或暗示由微软赞助。使用第三方商标或标志需遵循相应的第三方政策。

Graphormer 是一个不断发展和完善的工具,为AI分子科学的研究和发展提供了强有力的支持。通过不断的版本更新和优化,Graphormer 致力于为用户提供高效、可靠的解决方案。

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