#材料科学

DeepChem学习资料汇总 - 开源深度学习工具链助力生命科学研究

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Matminer:材料科学数据挖掘的开源利器

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MAML: 一种强大的元学习算法

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DeepChem:深度学习在生命科学中的民主化工具

3 个月前
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相关项目
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deepchem

DeepChem是一个高质量的开源工具链,致力于推动深度学习在药物发现、材料科学、量子化学和生物学中的应用。支持Python 3.7至3.10,兼容TensorFlow、PyTorch、JAX等框架。用户可通过pip或conda安装,或使用Docker镜像。项目包含丰富的教程和实例,适合从新手到专家。社区活跃,提供Discord和讨论论坛,欢迎科学家、开发者和爱好者的参与。

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Graphormer

Graphormer是一个深度学习包,用于加速分子科学中的AI研究和应用,如材料发现和药物发现。它支持PyG、DGL、OGB和OCP的数据接口,并采用fairseq框架。提供PCQM4M和PCQM4Mv2的预训练模型,特别适合大规模分子建模任务。优化的预训练版本可在Azure Quantum Elements上使用。

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maml

maml是一个为材料科学机器学习设计的Python包,提供高级接口简化开发流程。它整合了scikit-learn和tensorflow等机器学习库,以及pymatgen和matminer等材料科学工具,实现特征提取和模型构建。maml支持多种局部环境特征,如双谱系数和Behler-Parrinello对称函数,并包含势能面建模、X射线吸收光谱预测等应用模块。

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matminer

matminer是一个面向材料科学领域的开源数据挖掘库。该项目支持Python 3.9+,提供数据集和特征提取工具,便于研究人员进行材料数据分析。matminer包含详细文档、示例仓库和支持论坛,涵盖数据检索、特征化和数据集管理功能。此外,项目还提供了相关工具如automatminer和matbench,进一步扩展了其在材料科学研究中的应用范围。作为开源项目,matminer鼓励用户在研究中引用相关论文,并提供了方便的citation()方法来获取引用信息,体现了其学术价值和在材料科学社区中的影响力。

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matscibert

MatSciBERT是应用于材料科学领域的预训练语言模型,旨在提高文本挖掘与信息提取的效果。该模型基于BERT技术,在合金、玻璃、金属玻璃等类型的材料科学文献上训练,资料来源于ScienceDirect。研究人员可以从GitHub获取相关代码,用以在科研过程中实现更精确的信息抽取和深入分析。

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