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SLANTbrainSeg

全脑高分辨率MRI深度学习分割工具

SLANTbrainSeg是一款开源的全脑高分辨率MRI分割工具,采用人工智能深度学习技术。它可将T1 MRI扫描分割为133个标签,符合BrainCOLOR协议。项目提供Docker镜像,支持GPU和CPU,操作简便。SLANTbrainSeg在分割精度和效率上表现出色,适用于神经影像研究和临床分析。

Streamline-Analyst - AI数据分析工具,自动化处理全流程数据
GithubStreamline Analyst开源项目数据分析数据可视化模型选择自动化工作流程
Streamline Analyst 是一个基于大型语言模型的开源数据分析应用,旨在提高数据分析效率。它自动执行数据清洗、预处理和其他复杂任务,如识别目标对象、划分测试集以及选择最佳模型。用户只需进行简单的操作,即可快速得到高质量的视觉化结果和模型。此工具确保数据隐私和安全,同时未来将增加自然语言处理、神经网络和对象检测等更多高级功能。
segmentation_models.pytorch - 基于PyTorch的神经网络图像分割库
GithubPyTorch图像分割开源项目神经网络编码器预训练模型
segmentation_models.pytorch 是一个基于 PyTorch 的图像分割库,提供9种分割模型架构和124种编码器。该库 API 简洁,支持预训练权重,并包含常用评估指标和损失函数。它适用于研究和实际应用中的各种图像分割任务,是图像分割领域的实用工具。
UCTransNet - 融合U-Net与Transformer的医学图像分割网络
GithubTransformerU-NetUCTransNet医学图像分割开源项目深度学习
UCTransNet是一种结合U-Net和Transformer优势的医学图像分割网络。它通过Channel Transformer模块替代U-Net的跳跃连接,从通道维度优化特征融合。该模型在GlaS和MoNuSeg等数据集上表现优异,为医学影像分析提供新思路。项目开源代码实现和预训练模型,并提供详细使用说明,方便研究者探索和应用。
INSIGHT - 医学研究领域的智能AI助手
AIGithubINSIGHTPubMed任务列表医疗研究开源项目
INSIGHT是一款用于医学研究的自主AI。它通过主控代理生成任务列表,工作代理负责完成任务并将结果保存到llama索引中。主控代理会根据结果调整任务优先级。INSIGHT还支持调用PubMed和MyGene APIs,并能够加载和续运行数据文件。用户可通过talk_to_index.py与数据库互动,提出数据相关问题。系统操作简便,只需配置OpenAI API密钥并安装依赖即可运行。
HistoSSLscaling - 病理组织图像自监督学习新方法
GithubPhikonViT开源项目掩码图像建模组织病理学自监督学习
HistoSSLscaling项目开发了基于掩码图像建模的自监督学习方法,用于病理组织图像分析。该项目的Phikon模型在4000万张全癌种病理切片上预训练,在多项下游任务中表现出色。项目提供了预训练模型、代码和数据集特征,为计算病理学研究提供支持。
sd-webui-segment-anything - 对任何内容进行分段以获得稳定的扩散 WebUI
ControlNetGithubGroundingDINOSAM-HQStable Diffusion WebUIsegment anything开源项目
此扩展结合了Stable Diffusion WebUI、ControlNet扩展,以及Segment Anything和GroundingDINO等高级分割模型,提升了图像修复、语义分割和LoRA/LyCORIS训练集创建功能。支持自动图像抠图及API的全面重构,单张图像处理和自动生成分割掩码更加便捷。最新版本增强了多个分割模型的支持,并优化了CPU和GPU的运行性能。
Awesome-Diffusion-Models-in-Medical-Imaging - 汇总医疗影像中扩散模型的前沿研究与应用
Anomaly DetectionDiffusion ModelsGithubMedical ImagingSegmentationSurvey Papers开源项目
本页面汇集了关于医疗影像扩散模型的精彩文章,包括综合调查、挑战报告以及多种应用领域的最新研究成果。这里汇集了关于异常检测、去噪、分割、图像生成和文本到图像转换等方面的详尽文献。这些内容展示了扩散模型在医学图像分析中的重要性,还覆盖了在皮肤病变分割、脑图像异常检测等具体应用中的最新进展。欢迎社区参与和贡献,共同推动这一领域的发展。
dipy - 开源MR扩散成像分析Python库
DIPYGithubMRI分析Python库开源项目扩散成像神经影像学
DIPY(Diffusion Imaging in Python)是一个开源的Python库,专门用于分析MR扩散成像。该库提供了丰富的工具和算法,用于处理和分析扩散MRI数据,包括多种扩散模型、纤维追踪方法和可视化技术。DIPY遵循科学Python规范,主要面向研究领域。它支持通过pip或conda安装,并提供详细的文档。DIPY采用BSD许可证,欢迎社区贡献。
MagNet - 多尺度语义分割框架提升图像精度
GithubMagNet卷积神经网络多尺度框架开源项目语义分割高分辨率数据集
MagNet是一种多尺度语义分割框架,采用多阶段处理方法解决高分辨率图像中的局部歧义问题。每个处理阶段对应一个放大级别,实现从粗到细的信息传播。在城市景观、航拍场景和医学图像等高分辨率数据集上的实验显示,MagNet的性能显著超越现有方法,为高分辨率图像的精确语义分割提供了新的技术方案。
AlizaMS - 多功能DICOM查看器 为医学影像分析提供全面支持
3D渲染DICOMGithub医学影像去识别化多平面重建开源项目
AlizaMS是一款功能全面的DICOM查看器,集成2D和3D视图、体积渲染和多平面重建等核心功能。它具备快速目录扫描和DICOMDIR文件处理能力,同时保证DICOM数据的一致性匿名化。该软件支持RTSTRUCT轮廓显示、多视图研究和超声校准区域精确测量。AlizaMS还提供2D+t和3D+t动画效果,内置DICOM元数据查看器和2024b字典。软件兼容多数IOD类型,包括结构化报告和灰度软拷贝呈现状态。
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