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FragPipe

综合性质谱蛋白质组学数据分析平台

FragPipe是一个综合性质谱蛋白质组学数据分析平台。该平台集成MSFragger搜索引擎和Philosopher工具包等多个模块,支持传统和开放搜索、翻译后修饰分析、定量分析等功能。FragPipe提供图形界面和命令行操作,可在Windows、Linux或云端环境运行。平台支持DDA和DIA数据分析,包括标记和非标记定量方法,为蛋白质组学研究提供全面解决方案。

MAPE-PPI - 基于微环境感知的蛋白质相互作用预测新方法
GithubMAPE-PPI开源项目微环境感知深度学习蛋白质嵌入蛋白质相互作用预测
MAPE-PPI项目开发了一种基于微环境感知蛋白质嵌入的方法,用于预测蛋白质-蛋白质相互作用。该方法在多个数据集上进行了测试,显示出良好的性能。项目提供预训练模型和使用指南,涵盖环境设置、数据处理和模型训练等内容,便于研究人员复现和拓展。这一新方法为蛋白质相互作用预测研究提供了创新思路。
Fast Data Analysis - 智能数据分析与可视化平台
AI助手AI工具协作可视化数据分析数据清理
Fast Data Analysis是一款革新性的AI驱动数据处理方案。通过GPT等先进机器学习技术,用户可在浏览器中通过自然语言对话轻松完成数据清理、分析和可视化,无需编程知识。平台支持线性回归、决策树等高级统计分析,并配备直观的数据编辑界面。具备多人协作功能,兼容多种数据格式,同时严格保障数据隐私。Fast Data Analysis致力于加速数据洞察获取,显著提升分析效率,适合各类数据处理需求,是数据分析领域的智能革命者。
foldcomp - 高效压缩和索引大规模蛋白质结构数据集的开源工具
FoldcompGithub开源项目数据存储氨基酸编码生物信息学蛋白质结构压缩
Foldcomp是一个开源的蛋白质结构压缩和索引工具。通过编码主链和侧链的扭转角,它将每个氨基酸残基压缩至13字节,大幅降低存储需求。Foldcomp支持单链PDB文件压缩,提供命令行和Python API接口,可进行压缩、解压缩、序列提取等操作。此外,Foldcomp还提供了多个预构建的大规模蛋白质结构数据库,如AlphaFoldDB和ESMAtlas,便于研究人员使用。
PubCompare - 实验协议智能搜索与分析系统
AI工具PubCompare实验协议文献比较研究方法科研工具
PubCompare整合了超过4000万个实验协议的数据库和搜索功能。通过人工智能技术,该平台能快速对比和评估协议的相关性及引用情况。系统提供智能注释、关键步骤分析和可重复性评估等功能,有助于降低实验失败率,提升研究效率。PubCompare为研究人员提供丰富的协议资源和分析工具,支持制定更为可靠的实验方案。
alphaflow - 蛋白质构象集生成的流匹配模型
AlphaFlowAlphaFoldGithub分子动力学开源项目生成建模蛋白质构象集
AlphaFlow是基于AlphaFold的改进版本,通过流匹配目标微调,专门生成蛋白质构象集合。它模拟实验和分子动力学集合,提供完整代码、说明和模型权重。项目还包括ESMFold的微调版本ESMFlow。这些工具有助于研究蛋白质结构多样性和动态特性,为蛋白质科学研究提供新的方法和视角。
ByProt - 先进的蛋白质序列设计工具包
AI建模ByProtGithub反向折叠开源项目机器学习蛋白质设计
ByProt是一个专注于蛋白质研究中生成学习的多功能工具包。它主要用于基于结构的序列设计,提供高效的非自回归ProteinMPNN变体和LM-Design的官方实现。LM-Design作为ICML 2023口头报告的成果,是当前最先进的蛋白质序列设计模型。该工具包支持CATH和多链数据集的训练与评估,为研究人员提供灵活的蛋白质设计方案。
screen-pipe - 全天候屏幕和音频捕捉,支持个性化AI开发
AGI HouseGithubOllamaRewind.aiRustScreenpipe开源项目
Screenpipe提供全天候屏幕和音频捕捉,支持Ollama,开放且安全,用户完全掌控数据。该项目采用Rust开发,兼容MacOS、Windows和Linux,提供CLI和桌面应用。支持多种语音识别和OCR引擎,为开发者提供强大的工具和API接口。适用于搜索、自动化、分析和个人助手等应用场景,旨在简化开发者工作流程,提高效率。
pipcook - 将JavaScript和机器学习无缝结合的前端工程框架
GithubJavaScriptPipcook前端开源开源项目机器学习
Pipcook是一个面向JavaScript工程师的开源机器学习应用框架,支持前端与机器学习的无缝集成。该框架具备模块化设计,灵活易用,包含机器学习流水线框架、管理工具及JavaScript运行时环境,并通过插件机制支持数据集处理、模型训练、验证和部署。适用于Web工程师学习、训练和优化机器学习模型,通过简便的命令行工具和示例,引导用户快速上手和部署机器学习应用。
dataplane - 高效灵活的开源数据管道构建平台
DataplaneDockerGithubGolang工作流程开源项目数据管道
Dataplane是一款开源的高性能数据管道构建平台。该项目采用Golang开发,具有拖拽式界面、Python编辑器、权限管理等功能。它支持多时区调度、分布式计算和资源监控,适合不同规模的团队使用。Dataplane注重性能、可扩展性和安全性,能有效简化数据处理和自动化工作流程。
mag - 宏基因组数据分析的综合生物信息学流程
Githubnf-core/mag分箱宏基因组开源项目注释组装
nf-core/mag是一个用于宏基因组分析的综合生物信息学流程。该流程支持短读和长读数据,涵盖从质量控制到功能注释的完整分析过程。其模块化设计允许灵活配置多种工具,适应不同类型的宏基因组研究需求。流程还集成了质量评估和可视化报告功能,便于研究人员评估分析结果。nf-core/mag流程整合了多种先进工具,实现宏基因组数据的高效处理。它能够执行reads分类、基因组组装、基因预测、分箱和分类等关键步骤。流程的设计考虑了不同研究需求,支持古DNA分析等特殊应用。通过提供标准化的分析流程,nf-core/mag有助于提高宏基因组研究的可重复性和可比性。
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豆包MarsCode

豆包 MarsCode 是一款革命性的编程助手,通过AI技术提供代码补全、单测生成、代码解释和智能问答等功能,支持100+编程语言,与主流编辑器无缝集成,显著提升开发效率和代码质量。

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白日梦AI提供专注于AI视频生成的多样化功能,包括文生视频、动态画面和形象生成等,帮助用户快速上手,创造专业级内容。

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讯飞绘镜是一个支持从创意到完整视频创作的智能平台,用户可以快速生成视频素材并创作独特的音乐视频和故事。平台提供多样化的主题和精选作品,帮助用户探索创意灵感。

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讯飞文书依托讯飞星火大模型,为文书写作者提供从素材筹备到稿件撰写及审稿的全程支持。通过录音智记和以稿写稿等功能,满足事务性工作的高频需求,帮助撰稿人节省精力,提高效率,优化工作与生活。

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绘蛙是阿里巴巴集团推出的革命性AI电商营销平台。利用尖端人工智能技术,为商家提供一键生成商品图和营销文案的服务,显著提升内容创作效率和营销效果。适用于淘宝、天猫等电商平台,让商品第一时间被种草。

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AIWritePaper论文写作是一站式AI论文写作辅助工具,简化了选题、文献检索至论文撰写的整个过程。通过简单设定,平台可快速生成高质量论文大纲和全文,配合图表、参考文献等一应俱全,同时提供开题报告和答辩PPT等增值服务,保障数据安全,有效提升写作效率和论文质量。

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