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基于PubMed和MIMIC-III数据的BlueBERT医学自然语言处理模型

BlueBERT是一个经过PubMed文献摘要和MIMIC-III临床笔记预训练的BERT模型,适用于医学自然语言处理。它使用NLTK进行文本预处理,提高了对医学文本的理解能力,是临床研究和医学信息检索的有效工具。

compact-biobert - 压缩优化的生物医学BERT模型
CompactBioBERTGithubHuggingface开源项目模型模型蒸馏深度学习生物医学自然语言处理
CompactBioBERT是BioBERT的压缩版本,通过结合DistilBioBERT和TinyBioBERT的蒸馏技术,在PubMed数据集上训练而成。该模型采用6层transformer结构,隐藏层和嵌入层维度为768,总参数约6500万。CompactBioBERT在保持生物医学自然语言处理性能的同时,有效缩小了模型规模,提升了计算效率。
TinySapBERT-from-TinyPubMedBERT-v1.0 - 微型生物医学实体表示模型TinySapBERT
GithubHuggingfaceKAZU框架TinyPubMedBERTTinySapBERT开源项目模型生物医学实体表示语言模型
TinySapBERT是一个微型生物医学实体表示模型,基于TinyPubMedBERT和SapBERT方法开发。作为KAZU框架的组成部分,它为生物医学命名实体识别提供高效解决方案。该模型旨在提升生物医学文本分析任务的性能,为研究人员提供有力工具。
deid_roberta_i2b2 - RoBERTa模型用于医疗记录去标识化
GithubHIPAAHuggingfaceI2B2RoBERTa医疗记录去标识化开源项目模型自然语言处理
这是一个基于RoBERTa的序列标注模型,专门用于医疗记录去标识化。模型能识别11种受保护健康信息类型,采用BILOU标记方案。在I2B2 2014数据集上训练后,可自动从医疗记录中移除敏感信息。项目提供了使用说明、数据格式要求和示例代码,便于快速应用。
BiomedVLP-CXR-BERT-specialized - 胸部X光领域专用语言模型 优化生物医学视觉语言处理
CXR-BERTGithubHuggingface医疗影像多模态学习开源项目模型胸部X光自然语言处理
BiomedVLP-CXR-BERT-specialized是专为胸部X光领域开发的语言模型。通过优化词汇表、创新预训练方法、权重正则化和文本增强技术,该模型在放射学自然语言推理和掩码语言模型预测等任务中表现优异。它还能应用于零样本短语定位和图像分类等视觉-语言处理任务。此外,该模型与ResNet-50图像模型联合训练,可用于短语定位。作为生物医学视觉-语言处理研究的重要工具,BiomedVLP-CXR-BERT-specialized为相关领域提供了新的可能性。
BioBERT-mnli-snli-scinli-scitail-mednli-stsb - 基于BioBERT的多领域句子嵌入模型
BioBERTGithubHuggingfacesentence-transformers嵌入向量开源项目模型自然语言处理语义相似度
该项目是一个基于BioBERT的句子嵌入模型,通过多个领域数据集训练而成。模型能将文本映射至768维向量空间,适用于聚类和语义搜索等任务。它不仅在生物医学领域表现出色,还可应用于其他文本分析场景。模型支持sentence-transformers和HuggingFace Transformers两种调用方式,为用户提供了便捷的使用体验。
BERTweet - 专为英语推文预训练的大规模语言模型,助力自然语言处理
BERTweetCOVID-19GithubRoBERTa开源项目英文推文语言模型
BERTweet是首个专为英语推文预训练的公共语言模型,基于RoBERTa预训练程序,使用850M条推文数据进行训练,包含普通推文和疫情相关推文。BERTweet提供多种预训练模型,能够无缝集成于transformers和fairseq框架,支持情感分析、命名实体识别等自然语言处理任务,为研究和应用提供有力支持。
biogpt - 生物医学领域的预训练生成式语言模型
BioGPTGithubHuggingface开源项目文本生成模型生物医学自然语言处理预训练模型
BioGPT是一种针对生物医学领域的预训练生成式语言模型。该模型在大规模生物医学文献上训练,在多项自然语言处理任务中表现出色,尤其在关系抽取和问答任务上取得了显著成果。除了擅长分类任务外,BioGPT还具备强大的文本生成能力,能为生物医学术语提供流畅的描述。这些特性使得BioGPT在生物医学领域有广泛的应用前景。
Medical_NLP - 医疗行业自然语言处理资源汇总,包括评测、数据集和预训练模型
GithubMedical_NLP中文医疗基准测评开源项目开源预训练模型数据集评测
本页面汇总了最新的医疗自然语言处理资源,涵盖基准评测、比赛信息、多语言数据集、开源预训练模型、学术论文和工具包等内容。为研究人员和开发者提供一站式资源支持,以提升医疗NLP领域的研究深度和应用效果。
awesome-bioie - 免费工具和方法助力提取非结构化生物医学数据中的信息
BERTBioIEGithubLLMs开源项目生物医学数据自然语言处理
这个开源项目提供了一系列无需付费且许可要求低的资源,旨在从非结构化生物医学数据和文本中提取结构化信息。随着语言模型如BERT和GPT-4的引入,生物信息提取方法得到了显著优化。项目涵盖多个方面,包括研究概述、活跃群组、工具和数据集,所有资源均公开且积极维护。
MedCPT-Cross-Encoder - 基于PubMed数据的医学文献智能排序模型
GithubHuggingfaceMedCPT-Cross-Encoder医学信息检索开源项目文本排序模型深度学习自然语言处理
MedCPT-Cross-Encoder是一款专注于医学文献检索的跨编码器模型。该模型利用PubMed搜索日志进行预训练,能够根据查询对文章进行智能排序,为生物医学领域提供高效的信息检索服务。由美国国立卫生研究院开发的MedCPT-Cross-Encoder在零样本生物医学信息检索任务中表现出色,为研究人员和医疗专业人士提供了强大的文献筛选工具。
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