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基于PubMed和MIMIC-III数据的BlueBERT医学自然语言处理模型

BlueBERT是一个经过PubMed文献摘要和MIMIC-III临床笔记预训练的BERT模型,适用于医学自然语言处理。它使用NLTK进行文本预处理,提高了对医学文本的理解能力,是临床研究和医学信息检索的有效工具。

ClinicalNER - 多语言临床命名实体识别模型 提取医疗文本中的药物和用药信息
GithubHuggingfaceMedNERFXLM-R临床命名实体识别医疗文本分析多语言模型开源项目模型
ClinicalNER是一个基于XLM-R Base的多语言临床命名实体识别模型,通过英语n2c2数据集微调。该模型能从医疗文本中提取药物、剂量、频率、持续时间、用量和剂型等实体信息。在法语评估测试集MedNERF上,ClinicalNER展现了优异的零样本跨语言迁移能力,micro-F1分数达0.804。支持英、法、德、西、意等多种语言,ClinicalNER为临床文本分析提供了实用的工具。
bertweet-large - 大规模英语推文预训练模型,面向社交媒体文本
BERTweetCOVID-19English TweetsGithubHuggingface开源项目模型语言模型预训练
BERTweet是首个面向英语推文的大规模预训练模型,基于RoBERTa程序开发,语料库包含2012至2019年间的8.45亿条推文及500万条涉及COVID-19的推文。在任务性能上,BERTweet在词性标注、命名实体识别、情感分析以及讽刺检测等方面表现出色,是分析推文内容的有效工具。
MedCPT-Article-Encoder - 生物医学文章嵌入模型
GithubHuggingfaceMedCPTPubMed信息检索开源项目模型生物医学文本嵌入语义搜索
MedCPT-Article-Encoder是一个生物医学文章嵌入模型,通过255M对查询-文章数据预训练而成。该模型能有效捕捉生物医学文本的语义信息,适用于文章搜索、聚类等任务。在多个零样本生物医学信息检索数据集上,MedCPT-Article-Encoder展现了出色的性能。这一工具可帮助研究人员和开发者提高生物医学文献的检索和分析效率。
prot_bert - BERT蛋白质序列模型助力破解生命密码
GithubHuggingfaceProtBert开源项目掩码语言建模模型氨基酸序列生物信息学蛋白质语言模型
ProtBert是一种基于BERT架构的蛋白质序列预训练语言模型,在2.17亿个蛋白质序列上进行自监督学习。该模型能捕获序列中的关键生物物理特性,可用于蛋白质特征提取或下游任务微调。在二级结构预测和亚细胞定位等任务中表现优异,为解析蛋白质功能提供新工具。ProtBert展现了人工智能在生命科学领域的应用潜力。
BioMistral-7B - 多语言开源生物医学语言模型评估
BioMistralGithubHuggingface医学多语言开源开源项目模型量化
BioMistral是专为生物医学设计的开源大型语言模型,基于Mistral,经PubMed Central数据进一步训练,表现出色于多语言医学问答评估。其轻量化模型可通过量化和模型合并提升竞争力,为医学领域首次进行跨语言大规模评估。所有模型、评估基准和脚本免费开放供研究使用,建议避免在临床或专业医疗环境中应用,因存在潜在风险和偏见。
biomedical - 生物医学数据集库促进机器学习研究
BigBIOGithub开源项目数据标准化机器学习生物医学数据集自然语言处理
BigBIO是一个基于Huggingface datasets库开发的生物医学数据加载器库。该项目提供超过126个生物医学数据集的轻量级访问,覆盖10余种语言和12个任务类别。BigBIO致力于提高数据处理的可重复性,完善数据集来源和许可等属性的文档,并简化自然语言提示和多任务学习的元数据集生成。此外,BigBIO还支持多个主流英语生物医学基准测试中的大部分数据集。
scibert_scivocab_uncased - 为科学文本优化的预训练BERT语言模型
GithubHuggingfaceSciBERT开源项目模型科学文本自然语言处理语言模型预训练模型
SciBERT是一个专门针对科学文本的预训练语言模型。该模型基于114万篇科学论文全文训练,包含31亿个标记。SciBERT采用自定义科学词汇表,提供大小写敏感和不敏感两种版本。这个模型在科学文本处理任务中表现优异,是科研工作者的有力工具。研究人员可根据具体需求选择合适的模型版本,从而提高科学文本相关的自然语言处理任务效果。
Awesome-Medical-Large-Language-Models - 医疗大语言模型前沿进展汇总
AI医疗Github人工智能医疗大语言模型开源项目生物医学AI自然语言处理
项目汇总医疗健康领域最新大型语言模型,涵盖谷歌、DeepMind、哈佛等机构的Med-Gemini、AMIE、Meditron等模型。提供模型信息、代码链接和引用数据,为医疗AI研究提供重要参考。研究人员和开发者可借此了解医疗AI最新发展动态。
BioLORD-2023-M - 生物医学句子相似度模型,覆盖多种语言
BioLORDGithubHuggingface临床对比学习开源项目本体论模型语义表示
该项目利用BioLORD预训练策略,提升临床句子与生物医学概念的语义表示。通过多关系知识图谱中的定义和描述,实现概念表示的语义化与层次匹配。模型在临床句子和生物医学概念的相似度上表现卓越,支持七种欧洲语言。
ZeroShotBioNER - 高效生物医学命名实体识别的突破性方法
BERTGithubHuggingface命名实体识别少样本学习开源项目模型生物医学文本识别零样本学习
ZeroShotBioNER是一种创新的生物医学命名实体识别模型,基于Transformer架构,支持零样本和少样本学习。该模型在25多个生物医学NER类别上训练,可识别疾病、化学物质、基因等多种实体。其突出优势在于能进行零样本推理,并仅需少量样本即可针对新类别进行微调。模型采用BioBERT架构,提供详细的使用说明和丰富的实体类别列表,为生物医学文本分析提供了强大工具。
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豆包MarsCode

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