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datamol

基于RDKit的高效分子处理Python库

datamol是一个基于RDKit的Python库,专为简化分子处理而设计。它提供简洁的API、高效的并行处理和现代IO支持,同时保持与RDKit的兼容性。通过良好的默认设置,datamol简化了分子标准化、构象生成和特征计算等任务,使分子操作更加便捷高效。该库支持远程路径读写多种格式文件,适用于大规模数据处理。datamol的设计理念是在RDKit基础上提供更简单的接口,同时保持性能和灵活性,使其成为分子信息学研究和开发的有力工具。

api - Materials Project API 材料科学数据访问工具
APIGithubMaterials ProjectPython开发环境开源项目数据下载
Materials Project API是一个面向材料科学研究的开源工具,提供了访问Materials Project数据库的核心客户端实现。支持Python 3.9+,此API使用户能够高效地查询和下载大规模材料数据。项目提供详细文档,指导开发者如何使用API获取最新的材料数据。该工具旨在为材料科学研究提供数据支持,促进相关领域的创新和发展。
OpenMDAO - 开源Python系统分析与多学科优化计算平台
GithubOpenMDAOPython多学科优化开源项目系统分析高性能计算
OpenMDAO是一个用Python开发的开源高性能计算平台,专门用于系统分析和多学科优化。它支持模型分解,便于构建和维护,同时通过高效并行算法实现紧密耦合求解。平台主要支持基于梯度的优化和解析导数,可处理大规模设计空间。此外,OpenMDAO还提供并行计算功能,适用于无梯度优化、混合整数非线性规划和设计空间探索。
dlt - 简化数据加载流程的Python库
GithubPython库dlt开源开源项目数据加载数据管道
dlt是一个开源Python库,旨在简化数据加载过程。它具备自动模式生成、数据规范化和增量加载功能,可集成到多种环境中。支持从快速数据探索到复杂生产环境的应用,并提供多种验证源和目标。dlt的灵活性和可扩展性使其能够有效处理不断增长的数据需求,适合各类数据处理任务。
pygmo2 - 大规模并行优化Python库
GithubPython库pygmo优化算法并行计算开源项目科学计算
pygmo是一个开源的、用于大规模并行优化的科学Python库。它围绕提供优化算法和优化问题的统一接口而构建,使其易于在大规模并行环境中部署。该库支持多目标优化和多种优化算法,能够高效处理复杂的优化问题和大规模数据。pygmo提供了全面的文档和教程,适用于研究、教学以及各种实际应用场景。其强大的功能和灵活性使其成为解决复杂优化挑战的理想工具。
modin - 轻松实现pandas并行化加速
GithubModinpandas大数据并行计算开源项目数据处理
Modin是pandas的高性能替代方案,通过并行化计算显著提升数据处理速度。只需更改一行导入代码,即可利用全部CPU核心加速pandas工作流,特别适合大型数据集。Modin支持处理超出内存的数据,兼容90%以上pandas API,并支持Ray、Dask和MPI等多种计算引擎。它简化了分布式计算,让用户轻松获得性能提升。
datumaro - 综合数据集管理与转换工具
Dataset Management FrameworkDatumaroGithub开源项目数据集质量检查数据集转换模型集成
Datumaro是一个全面的数据集管理工具,支持多种数据格式的读取、写入及转换,并提供注释处理和数据过滤功能。该工具还能进行数据集质量检查、模型推理、数据集比较及统计,协助用户有效进行数据集合并、拆分和采样,并与OpenVINO等模型集成。一览详细功能及使用指南,请参阅官方文档。
datatrove - 用于大规模文本数据处理和去重的开源Python库
DataTroveGithub大规模开源项目数据处理文本去重管道
DataTrove是一个开源Python库,专门用于处理、过滤和去重大规模文本数据。它提供预构建的常用处理模块和自定义功能支持。该库的处理流程可在本地或Slurm集群上运行,具有低内存消耗和多步骤设计,适合处理大型语言模型训练数据等大规模工作负载。DataTrove支持多种文件系统,为数据处理提供灵活解决方案。
tomotopy - 最优性能的Python主题模型库
GithubLDA模型Python扩展SIMD指令集tomotopy主题建模开源项目
该库支持多种主题模型,利用现代CPU的向量化技术提升速度,提供直观的交互视图和高性能并行算法。可轻松通过pip安装,兼容Windows、macOS和Linux,适用于大规模文本数据处理。
litdata - 优化数据处理和流式传输工具 提升AI模型训练效率
GithubLitData云存储开源项目数据优化数据处理模型训练
LitData是一个开源的数据处理和优化工具,专注于提升AI模型训练效率。它提供并行数据处理、向量嵌入创建、分布式推理和大规模网站抓取功能。LitData优化数据集以加速模型训练,支持云端大规模数据流式传输,并实现远程数据的无本地加载使用。这些特性使LitData成为提高数据处理效率和AI模型训练速度的有力工具。
rf_diffusion_all_atom - 全原子精度蛋白质结构生成工具
GithubRFDiffusion AA分子对接开源项目机器学习结构生物学蛋白质设计
rf_diffusion_all_atom是一个基于AI的蛋白质结构生成工具,实现全原子精度的模型设计。该工具支持小分子结合蛋白和包含特定基序的蛋白质设计,提供简单的安装步骤和使用指南。rf_diffusion_all_atom能够生成自定义蛋白质结构,适用于药物发现和蛋白质工程等研究领域。
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