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evo

实现跨尺度DNA序列建模与设计的开源工具

Evo生物基础模型DNA建模基因组尺度序列设计Github开源项目

Evo是一个开源的生物基础模型，专注于DNA序列的长上下文建模和设计。基于StripedHyena架构，Evo实现了单核苷酸级别的序列建模，具有近乎线性的计算和内存扩展性。该模型拥有70亿参数，在OpenGenome数据集上训练，包含约3000亿个原核全基因组标记。Evo提供8K和131K上下文长度的预训练模型，适用于从分子到基因组尺度的序列分析和生成任务。研究人员可通过HuggingFace和Together API等多种方式使用Evo，为DNA序列研究提供了强大而灵活的工具。

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介绍相关项目
EwolveAI - 综合AI工具平台助力提升生产力
AI图像生成AI工具AI生成器AI聊天机器人人工智能写作语音转文字
EwolveAI是一个综合性AI工具平台，提供文本、图像、代码和聊天等多种生成功能。平台具备先进仪表板、多语言支持和自定义模板等特性，支持快速创建高质量内容。EwolveAI还集成了支付网关和客户支持系统，适用于数字营销、设计和开发等领域的专业人士。作为全方位AI解决方案，EwolveAI旨在提升用户的工作效率和生产力。
BracingEvoMix - BracingEvoMix_v2模型提升了图像输出细节，满足SDXL与SD1.x的技术要求
BracingEvoMixGithubHuggingface商用利用图像生成开源项目模型模型更新许可证
BracingEvoMix_v2模型发布于2023年10月1日，通过优化实现了更高的图像生成质量和细节。其在自然语言响应、高质量亚洲面部生成以及光影处理上有显著提升，对手指细节、色彩稳定性和情感表达的多样性提出了新的标准，适用于商用图像生成服务。尽管当前系列将暂停更新，开发者仍可能依据用户需求和SDXL的演化继续研发新系列。用户应遵循CreativeML Open RAIL-M许可协议，确保合规使用。
EvalAI - 专为机器学习与人工智能算法评估和比较设计的平台
EvalAIGithub人工智能开源平台开源项目机器学习算法比较
EvalAI是一个开源平台，用于评估和比较机器学习及AI算法，提供中心化排行榜和提交界面，支持自定义评估协议和多语言环境，可适应高需求的计算挑战，助力研究者复现研究结果，进行准确可靠的分析。
sharpneat - 基于NEAT算法的神经网络进化框架
C#GithubNEATSharpNEAT开源项目神经网络进化算法
SharpNEAT是一个基于C#的NEAT算法实现，专为.NET 8设计。这个进化算法框架致力于通过神经网络进化解决复杂问题。其模块化架构有利于进化计算研究，同时优化网络结构和连接权重，为探索神经进化潜力提供了有力支持。
evalplus - 提升大语言模型代码生成评估的框架
EvalPlusGithubHumanEval+LLM评估MBPP+代码生成开源项目
EvalPlus是一个开源框架,旨在严格评估大语言模型的代码生成能力。它包含HumanEval+和MBPP+两个增强数据集,测试用例数量大幅提升。该框架提供精确评估、代码严谨性检验、LLM生成样本等功能,可显著加速相关研究。EvalPlus支持代码生成、后处理和评估全流程,在GitHub开源并提供Docker镜像,便于研究人员使用。
deepeval - 简化LLM输出评估的开源框架
AI测试DeepEvalGithubLLM评估开源框架开源项目指标评估
DeepEval是一款开源的大型语言模型(LLM)输出评估框架。它提供G-Eval、幻觉检测和答案相关性等多种评估指标，支持本地运行。该框架适用于RAG和微调应用，可与LangChain和LlamaIndex等工具集成。DeepEval具备批量评估、自定义指标创建功能，易于集成到CI/CD环境。此外，它还支持对主流LLM基准进行简易评估，并可与Confident AI平台对接，实现持续评估和结果分析。
shorelark - 神经网络与遗传算法驱动的生物进化模拟器
GithubShorelarkWebAssembly开源项目神经网络进化模拟遗传算法
Shorelark是一个结合神经网络、遗传算法和高中数学知识的进化模拟项目。通过可视化界面，它展示了生物进化的过程，使观察者能直观理解进化机制。项目提供了实现教程，适合对人工智能和进化理论感兴趣的开发者与学习者。Shorelark支持多种构建方式，如Cargo和npm，以及Nix，便于不同背景的用户使用。
vsearch - 开源高性能生物序列分析软件
GithubVSEARCH去冗余序列比对开源项目生物信息学聚类分析
VSEARCH是一款开源的生物序列分析软件,支持去冗余、聚类和嵌合体检测等功能。它利用SIMD矢量化和多线程并行技术,可处理大型数据库。VSEARCH采用全局最优比对算法,精度高于USEARCH。软件支持多种CPU架构和操作系统,可读取压缩文件,是USEARCH的免费开源替代方案。此外,VSEARCH还支持全长和前缀去冗余、重复、反向互补、掩蔽、全局比对搜索等功能。可用于FASTQ文件分析、过滤、转换和合并配对末端读取。
exo - 家用设备组建分布式AI集群 实现高性能计算
AI集群Githubexo分布式推理开源项目模型分区设备发现
exo是一个开源项目，用于将日常设备如智能手机、平板和个人电脑整合成家庭AI集群。该项目支持多种模型，包括Llama 3.1，具备动态模型分区和自动设备发现功能。exo采用点对点连接架构，实现设备间平等协作，无需专业GPU即可运行大型AI模型。此外，exo还提供ChatGPT兼容的API接口。
biocypher - 生命科学知识图谱构建和管理工具
BioCypherGithub开源软件开源项目数据集成生物信息学知识图谱
BioCypher是一款专为生命科学领域设计的知识图谱工具，旨在简化创建和维护过程。它提供了灵活的数据存储、集成和推理功能，支持复杂数据的探索和分析。BioCypher可应用于人工智能研究，并具有用户友好的界面。该工具提供全面的文档和教程，帮助研究人员轻松构建和管理知识图谱。作为开源项目，BioCypher不断发展，为生物医学研究提供有力支持。
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