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ComplexHeatmap

R语言复杂热图包 实现多维数据可视化与灵活注释

ComplexHeatmap是一个用于创建复杂热图的R软件包,提供灵活的多热图排列和多样化注释功能。该工具可视化不同数据集间的关联并揭示潜在模式,支持单热图、带注释热图、热图列表和行注释等功能。ComplexHeatmap适用于展示基因组数据、甲基化谱和单细胞RNA测序等复杂数据,并能创建增强型OncoPrint、UpSet图和3D热图。其高度定制性使其成为生物信息学和数据科学领域的强大可视化工具。

awesome-R - 全面收录的R语言包和工具大全
GithubR语言开发工具开源项目数据分析数据可视化统计编程
该项目汇集了R语言生态系统中的优质包和工具,涵盖集成开发环境、数据操作、图形显示和机器学习等多个领域。列表持续更新至2023年,并标注了热门和高下载量的资源。这份全面的指南旨在帮助R语言开发者和数据科学家提高数据分析和可视化效率。
cal-heatmap - 灵活多样的时间序列日历热图JavaScript库
Cal-HeatMapGithubJavaScript图表库开源项目数据可视化日历热图时间序列
Cal-Heatmap是一个开源JavaScript库,专门用于创建时间序列日历热图。该库提供多种自定义功能,如动画日期导航、时间间隔设置和布局控制等。Cal-Heatmap支持插件系统,适配多种浏览器,并可实现从右到左的布局。它能够生成类似GitHub贡献日历的可视化图表,但功能更为丰富。这个库适合需要展示时间相关数据的开发项目使用。
timetk - R语言时间序列分析与可视化工具包
GithubR语言timetk开源项目数据可视化时间序列分析机器学习
timetk是一个功能丰富的R语言时间序列分析工具包。它提供数据可视化、处理和特征工程功能,支持交互式和静态绘图、时间序列机器学习、异常检测和聚类分析。与同类包相比,timetk功能更全面、易用性更高,可简化时间序列分析和预测建模流程。该包适用于需要高效处理和分析时间序列数据的研究人员和数据科学家。
shiny - R语言交互式Web应用开发框架
GithubR语言Shiny交互式网络应用响应式编程开源项目数据可视化
Shiny是一个R语言框架,用于创建交互式Web应用。它采用反应式编程模型,提供预构建组件和默认样式,无需深入HTML/CSS/JavaScript。Shiny支持R Markdown集成、性能优化、模块化开发,并拥有丰富的扩展生态系统。适合数据科学家和开发者快速构建动态应用。
genome-spy - 基于WebGL的基因组数据可视化工具包 支持多样本分析与交互
GenomeSpyGithubWebGL基因组可视化开源项目数据可视化生物信息学
GenomeSpy是一款基因组数据可视化工具包,采用Vega-Lite风格的语法和WebGL渲染技术。它能处理数千个患者样本,提供分面、过滤、排序和分组功能。此外,GenomeSpy具备交互式界面,支持会话管理、URL哈希和书签,方便研究人员分析复杂的基因组数据。
datamapplot - Python库实现数据地图的高质量可视化
DataMapPlotGithubPython库交互式绘图开源项目数据可视化数据地图
DataMapPlot是一个用于创建数据地图可视化的Python库。它可生成适用于演示、海报和论文的静态或简单交互式数据地图图表。用户只需标记数据点簇,库即可自动处理剩余工作。DataMapPlot提供多种自定义选项,包括暗色模式、字体和颜色映射等。其核心功能集中在create_plot和create_interactive_plot两个函数上,使用简便。该工具适合各类数据可视化需求,尤其适用于科研成果展示。
PaCMAP - 高效保留数据局部和全局结构的降维可视化工具
GithubPaCMAP全局结构可视化局部结构开源项目降维
PaCMAP是一种创新的降维算法,专注于高维数据的可视化。通过优化邻居对、中距离对和远距离对三种点对关系,PaCMAP能同时保留数据的局部和全局结构,突破了传统方法仅关注单一结构的局限。该算法已在机器学习权威期刊JMLR发表,并提供Python和R语言接口,适用于多领域的高维数据可视化分析。PaCMAP在MNIST等多个数据集上展现出优秀的性能,为数据科学家提供了强大的可视化工具。
collapse - R语言高效数据处理与统计分析工具
GithubR包collapse开源项目性能优化数据转换统计计算
collapse是一款强大的R语言数据处理和统计分析工具包。基于C/C++开发,它提供了高效的统计函数、数据操作和内存管理功能。支持分组计算、加权分析,兼容多种数据类型和R包。collapse还具备高级聚合、数据转换和时间序列分析能力,其高性能算法使其尤其适合处理大规模复杂数据集。
G2Plot - 基于 G2 的开源统计图表库
AntVG2G2PlotGithub图表库开源项目数据可视化
G2Plot 是基于 G2 4.x 版本封装的开源统计图表库。它提供开箱即用的图表组件,具有易用性高、视觉效果优雅、响应式设计等特点。G2Plot 支持创建单一图表,也可通过图层概念实现多图表组合,适用于各类数据可视化需求。该库简化了统计图表的制作过程,使用户无需深入了解可视化理论即可创建标准规范的图表。
echarts - 开源JavaScript数据可视化解决方案
Apache EChartsGithubJavaScript库图表制作开源项目数据可视化
Apache ECharts是一个开源的JavaScript数据可视化库,提供直观、交互式和可定制的图表功能。基于轻量级画布库zrender开发,ECharts支持多种图表类型,具有简单易用的API和丰富的文档示例。该库还提供3D绘图、地球可视化和WebGL加速等扩展功能,适用于多样化的数据可视化需求。ECharts以其强大的功能和灵活性成为数据可视化领域的重要工具。
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