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pystore

快速高效的Pandas时间序列数据存储库

PyStore是专为Pandas时间序列数据设计的快速存储库。它利用Pandas、Numpy、Dask和Parquet技术,实现高效的数据存储和查询。支持本地文件系统,每秒可处理数百万行数据。PyStore提供集合管理、快照和元数据查询功能,适合大规模时间序列数据的存储和分析。

PyStore - Pandas 时间序列数据的快速数据存储

.. image:: https://img.shields.io/badge/python-2.7,%203.5+-blue.svg?style=flat :target: https://pypi.python.org/pypi/pystore :alt: Python 版本

.. image:: https://img.shields.io/pypi/v/pystore.svg?maxAge=60 :target: https://pypi.python.org/pypi/pystore :alt: PyPi 版本

.. image:: https://img.shields.io/pypi/status/pystore.svg?maxAge=60 :target: https://pypi.python.org/pypi/pystore :alt: PyPi 状态

.. image:: https://img.shields.io/travis/ranaroussi/pystore/master.svg?maxAge=1 :target: https://travis-ci.com/ranaroussi/pystore :alt: Travis-CI 构建状态

.. image:: https://www.codefactor.io/repository/github/ranaroussi/pystore/badge :target: https://www.codefactor.io/repository/github/ranaroussi/pystore :alt: CodeFactor

.. image:: https://img.shields.io/github/stars/ranaroussi/pystore.svg?style=social&label=Star&maxAge=60 :target: https://github.com/ranaroussi/pystore :alt: 为此仓库加星

.. image:: https://img.shields.io/twitter/follow/aroussi.svg?style=social&label=Follow&maxAge=60 :target: https://twitter.com/aroussi :alt: 在 Twitter 上关注我

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PyStore <https://github.com/ranaroussi/pystore>_ 是一个简单(但功能强大)的 Pandas 数据框存储系统,尽管它可以存储任何 Pandas 对象,但它是专为存储时间序列数据而设计的

它基于 Pandas <http://pandas.pydata.org>Numpy <http://numpy.pydata.org>Dask <http://dask.pydata.org>_ 和 Parquet <http://parquet.apache.org>(通过 pyarrow <https://github.com/apache/arrow>)构建,为 Python 开发者提供了一个易于使用的数据存储系统,每个客户端每秒可以轻松查询数百万行数据。

==> 查看 这篇博客文章 <https://medium.com/@aroussi/fast-data-store-for-pandas-time-series-data-using-pystore-89d9caeef4e2>_ 了解 PyStore 背后的原理和理念,以及包含代码示例的详细教程。

==> 按照 这个 PyStore 教程 <https://github.com/ranaroussi/pystore/blob/master/examples/pystore-tutorial.ipynb>_ 以 Jupyter 笔记本格式进行学习。

快速入门

安装 PyStore

使用 pip 安装:

.. code:: bash

$ pip install pystore --upgrade --no-cache-dir

使用 conda 安装:

.. code:: bash

$ conda install -c ranaroussi pystore

安装注意事项: 如果您尚未安装 Snappy(压缩/解压缩库),您需要 先安装它 <https://github.com/ranaroussi/pystore#dependencies>_。

使用 PyStore

.. code:: python

#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-

import pystore
import quandl

# 设置存储路径(可选)
# 默认为 `~/pystore` 或 `PYSTORE_PATH` 环境变量(如果已设置)
pystore.set_path("~/pystore")

# 列出存储
pystore.list_stores()

# 连接到数据存储(如果不存在则创建)
store = pystore.store('mydatastore')

# 列出现有集合
store.list_collections()

# 访问集合(如果不存在则创建)
collection = store.collection('NASDAQ')

# 列出集合中的项目
collection.list_items()

# 从 Quandl 加载一些数据
aapl = quandl.get("WIKI/AAPL", authtoken="您的令牌")

# 将数据的前 100 行存储在集合中,名为 "AAPL"
collection.write('AAPL', aapl[:100], metadata={'source': 'Quandl'})

# 读取项目的数据
item = collection.item('AAPL')
data = item.data  # <-- Dask 数据框(参见 dask.pydata.org)
metadata = item.metadata
df = item.to_pandas()

# 将剩余的行追加到 "AAPL" 项目
collection.append('AAPL', aapl[100:])

# 读取项目的数据
item = collection.item('AAPL')
data = item.data
metadata = item.metadata
df = item.to_pandas()


# --- 查询功能 ---

# 基于元数据查询可用符号
collection.list_items(some_key='some_value', other_key='other_value')


# --- 快照功能 ---

# 创建集合快照
# (集合中所有当前符号的时间点命名引用)
collection.create_snapshot('snapshot_name')

# 列出可用快照
collection.list_snapshots()

# 获取给定快照名称的符号版本
collection.item('AAPL', snapshot='snapshot_name')

# 删除集合快照
collection.delete_snapshot('snapshot_name')


# ...


# 从当前版本删除项目
collection.delete_item('AAPL')

# 删除集合
store.delete_collection('NASDAQ')

使用 Dask 调度器

PyStore 0.1.18+ 支持使用 Dask 分布式。

要使用本地 Dask 调度器,请在代码中添加以下内容:

.. code:: python

from dask.distributed import LocalCluster
pystore.set_client(LocalCluster())

要使用分布式 Dask 调度器,请在代码中添加以下内容:

.. code:: python

pystore.set_client("tcp://xxx.xxx.xxx.xxx:xxxx")
pystore.set_path("/path/to/shared/volume/all/workers/can/access")

概念

PyStore 提供了命名空间化的数据集合。 这些集合允许通过来源、用户或其他指标(例如频率:日终数据、分钟线等)对数据进行分类。 每个集合(或命名空间)对应一个目录,其中包含每个项目(例如股票代码)的分区 parquet 文件

创建集合的一个良好做法可能如下所示:

  • collection.EOD
  • collection.ONEMINUTE

要求

  • Python 2.7 或 Python > 3.5
  • Pandas
  • Numpy
  • Dask
  • Pyarrow
  • Snappy <http://google.github.io/snappy/>_(Google 的压缩/解压库)
  • multitasking

PyStore 已在类 *nix 系统(包括 macOS)上测试通过。

依赖项:

PyStore 使用 Snappy <http://google.github.io/snappy/>_, 这是 Google 开发的一个快速高效的压缩/解压库。 在安装 PyStore 之前,您需要先在系统上安装 Snappy。

* 更多信息请参见 python-snappyGithub 仓库 <https://github.com/andrix/python-snappy#dependencies>_。

*nix 系统:

  • APT:sudo apt-get install libsnappy-dev
  • RPM:sudo yum install libsnappy-devel

macOS:

首先,使用 Homebrew <https://brew.sh>_ 安装 Snappy 的 C 库:

.. code::

$ brew install snappy

然后,使用 conda 安装 Python 的 snappy:

.. code::

$ conda install python-snappy -c conda-forge

...或者,使用 pip

.. code::

$ CPPFLAGS="-I/usr/local/include -L/usr/local/lib" pip install python-snappy

Windows:

Windows 用户可以查看 Snappy for Windows <https://snappy.machinezoo.com>_ 和 这个 Stackoverflow 帖子 <https://stackoverflow.com/a/43756412/1783569>_ 以获取有关安装 Snappy 和 python-snappy 的帮助。

路线图

PyStore 目前支持本地文件系统(包括连接的网络驱动器)。 我计划在未来添加对 Amazon S3(通过 s3fs <http://s3fs.readthedocs.io/>)、 Google Cloud Storage(通过 gcsfs <https://github.com/dask/gcsfs/>) 和 Hadoop 分布式文件系统(通过 hdfs3 <http://hdfs3.readthedocs.io/>_)的支持。

致谢

PyStore 的灵感主要来自 Man AHL <http://www.ahl.com/>_ 的 Arctic <https://github.com/manahl/arctic>_,后者使用 MongoDB 进行存储,并支持版本控制等功能。 我强烈建议您去了解一下。

许可证

PyStore 采用 Apache License, Version 2.0 许可。许可证副本包含在 LICENSE.txt 文件中。


我非常关心您使用 PyStore 的体验。 请随时与我分享您的任何反馈。

欢迎贡献!

- Ran Aroussi

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