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化学生成任务评估基准模型集合

GuacaMol Baselines项目为化学生成任务评估提供多种基准模型实现。包含随机采样、ChEMBL最佳选择、SMILES和图遗传算法、图蒙特卡洛树搜索以及SMILES LSTM变体等方法。项目配备预训练模型、数据集脚本和Docker容器,便于研究人员部署和比较各类生成模型。

ChatMol - 使用自然语言驱动的PyMOL交互式分子可视化分析工具
ChatMolGithubPyMOL分子可视化开源项目插件自然语言交互
ChatMol是一款PyMOL插件,通过自然语言交互实现分子可视化和分析。它支持命令行、迷你GUI、Python和网页浏览器等多种交互方式,集成了大型语言模型。ChatMol可执行PyMOL任务,提供建议和解释。该工具还包括Streamlit应用、Python包和在线问答系统。ChatMol简化了分子结构分析过程,无需复杂设置即可使用。
smilesDrawer - 基于SMILES的轻量级分子结构绘制工具
GithubJavaScriptSMILESSmilesDrawer分子结构化学绘图开源项目
SmilesDrawer是一款基于SMILES的轻量级分子结构绘制工具,无需服务器、图片或模板即可运行。该工具支持绘制分子、反应和结构高亮,提供学习资源和样式自定义选项。SmilesDrawer可集成到多个前端框架中,如Svelte。它具有可配置的颜色主题,支持复杂环系的实验性绘制,并可通过CDN或npm方便安装。这一工具为化学信息学研究提供了实用的分子可视化解决方案。
basalt - 使用Mojo语言开发的机器学习框架
BasaltGithubMojo开源项目性能优化机器学习框架
Basalt是一个独立的机器学习框架,利用Mojo语言进行从头开发,性能媲美PyTorch等成熟框架。基于MLIR技术,Basalt通过静态图优化性能。目前,项目正在持续更新,计划支持更多操作符、图子模块和GPU等特性。尝试使用Basalt为机器学习项目带来显著加速效果。
yet-another-applied-llm-benchmark - 基于真实场景的大语言模型能力评估基准
API密钥Docker容器GithubLLM基准测试开源项目数据流DSL模型评估
yet-another-applied-llm-benchmark是一个评估大语言模型在实际应用场景中表现的基准测试项目。该项目包含近100个源自真实使用情况的测试案例,涵盖代码转换、反编译、SQL生成等多种任务。通过简单的数据流DSL设计测试,项目提供了一个灵活的框架来评估大语言模型的实际能力。这个基准虽不是严格的学术标准,但为开发者提供了衡量大语言模型在日常编程任务中表现的实用方法。
SaProt_650M_PDB - 提供两种加载方式以支持深度学习蛋白质模型的灵活使用
AI绘图GithubHuggingfaceSaProtesm开源项目模型深度学习
该项目通过Huggingface和ESM GitHub两种方式提供深度学习蛋白质模型加载和使用的便捷途径,用户可以依照需求进行选择。这些方法配合详细的代码实例,有助于用户高效完成蛋白质序列的分析和应用。
chameleon - 多模态早期融合基础模型的开源实现
AI研究GithubMeta Chameleon可视化工具多模态模型开源项目模型推理
Chameleon是Meta AI开发的多模态早期融合基础模型。项目提供GPU推理实现、浏览器端多模态输入输出查看工具和评估提示。开源内容包括模型代码、权重和数据集,支持多模态AI技术研究与应用。Chameleon能够在文本、图像等多种模态间实现高效融合和理解。
bigcode-evaluation-harness - 开源代码生成模型评估框架
BigCodeGithub代码生成多语言支持开源项目模型评估评估框架
bigcode-evaluation-harness是一个评估代码生成模型的开源框架。它支持多种编程语言和任务,如代码补全、插入和翻译。该框架兼容Hugging Face上的自回归模型,具备多GPU生成能力,并可在Docker容器中运行以保证安全性和可重复性。框架集成了HumanEval、APPS等多个代码生成基准,为研究人员和开发者提供了全面评估代码模型性能的工具。
awesome-huge-models - 大型AI模型最新动态与开源资源汇总
AI训练GithubLLMdeep learning模型大模型开源开源项目
详尽介绍大型AI语言模型最新进展及开源资源,包括训练代码、数据集和预训练权重。收录Baichuan、Falcon、OpenLLaMA等模型,并关注开源与分布式训练框架如PyTorch和XLA生态。提供全面资源链接,帮助研究人员和开发者了解当前AI模型的最前沿动态。
DNABERT - DNABERT:用于基因组DNA语言处理的双向编码器模型
BERTDNABERTGPUGithub基因组开源项目预训练模型
DNABERT提供完整的源码、使用示例、预训练和微调模型,适用于各类基因组DNA语言处理任务。该项目利用Huggingface的扩展工具,增添了多任务支持和高效的可视化功能。最新版DNABERT-2不仅提升了多物种基因组的处理能力,还发布了全面的Genome Understanding Evaluation (GUE)基准测试,涵盖28个数据集。
OLMo - 开源语言模型加速科学研究
GithubOLMo人工智能开源语言模型开源项目机器学习自然语言处理
OLMo是一个开源语言模型项目,提供多种规模的先进模型,如1B、7B和7B Twin 2T,全部基于Dolma数据集训练。该项目支持模型训练、微调和推理,提供详细配置和检查点以确保研究可重现。OLMo还包含数据检查和评估工具,为语言模型研究提供全面支持,旨在加速这一领域的科学进展。
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