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nucleotide-transformer-v2-500m-multi-species

基于多物种基因组的大规模DNA语言模型

nucleotide-transformer-v2-500m-multi-species是一个基于850个多物种基因组预训练的5亿参数Transformer模型。该模型利用多样化物种的DNA序列信息,通过掩码语言建模训练,可用于分子表型预测等任务。它采用6-mer标记化方法,结合旋转位置编码和门控线性单元,在900B个标记上训练而成。这一基础模型为基因组学研究提供了有力工具,可应用于多种下游分析。

scGPT - AI单细胞多组学基础模型
GithubscGPT单细胞多组学在线应用基因表达调控网络开源项目预训练模型
scGPT是一个基于AI的单细胞多组学研究基础模型,提供丰富的预训练模型和在线应用程序。该平台支持基因调控网络分析、细胞类型注释及多组学集成,适用于处理大规模细胞数据集,如全人类及特定器官细胞。此外,其零样本学习和快速参考映射功能,加上不断更新的训练模型,保障了其在多种研究任务中的应用前沿性和广泛适用性。
mbart-large-50-many-to-one-mmt - 支持50种语言直接互译的多语言机器翻译模型
GithubHugging FaceHuggingfacemBART-50多语言机器翻译开源项目模型神经网络模型自然语言处理
mbart-large-50-many-to-one-mmt是一个基于mBART-large-50微调的多语言机器翻译模型,支持50种语言之间的直接互译。该模型无需中间语言,使用简单,只需几行代码即可实现翻译。它在处理低资源语言和长文本方面表现优异,适用于跨语言交流和全球化业务场景。模型覆盖多个语系,包括印欧、亚非和阿尔泰语系等,为用户提供全面的多语言翻译解决方案。
TransformerPrograms - Transformer模型转Python程序的新型解释方法
GithubTransformer Programs代码生成开源项目机器学习程序合成自然语言处理
TransformerPrograms项目提出了一种新方法,可将Transformer模型转换为易读的Python程序。该项目提供了训练和转换工具,并包含多个示例程序,涵盖从排序到命名实体识别等任务。这为解释Transformer模型提供了新视角,有助于研究者探索模型内部机制,推进AI可解释性研究。
xgen - 支持8K输入长度的7B长序列模型
7B LLM8K Input Sequence LengthGithubHuggingFace HubSalesforce AI ResearchXGen开源项目
Salesforce AI Research发布了XGen模型系列,支持最长8K输入序列。这些模型包括适用于4K和8K序列长度的基础模型以及经过指令微调的8K模型。模型使用OpenAI的Tiktoken进行分词,并可用于自回归采样。访问HuggingFace Hub获取更多模型详细信息和使用方法。
jina-reranker-v2-base-multilingual - 高性能多语言文本重排序模型优化信息检索效果
GithubHuggingfacejina-reranker-v2-base-multilingual多语言开源项目搜索相关性文本重排序模型跨编码器
jina-reranker-v2-base-multilingual是一款优化文本重排序的多语言transformer模型。它支持多语言查询-文档对处理、长文本输入和闪存注意力机制,在文本检索、多语言处理、函数调用和SQL重排序等基准测试中表现卓越。该模型能显著提升信息检索系统的性能和准确度。
ByteTransformer - 为BERT类Transformer优化的高性能推理库
BERTByteTransformerGithubNVIDIA GPUTransformer开源项目高性能
ByteTransformer是一个为BERT类Transformer优化的高性能推理库,支持Python和C++ API,兼容固定长度和可变长度Transformer。通过对BERT例程中的QKV编码、软最大值、前馈网络、激活、层归一化和多头注意力机制进行优化,ByteTransformer为字节跳动的内部推理系统提升了性能。基准测试结果显示,相较于PyTorch、TensorFlow、FasterTransformer和DeepSpeed,ByteTransformer在A100 GPU上的推理速度更快。
MT-UNet - 融合Transformer和UNet的医学图像分割新模型
GithubMT-UNet医学图像分割开源项目数据集准备权重文件模型训练
MT-UNet是一种结合Transformer和UNet优势的医学图像分割模型。该模型在Synapse和ACDC数据集上分别达到79.20%和91.61%的DSC评分。MT-UNet通过混合transformer结构实现多尺度特征融合,为医学图像分析提供新思路。项目开源代码和预训练权重,便于研究者复现结果和深入研究。
internlm-xcomposer2d5-7b-4bit - 简化大型语言模型的文本与图像处理新纪元
4位量化模型GithubHuggingfaceInternLM-XComposer开源项目文本图像理解模型视频理解长上下文能力
InternLM-XComposer2.5在文本与图像理解领域展现非凡性能,其应用灵活性媲美GPT-4V,仅靠7B参数即可完成复杂任务。模型通过24K图文上下文训练与96K扩展能力,适用于大量输入输出任务。此外,项目提供了4-bit量化模型来有效降低内存消耗,并支持使用Transformers快速集成,涵盖从视频理解到多图对话的多种应用场景。
deepvariant - 基于深度学习的高精度变异检测工具
DeepTrioDeepVariantGithub变异检测基因组学开源项目深度学习
DeepVariant是一种基于深度学习的变异检测工具,主要用于二倍体生物的生殖系变异检测。该工具通过生成堆积图像张量,并利用卷积神经网络进行分类,最终输出VCF或gVCF文件。DeepVariant支持包括Illumina、PacBio HiFi和Oxford Nanopore在内的多种测序技术。它操作简便、经济高效,适用于Docker、本地硬件及云端环境。DeepTrio是其扩展工具,支持三人组变异检测。项目具有高准确率、灵活性,能处理多种测序方式及非人类物种的数据。
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