clinica

多模态神经影像分析平台支持临床研究

Clinica 临床神经影像数据处理管道 BIDS标准机器学习 Github 开源项目

Clinica是一个开源的临床神经影像研究软件平台，支持多模态数据处理。平台提供多种处理流程，用于分析T1加权MRI、弥散MRI和PET数据。它可将公开数据集转换为BIDS格式，并集成机器学习和深度学习技术。Clinica为神经退行性疾病研究提供了有力工具，尤其适用于阿尔茨海默病等领域。

文档

MedTrinity-25M - 多粒度标注医学数据集推动医疗AI进步

GithubMedTrinity-25M医学数据集多模态多粒度标注大规模开源项目

MedTrinity-25M是一个大规模医学多模态数据集，包含2500万条多粒度标注。该数据集整合了医学图像和文本信息，采用创新处理流程和先进语言模型生成精细描述。它显著提升了医学视觉问答性能，为医疗AI发展提供重要资源。项目还开源了相关模型和代码，推动医学AI领域的开放协作。

SAT - 突破性医学图像分割模型，支持多模态多区域文本提示

GithubSAT医学图像分割多模态开源项目文本提示通用分割模型

SAT是一个基于72个公共3D医学分割数据集构建的通用医学图像分割模型。它通过文本提示可分割MR、CT、PET三种模态和8个人体区域的497个类别。相比传统专家模型，SAT在效率和性能上都有所提升。项目开源了完整代码、预训练模型和数据集，为医学图像分析和AI研究提供了新的工具和资源。

Neuralhub - 一体化神经网络开发与协作环境

AI工具AI研究Neuralhub协作平台深度学习神经网络

Neuralhub是面向AI爱好者、研究人员和工程师的一站式深度学习平台。它提供简化的神经网络开发环境，集成了从头构建网络的工具、丰富的预设组件库和高质量预训练模型。作为人工智能创新中心，Neuralhub不仅支持实验和技术突破，还培育了活跃的知识共享与协作社区。通过整合先进工具、前沿研究成果和海量模型资源，Neuralhub致力于让AI研究、学习和开发更加便捷高效，推动深度学习技术的普及与进步。

argilla - AI数据集管理与优化工具

AI工程师ArgillaGithub开源项目数据质量数据集模型优化

Argilla是一款为AI工程师和领域专家设计的数据集管理工具，旨在通过高效的数据管理和标注流程提升AI项目的数据质量和模型效果。Argilla支持文本分类、命名实体识别和多模态模型等多种AI项目的数据收集和反馈，帮助用户快速迭代和优化数据与模型。该工具提供开源社区支持，用户可以参与并共享开源数据集和模型。通过与Hugging Face Spaces的集成，用户可以轻松部署和使用Argilla，提高AI项目的整体效率和质量。

torchio - 深度学习医疗图像处理工具集

GithubPythonTorchIO医药图像开源项目数据增强深度学习

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案，涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作，包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发，该项目广泛应用于医学AI研究，提升数据处理效率和模型性能。

ModelsGenesis - 3D医疗影像自监督预训练模型

3D医学影像GithubModels Genesis医学图像分析开源项目自学习迁移学习

此项目推出了名为Generic Autodidactic Models的预训练模型，专为3D医学影像应用设计，特别适合标注数据有限的情况。这一模型通过自监督学习实现自我训练，无需人工标注，并能生成各种应用场景的目标模型。Models Genesis性能显著优于从零开始训练的3D模型，甚至超过了包括ImageNet模型在内的2D方法，尤其在分割肝脏、肿瘤和海马体方面表现卓越。

Awesome-Diffusion-Models-in-Medical-Imaging - 汇总医疗影像中扩散模型的前沿研究与应用

Anomaly DetectionDiffusion ModelsGithubMedical ImagingSegmentationSurvey Papers开源项目

本页面汇集了关于医疗影像扩散模型的精彩文章，包括综合调查、挑战报告以及多种应用领域的最新研究成果。这里汇集了关于异常检测、去噪、分割、图像生成和文本到图像转换等方面的详尽文献。这些内容展示了扩散模型在医学图像分析中的重要性，还覆盖了在皮肤病变分割、脑图像异常检测等具体应用中的最新进展。欢迎社区参与和贡献，共同推动这一领域的发展。

medpy - 医学图像处理的Python库和工具集

GithubMedPyPython库医学图像处理开源软件开源项目数据分析

MedPy是一个开源的医学图像处理Python库，专注于高维图像处理。它提供丰富的功能和脚本集合，支持PyPI和Conda-Forge安装。MedPy具有完善的文档和教程，适用于Python 3及以上版本。该项目在GitHub上维护，为医学图像处理研究和应用提供了有力支持。MedPy支持医学图像的分割、配准、滤波等多种处理任务，广泛应用于放射学、神经影像学等医学领域。

gif_your_nifti - NIfTI脑部影像数据转换GIF动画工具

GIF生成GithubNIfTIPython工具开源项目数据可视化脑成像

gif_your_nifti是一个将NIfTI格式脑部影像数据转换为GIF动画的开源工具。支持灰度、伪彩色、深度和RGB等多种模式，提供大小调整等选项。用户可通过命令行或Python脚本使用，适用于科研展示和医学影像分析。工具依赖常用Python库，安装简便，支持Docker部署。

cucim - 提升多维图像处理性能的开源库

GPU加速GithubRAPIDScuCIM图像处理多维图像开源项目

cuCIM 是一个开源的高性能多维图像处理和计算机视觉软件库，应用于生物医学、地理空间、材料科学、生命科学和遥感领域。利用基于 GPU 的加速技术，cuCIM 提供了增强的大规模和多维 TIFF 文件处理能力，并且支持简便的 Python 接口和多种图像格式，如 Aperio ScanScope 虚拟切片、Philips TIFF 和多分辨率压缩 TIFF 文件。

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