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python-glmnet

Python实现的正则化回归库

python-glmnet是一个实现正则化回归模型的Python库。它封装了R语言glmnet包的Fortran库,提供线性和逻辑回归功能。该库兼容Scikit-Learn的API,支持稀疏矩阵,具有交叉验证和自动选择最佳正则化参数的功能。可通过conda或pip安装,适用于需要实现Lasso或ElasticNet回归的数据科学项目。

Python GLMNET

维护警告

此包不再维护。

描述

这是R包glmnet中使用的Fortran库的Python封装。虽然该库包含线性、逻辑、Cox、泊松和多响应高斯回归,但本包只实现了线性和逻辑回归。

API遵循Scikit-Learn的惯例,因此预期可与该生态系统的工具配合使用。

安装

要求


python-glmnet需要Python版本>=3.6,scikit-learn,numpy和scipy。从源代码或通过pip安装需要Fortran编译器。

conda
~~~~~

.. code:: bash

    conda install -c conda-forge glmnet


pip
~~~

.. code:: bash

    pip install glmnet


源代码
~~~~~~

glmnet依赖numpy、scikit-learn和scipy。
还需要一个可用的Fortran编译器来构建包。
对于Mac用户,brew install gcc可以满足这个要求。

.. code:: bash

    git clone git@github.com:civisanalytics/python-glmnet.git
    cd python-glmnet
    python setup.py install

使用
-----

通用
~~~~~

默认情况下,LogitNet和ElasticNet使用lasso惩罚(α = 1)和最多100个λ值(由算法确定)拟合一系列模型。此外,在计算λ值路径后,使用3折交叉验证计算每个λ值的性能指标。对应最佳表现模型的λ值保存为lambda_max_属性,而使模型性能在最佳得分模型的cut_point * standard_error范围内的最大λ值保存为lambda_best_属性。

predict和predict_proba方法接受一个可选参数lamb,用于选择将用于预测的模型。如果省略lamb,将使用lambda_best_。

两种模型都接受稠密或稀疏数组。

正则化逻辑回归

.. code:: python

from glmnet import LogitNet

m = LogitNet()
m = m.fit(x, y)

预测类似于Scikit-Learn:

.. code:: python

# 预测标签
p = m.predict(x)
# 或概率估计
p = m.predict_proba(x)

正则化线性回归


.. code:: python

    from glmnet import ElasticNet

    m = ElasticNet()
    m = m.fit(x, y)

预测:

.. code:: python

    p = m.predict(x)
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