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CTK

多功能医学影像分析与手术导航开源工具包

Common Toolkit (CTK)是一个社区驱动的开源项目,专注于医学影像分析和手术导航领域。它提供DICOM处理、应用程序托管、Qt小部件、插件框架和命令行接口等功能。CTK支持Qt5和Python3,并采用自动化依赖管理简化开发流程。该项目使用Apache 2.0许可证,可自由用于学术研究和商业应用。

ITK - N维科学图像处理与分析的开源跨平台工具包
GithubITKNumFOCUS医学影像图像处理开源软件开源项目
ITK是专门用于N维科学图像处理、分割和配准的开源跨平台工具包。它为医学图像处理、计算机视觉等领域提供了强大的分析功能。ITK同时支持C++和Python编程,拥有丰富的文档和示例资源,适用于教学、科研及商业应用。该项目获得NumFOCUS赞助,采用Apache 2.0开源许可证发布。
Slicer - 跨平台医学影像分析与可视化软件
3D SlicerGithub可视化图像分析开源软件开源项目跨平台
3D Slicer是一款开源的医学影像可视化和分析软件。它兼容Windows、Linux和macOS,提供3D影像处理工具,适用于研究人员和医疗专业人士。该项目具有活跃的社区支持,定期更新,并提供详细文档和教程。3D Slicer为医学影像研究和应用提供了强大的跨平台解决方案。
SimpleITK - 多语言医学图像分析工具包
GithubITKSimpleITK图像分析工具包多语言支持开源软件开源项目
SimpleITK是一个开源的医学图像分析工具包,基于ITK开发。它支持Python、R、Java等多种编程语言,可处理2D、3D和4D图像。SimpleITK提供滤波、分割和配准等功能,适用于研究和教育领域。项目采用Apache License 2.0许可,并提供详细文档和示例,方便用户学习和使用。
HistomicsTK - 数字病理图像分析的Python工具包,支持独立和网络集成
Digital Slide ArchiveGithubHistomicsTKHistomicsUIPython开源项目病理影像分析
HistomicsTK是一个用于数字病理图像分析的Python包,可以独立使用或作为Digital Slide Archive的插件。通过HistomicsUI执行图像分析任务,其功能可通过slicer cli web扩展,允许开发者集成自己的图像分析算法。借助机器学习技术和多分辨率图像,HistomicsTK帮助研究组织学、临床结果及基因数据的关系。适用于路径学家和算法研究者,提供如颜色归一化和细胞核分割等功能,支持Linux、Windows和OSX的安装指南。详细信息请访问官网。
cht-core - 社区健康工具包核心框架,开源医疗软件架构
CHT Core FrameworkCommunity Health ToolkitGithub开源软件开源项目数字健康应用社区医疗
社区健康工具包(CHT)核心框架是一个开源医疗软件架构,用于快速开发全面且可扩展的数字健康应用。它支持移动和网页应用,适应各种医疗系统角色和报告层级。框架采用团队协作模式,支持健康工作者通过短信或移动应用提交数据,并利用响应式网页应用查看和导出数据。支持本地或云端部署,多语言本地化,旨在为各地区的社区健康工作提供有力支持。
cucim - 提升多维图像处理性能的开源库
GPU加速GithubRAPIDScuCIM图像处理多维图像开源项目
cuCIM 是一个开源的高性能多维图像处理和计算机视觉软件库,应用于生物医学、地理空间、材料科学、生命科学和遥感领域。利用基于 GPU 的加速技术,cuCIM 提供了增强的大规模和多维 TIFF 文件处理能力,并且支持简便的 Python 接口和多种图像格式,如 Aperio ScanScope 虚拟切片、Philips TIFF 和多分辨率压缩 TIFF 文件。
AlizaMS - 多功能DICOM查看器 为医学影像分析提供全面支持
3D渲染DICOMGithub医学影像去识别化多平面重建开源项目
AlizaMS是一款功能全面的DICOM查看器,集成2D和3D视图、体积渲染和多平面重建等核心功能。它具备快速目录扫描和DICOMDIR文件处理能力,同时保证DICOM数据的一致性匿名化。该软件支持RTSTRUCT轮廓显示、多视图研究和超声校准区域精确测量。AlizaMS还提供2D+t和3D+t动画效果,内置DICOM元数据查看器和2024b字典。软件兼容多数IOD类型,包括结构化报告和灰度软拷贝呈现状态。
TotalSegmentator - 全身器官自动分割工具适用于CT和MR影像
CT图像分割GithubMR图像分割TotalSegmentator医学影像开源项目深度学习
TotalSegmentator是一款自动分割CT和MR图像中主要解剖结构的开源工具。基于大规模数据集训练,可在不同设备和协议的医学影像上实现稳健分割,支持117个CT类别和56个MR类别。工具提供多种子任务,如肺血管、体表和脑出血等特定器官分割。支持命令行和Python API调用,可在CPU或GPU上运行,并提供Docker容器部署。
Weasis - 开源医学影像查看器 支持多种格式和跨平台使用
DICOM查看器GithubWeasis医学影像多平台支持开源软件开源项目
Weasis是一款开源医学影像查看软件,支持DICOM等格式。提供桌面和Web版本,适用于医疗机构和研究中心。它可与PACS系统集成,支持多语言,并提供插件扩展。Weasis具备2D/3D图像渲染、测量工具和ECG查看等功能,能够满足医疗影像专业人员的各种需求。
itkwidgets - 科学数据的交互式Web可视化Python工具
GithubJupyterPython接口itkwidgets可视化工具多维图像开源项目
itkwidgets是一个Python接口,用于在Web平台上实现多维图像、点集和几何的交互式可视化。它提供3D渲染、交互式探索和洞察生成等功能,支持Jupyter Notebook、Jupyter Lab和Google Colab等环境。该项目提供详细的安装指南和示例notebooks,便于用户可视化和分析复杂的科学数据。itkwidgets适用于医学影像、计算机视觉和数据科学等领域的研究和开发工作。
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