AutoFaiss
自动创建具有最优相似性搜索参数的Faiss knn索引。
它选择最佳的索引参数,以在内存和查询速度限制下实现最高的召回率。
文档、文章和笔记本
使用faiss高效索引、二分搜索和启发式方法,Autofaiss可以在3小时内自动构建一个大型(2亿个向量,1TB)KNN索引,只需要很少的内存(15 GB),并且查询延迟仅为毫秒级(10ms)。
通过运行这个Colab笔记本开始使用,然后查看完整文档。 通过这个Colab笔记本了解自动索引选择功能的一些见解。
然后你可以查看我们的多模态搜索示例(使用OpenAI Clip模型)。
阅读Medium文章以了解更多信息!
安装
运行pip install autofaiss
进行安装
最好创建一个虚拟环境:
python -m venv .venv/autofaiss_env
source .venv/autofaiss_env/bin/activate
pip install -U pip
pip install autofaiss
在Python中使用autofaiss
如果你想直接在Python中使用autofaiss,请查看API文档和示例
特别是,你可以使用autofaiss处理内存中或磁盘上的嵌入集合:
使用内存中的numpy数组
如果你有少量嵌入,可以使用autofaiss处理内存中的numpy数组:
from autofaiss import build_index
import numpy as np
embeddings = np.float32(np.random.rand(100, 512))
index, index_infos = build_index(embeddings, save_on_disk=False)
query = np.float32(np.random.rand(1, 512))
_, I = index.search(query, 1)
print(I)
使用保存为.npy文件的numpy数组
如果你有大量嵌入文件,最好将它们保存在磁盘上作为.npy文件,然后像这样使用autofaiss:
from autofaiss import build_index
build_index(embeddings="embeddings", index_path="my_index_folder/knn.index",
index_infos_path="my_index_folder/index_infos.json", max_index_memory_usage="4G",
current_memory_available="4G")
内存映射索引
Faiss可以使用内存映射索引。当你不需要快速搜索时间(>50ms)并且仍然想将内存占用降到最低时,这非常有用。
我们在build_index函数中提供了should_be_memory_mappable布尔值,用于仅生成内存映射索引。 注意:在faiss中,只有IVF索引可以进行内存映射,因此输出索引将是IVF索引。
要以内存映射模式加载索引,请使用以下代码:
import faiss
faiss.read_index("my_index_folder/knn.index", faiss.IO_FLAG_MMAP | faiss.IO_FLAG_READ_ONLY)
你可以查看示例了解如何使用它。
技术说明:你可以通过index.make_direct_map()(或直接从build_index函数通过传递make_direct_map布尔值)在IVF索引上创建直接映射。这样做会大大加快.reconstruct()方法的速度,该方法可以根据向量的排名给出其值。 然而,这个映射将存储在RAM中...我们建议你在内存映射的numpy数组中创建自己的直接映射,然后使用你的自定义direct_map调用.reconstruct_from_offset()。
在pyspark中使用autofaiss
Autofaiss允许你使用Spark构建索引,适用于以下两种用例:
- 以分布式方式构建大型索引
- 针对分区的嵌入数据集,并行且分布式地为每个分区构建一个索引。
先决条件:
- 安装pyspark:
pip install pyspark
。 - 准备你的嵌入文件(分区或非分区)。
- 在调用autofaiss之前创建一个Spark会话。如果不存在Spark会话,将创建一个具有最小配置的默认会话。
以分布式方式创建大型索引
完整指南请参见distributed_autofaiss.md。
可以生成一个需要比可用内存更多内存的索引。为此,你可以通过nb_indices_to_keep
控制组成索引的索引拆分数量。
例如,如果nb_indices_to_keep
为10,index_path
为knn.index
,最终索引将分解为10个较小的索引:
knn.index01
knn.index02
knn.index03
- ...
knn.index10
具体示例展示了如何生成N个索引以及如何使用它们。
创建分区索引
对于分区的嵌入数据集,可以通过调用build_partitioned_indexes
方法为每个分区创建一个索引。
请查看这个示例,了解如何创建分区索引。
使用命令行
创建嵌入
import os
import numpy as np
embeddings = np.random.rand(1000, 100)
os.mkdir("embeddings")
np.save("embeddings/part1.npy", embeddings)
os.mkdir("my_index_folder")
生成Knn索引
autofaiss build_index --embeddings="embeddings" --index_path="my_index_folder/knn.index" --index_infos_path="my_index_folder/index_infos.json" --metric_type="ip"
尝试使用索引
import faiss
import glob
import numpy as np
my_index = faiss.read_index(glob.glob("my_index_folder/*.index")[0])
query_vector = np.float32(np.random.rand(1, 100))
k = 5
distances, indices = my_index.search(query_vector, k)
print(list(zip(distances[0], indices[0])))
索引是如何选择的?
要更好地理解为什么选择这些索引以及它们的特征是什么,请查看索引选择演示
命令快速概览
autofaiss build_index
命令的简要描述:
embeddings -> 以numpy格式存储的嵌入源路径。 index_path -> 创建的索引的目标路径。 index_infos_path -> 索引信息的目标路径。 save_on_disk -> 将索引保存在磁盘上。 metric_type -> 查询的相似度距离。 index_key -> (可选)描述要构建的索引。 index_param -> (可选)描述索引的超参数。 current_memory_available -> (可选)描述机器上可用的内存量。 use_gpu -> (可选)是否使用 GPU(未经测试)。
命令详情
autofaiss build_index
命令接受以下参数:
可用标志 | 默认值 | 描述 |
---|---|---|
--embeddings | 必需 | 包含 .npy 嵌入文件的目录(或目录列表)。如果有多个文件,它们将按字典顺序读取。可以是本地路径或其他文件系统中的路径,如 hdfs://root/... 或 s3://... |
--index_path | 必需 | 本地机器上 faiss 索引的目标路径。 |
--index_infos_path | 必需 | 本地机器上 faiss 索引信息的目标路径。 |
--save_on_disk | 必需 | 将索引保存到磁盘。 |
--file_format | "npy" | 嵌入文件的文件格式。可以是 npy (用于 numpy 矩阵文件)或 parquet (用于 parquet 序列化表) |
--embedding_column_name | "embeddings" | 仅在 file_format=parquet 时需要。在这种情况下,这是包含嵌入的列的名称(每行一个向量) |
--id_columns | 无 | 仅在 file_format=parquet 时可用。在这种情况下,这些是包含向量 ID 的列的名称,将生成单独的文件以将这些 ID 映射到 KNN 索引中的索引 |
--ids_path | 无 | 仅在 id_columns 不为 None 且 file_format=parquet 时有用。这将是存储 ID->向量索引映射文件(以 parquet 格式)的路径(在任何文件系统中) |
--metric_type | "ip" | (可选)用于查询的相似度函数:("ip" 表示内积,"l2" 表示欧几里得距离) |
--max_index_memory_usage | "32GB" | (可选)创建的索引的最大大小(以 GB 为单位),此限制是严格的。 |
--current_memory_available | "32GB" | (可选)创建索引的机器上可用的内存(以 GB 为单位),拥有更多内存是一种提升,因为它减少了 RAM 和磁盘之间的交换。 |
--max_index_query_time_ms | 10 | (可选)KNN 搜索的查询时间限制,此限制是近似的。 |
--min_nearest_neighbors_to_retrieve | 20 | (可选)查询索引时要检索的最小最近邻数。此参数仅在索引超参数微调步骤中使用,不考虑选择索引算法。此参数优先于 max_index_query_time_ms 约束。 |
--index_key | 无 | (可选)如果存在,Faiss 索引将使用此描述字符串在 index_factory 中构建,更多详情请参阅 Faiss 文档 |
--index_param | 无 | (可选)如果存在,Faiss 索引将使用此超参数描述字符串进行设置,更多详情请参阅 Faiss 文档 |
--use_gpu | False | (可选)实验性功能,GPU 训练可能更快,但目前尚未测试此功能。 |
--nb_cores | 无 | (可选)要使用的核心数,默认将使用所有核心 |
--make_direct_map | False | (可选)创建允许重建嵌入的直接映射。这仅对 IVF 索引需要。请注意,这可能会增加 RAM 使用量(10 亿个嵌入约为 8GB)。 |
--should_be_memory_mappable | False | (可选)用于强制从具有磁盘上内存映射实现的索引中选择索引的布尔值。 |
--distributed | 无 | (可选)如果为 "pyspark",则使用 pyspark 创建索引。否则,索引将在本地机器上创建。 |
--temporary_indices_folder | "hdfs://root/tmp/distributed_autofaiss_indices" | (可选)保存临时小索引的文件夹,仅在 distributed = "pyspark" 时使用 |
--verbose | 20 | (可选)设置日志输出的详细程度:DEBUG=10,INFO=20,WARN=30,ERROR=40,CRITICAL=50 |
--nb_indices_to_keep | 1 | (可选)当 distributed 为 "pyspark" 时最多保留的索引数量。 |
从源代码安装
首先,创建一个虚拟环境并安装依赖项:
python3 -m venv .env
source .env/bin/activate
make install
python -m pytest -x -s -v tests -k "test_get_optimal_hyperparameters"
运行特定测试