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免费工具和方法助力提取非结构化生物医学数据中的信息

BioIE LLMs 自然语言处理生物医学数据 BERT Github 开源项目

这个开源项目提供了一系列无需付费且许可要求低的资源，旨在从非结构化生物医学数据和文本中提取结构化信息。随着语言模型如BERT和GPT-4的引入，生物信息提取方法得到了显著优化。项目涵盖多个方面，包括研究概述、活跃群组、工具和数据集，所有资源均公开且积极维护。

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介绍相关项目

BioGPT - 预训练Transformer模型为生物医学文本提供强大工具

BioGPTGithubTransformer开源项目生物医学文本自然语言处理预训练模型

BioGPT是一个针对生物医学文本的预训练Transformer模型。该模型在关系提取、文档分类和问答等下游任务中表现优异。项目提供预训练模型和特定任务的微调模型，可通过多种渠道获取。BioGPT支持文本生成、特征提取等多种应用场景，为生物医学自然语言处理研究提供了实用工具。

biomedical - 生物医学数据集库促进机器学习研究

BigBIOGithub开源项目数据标准化机器学习生物医学数据集自然语言处理

BigBIO是一个基于Huggingface datasets库开发的生物医学数据加载器库。该项目提供超过126个生物医学数据集的轻量级访问，覆盖10余种语言和12个任务类别。BigBIO致力于提高数据处理的可重复性，完善数据集来源和许可等属性的文档，并简化自然语言提示和多任务学习的元数据集生成。此外，BigBIO还支持多个主流英语生物医学基准测试中的大部分数据集。

Bio_ClinicalBERT - 为医疗临床文本优化的BERT模型

BERTClinicalBERTGithubHuggingface医疗数据开源项目机器学习模型自然语言处理

Bio_ClinicalBERT是一个针对医疗临床文本优化的BERT模型。该模型以BioBERT为基础，在MIMIC III数据库的医疗记录上进行了深度训练。它专门设计用于提升电子健康记录的理解和分析能力，尤其适合处理ICU患者数据。研究人员可通过transformers库轻松使用此模型，为临床自然语言处理任务提供有力支持。Bio_ClinicalBERT在医疗文本分析领域展现出卓越性能，为相关研究提供了有价值的工具。

awesome_Chinese_medical_NLP - 中文医学自然语言处理（NLP）开源资源大全

CBLUEGithubawesome_Chinese_medical_NLP中文医疗信息处理命名实体识别开源项目知识图谱

收录中文医学自然语言处理（NLP）各类资源，如术语集、语料库、词向量、预训练模型、知识图谱、命名实体识别、问答系统和信息抽取工具。项目旨在推动中文医学NLP技术发展，提供丰富的开源数据集和工具，包含中文医疗信息处理挑战榜CBLUE数据集、中文电子病历预训练Bert模型及多种医学词汇和知识图谱资源。这些材料涵盖术语标准化、文本分类等领域，为中文医学NLP研究和应用奠定坚实基础。

biogpt - 生物医学领域的预训练生成式语言模型

BioGPTGithubHuggingface开源项目文本生成模型生物医学自然语言处理预训练模型

BioGPT是一种针对生物医学领域的预训练生成式语言模型。该模型在大规模生物医学文献上训练，在多项自然语言处理任务中表现出色，尤其在关系抽取和问答任务上取得了显著成果。除了擅长分类任务外，BioGPT还具备强大的文本生成能力，能为生物医学术语提供流畅的描述。这些特性使得BioGPT在生物医学领域有广泛的应用前景。

BioLinkBERT-base - 结合文献和引用关系的生物医学预训练模型

BioLinkBERTGithubHuggingface开源项目文本分类模型特征提取生物医学跨文档任务

BioLinkBERT-base模型利用PubMed文献和引用信息进行预训练，在多项生物医学NLP基准测试中达到了出色表现。它在知识密集型及跨文档任务中尤为有效，并可用于问题回答、序列分类和特征提取的微调应用。

Awesome-Medical-Large-Language-Models - 医疗大语言模型前沿进展汇总

AI医疗Github人工智能医疗大语言模型开源项目生物医学AI自然语言处理

Awesome-LLM-Healthcare - 大语言模型在医疗保健领域应用的全面资源集

Github医学LLM医疗AI医疗评估多模态LLM大语言模型开源项目

该项目汇集了医疗保健领域大语言模型(LLM)的研究和应用资源。内容包括通用和专业医疗LLM、多模态医疗LLM以及LLM驱动的医疗智能助手等方向的最新进展。此外还涵盖了LLM在医疗领域的评估策略、相关综述和代码库链接。这一资源集对于研究和开发医疗健康AI应用的人员具有重要参考价值。

biomedical-ner-all - 基于英语的生物医学实体识别AI模型

AIGithubHuggingfaceMaccrobatNamed Entity Recognitiontransformers库开源项目模型生物医学

该AI模型基于Maccrobat数据集训练，可以识别107种生物医学实体，适用于案例报告等文本工作。通过distilbert-base-uncased构建，拥有低碳排放（0.0279千克）和30.17分钟的训练时间。通过Huggingface API或transformers库，可便捷应用于生物医学领域；教程视频提供详细使用说明。

Llama3-OpenBioLLM-8B - 医疗领域的开源语言模型，助力创新与研究

GithubHuggingfaceOpenBioLLM-8B临床问答开源项目模型生物医学自然语言处理训练技术

OpenBioLLM-8B是一个由Saama AI Labs开发的开源生物医学语言模型。该模型通过先进技术和8亿参数的设计，实现了在生物医学任务中的高效表现，超过了同类模型的基准测试。其专注于满足医学和生命科学领域的语言需求，基于大量高质量的生物医学数据进行训练，能够高效生成和理解专业文本，为医疗创新提供支持。

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