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深度学习医疗图像处理工具集

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案,涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作,包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发,该项目广泛应用于医学AI研究,提升数据处理效率和模型性能。

torchlm - 面向人脸关键点检测的开源工具包
Githubtorchlm人脸关键点检测开源项目数据增强模型训练深度学习
torchlm是一个开源的人脸关键点检测工具包,提供训练、评估、导出和推理功能。它包含100多种数据增强方法,支持30多种原生关键点增强,可与torchvision和albumentations集成。torchlm实现了PIPNet等先进模型,在多个基准数据集上性能出色。该项目简化了人脸关键点检测的开发流程,适用于研究和实际应用。
ai-edge-torch - PyTorch模型转TensorFlow Lite的开源解决方案
AI Edge TorchGithubPyTorchTensorFlow Lite开源项目模型转换移动设备部署
ai-edge-torch是一个开源Python库,用于将PyTorch模型转换为TensorFlow Lite格式。它支持在Android、iOS和IoT设备上本地运行模型,提供广泛的CPU支持和初步的GPU、NPU支持。该项目还包含生成式API,用于优化大型语言模型在设备端的性能。ai-edge-torch与PyTorch紧密集成,为边缘AI开发提供了实用的工具。
Image-Augmentation - 多功能图像增强软件 支持多格式及自定义处理
GithubImage-Augmentation图像增强开源项目数据增强深度学习
Image-Augmentation是一款集成ImgAug库全部增强功能的图像处理软件。支持png、jpg、jpeg、ppm、bmp、pgm、tif、tiff等常见格式,允许用户自定义增强方案。软件提供meta、arithmetic、artistic等多种增强方式,持续优化兼容性,修复常见错误如Numpy不兼容、路径与文件名中文问题等,并提供详细日志记录。最新版本新增imgcorruptlike增强功能,改进文件命名机制,提升了图像处理的稳定性和效率。Image-Augmentation注重用户体验,提供详细的使用说明和错误日志,方便用户进行问题诊断和解决。
Dioptify - 多功能AI图像处理和创意增强工具
AI工具AI技术创意工具图像优化图像处理视觉效果
Dioptify集成了多项AI图像处理技术,提供细节增强、去噪、去雾、HDR效果和图像转视频等功能。这个平台适用于艺术创作、照片修复和视觉效果提升,能够满足不同创作者的需求。Dioptify利用AI技术简化了图像处理流程,为用户提供了便捷高效的创意工具。
poptorch - 将PyTorch模型部署到Graphcore IPU的开源工具
GithubGraphcore IPUPopTorchPyTorchSDK图神经网络开源项目
PopTorch是一个为Graphcore IPU开发的PyTorch扩展工具集,支持在IPU上进行模型训练、评估和使用。项目包含PopTorch和PopTorch Geometric两个主要组件,分别用于常规深度学习和图神经网络模型。项目提供了用户指南、安装说明和构建流程,主要适配Ubuntu 20.04环境。开发者可选择通过pip安装预编译wheel包或从源代码构建。PopTorch旨在让开发者充分利用IPU的计算能力,用于构建高性能AI应用。
neurite - 医疗影像分析神经网络工具箱,支持TensorFlow和Keras
GithubNeuritekerastensorflow医疗影像分析卷积网络开源项目
Neurite是一个专注于医疗影像分析的神经网络工具箱,兼容TensorFlow和Keras,包括多种网络层、实用工具、灵活模型、生成器和回调函数,适合处理、训练和调试医疗影像数据。其主要功能有UNet模型、卷积编码器和解码器、N维网格插值、分割工具和度量指标。该工具可以通过pip简单安装,并提供科研文献引用支持,项目鼓励社区贡献,已在VoxelMorph和brainstorm等项目中使用。
PyTorch_Tutorial - PyTorch深度学习实践教程
GithubPyTorch代码实践开源项目教程模型训练深度学习
PyTorch_Tutorial是一个综合性深度学习教程项目,专注于PyTorch框架的应用。教程涵盖基础到高级的模型训练技巧,提供计算机视觉、自然语言处理和大型语言模型等领域的实践案例。内容还包括ONNX和TensorRT等推理部署框架的使用指南,展示了从模型开发到部署的完整流程。项目定期更新,配有环境配置说明,适合深度学习研究者和实践者参考学习。
TransBTS - 使用Transformer实现多模态脑肿瘤医学图像分割
GithubTransBTSTransBTSV2Transformer多模态数据集开源项目脑肿瘤分割
TransBTS与TransBTSV2采用Transformer技术显著提升多模态脑肿瘤与医学图像体积分割的效率与准确性。项目包括详细的模型实现和相关文献,支持BraTS、LiTS、KiTS等医学图像数据集,并利用Python和Pytorch进行数据预处理、模型训练和测试,支持分布式训练。适用于需要高效精准医学图像分割解决方案的研究人员和工程师。
gif_your_nifti - NIfTI脑部影像数据转换GIF动画工具
GIF生成GithubNIfTIPython工具开源项目数据可视化脑成像
gif_your_nifti是一个将NIfTI格式脑部影像数据转换为GIF动画的开源工具。支持灰度、伪彩色、深度和RGB等多种模式,提供大小调整等选项。用户可通过命令行或Python脚本使用,适用于科研展示和医学影像分析。工具依赖常用Python库,安装简便,支持Docker部署。
io - 由 TensorFlow SIG-IO 维护的数据集、流式处理和文件系统扩展
GithubKerasMNISTTensorFlow I/O开源项目文件格式文件系统
TensorFlow I/O 扩展了 TensorFlow 的数据处理功能,支持多种文件系统和格式,简化数据集访问。通过 tensorflow-io,可直接使用 HTTP/HTTPS 读取和处理数据,无需下载或存储。此外,该项目支持 Docker 镜像和 R 包,兼容最新的 TensorFlow 版本,并集成多种系统和云服务。详细信息和使用示例请参考官方文档。
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