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深度学习医疗图像处理工具集

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案,涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作,包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发,该项目广泛应用于医学AI研究,提升数据处理效率和模型性能。

ao - 优化PyTorch工作流,实现高性能和内存占用减少
GithubPyTorchtorchao开源项目推理模型量化训练
torchao是一个用于PyTorch工作流的高性能库,能够创建并集成自定义数据类型和优化技术,实现推理速度提升至2倍,显存减少65%。无需大幅修改代码,保持准确度。支持量化、稀疏化及浮点数优化,适用于HuggingFace等模型。用户可以轻松优化模型,提高计算效率。支持int8、int4和float8等多种数据类型,兼容torch.compile()和FSDP。
DI-toolkit - 简化深度学习实验流程的开源工具集
DI-toolkitGithubPython工具包TensorBoard工具开源项目文档生成日志系统
DI-toolkit是一个开源的深度学习工具集,提供日志系统、注释文档生成和TensorBoard数据提取等功能。该工具支持多个Python版本,拥有完善的文档和测试。DI-toolkit致力于简化深度学习实验流程,为研究人员提供便利。
dipy - 开源MR扩散成像分析Python库
DIPYGithubMRI分析Python库开源项目扩散成像神经影像学
DIPY(Diffusion Imaging in Python)是一个开源的Python库,专门用于分析MR扩散成像。该库提供了丰富的工具和算法,用于处理和分析扩散MRI数据,包括多种扩散模型、纤维追踪方法和可视化技术。DIPY遵循科学Python规范,主要面向研究领域。它支持通过pip或conda安装,并提供详细的文档。DIPY采用BSD许可证,欢迎社区贡献。
voxelmorph - 学习驱动的图像配准和变形建模库
GithubVoxelMorph合成形态图像配准开源项目机器学习空间变换
本页面介绍VoxelMorph,这是一个用于图像配准和变形建模的学习驱动库。页面提供教程展示无数据训练模型、图像配准和参数选择等操作步骤。VoxelMorph库支持下载预训练模型、图像到图像配准和Dice分数测量,并包含模板构建和变形字段可视化等高级功能。该项目适合那些需要高效图像配准解决方案的研究人员和开发者。
audio - 适用于PyTorch音频处理的库,支持多种文件格式与音频数据集
API参考GithubPyTorchtorchaudio开源项目机器学习音频处理
torchaudio是为PyTorch设计的音频处理库,提供GPU加速和自动微分,支持加载和保存多种音频格式(如wav、mp3、ogg、flac等),并提供常见数据集的数据加载器及音频转换功能(如频谱图、Mel频谱图)。该库还提供兼容其他库的接口,适用于音频和语音处理方面的应用。
Virchow - 自监督视觉模型实现病理图像顶尖性能
GithubHuggingfacePyTorchVirchowVision Transformer图片特征提取开源项目模型计算病理学
Virchow是通过1.5百万张病理学图像预训练的自监督视觉模型,适用于特征提取和多种计算病理学应用。采用ViT-H/14架构,具有32层和1280维度嵌入,优化于PyTorch和timm框架中高效运行,适合GPU混合精度模式。用户需遵守开源许可证,并可在HuggingFace平台获取。Virchow可根据具体数据集或应用需求进行细调整合。
serve - 提高PyTorch模型服务效率和安全性的关键技术
GithubPyTorchTorchServe大规模模型安全性开源项目模型服务
TorchServe是一款高效灵活的平台,用于生产环境中PyTorch模型的部署和扩展。最新版本通过默认启用的令牌授权机制和增强的模型API控制,有效预防未授权API调用和恶意代码风险。此外,该平台还支持在不同环境(包括本地、云服务及各类硬件)中快速部署模型。
gpytorch - 基于PyTorch实现的灵活高斯过程建模工具
GPU加速GPyTorchGaussian processGithubKISS-GPPyTorch开源项目
GPyTorch是一个基于PyTorch实现的高斯过程库,旨在简便地创建可扩展、灵活的高斯过程模型。它通过数值线性代数技术实现了显著的GPU加速,并集成了如SKI/KISS-GP和随机Lanczos展开等先进算法,同时能与深度学习框架无缝结合。支持Python 3.8及以上版本。更多信息、示例和教程请参阅官方文档。
fastMRI - 原始 MRI 测量值和临床 MRI 图像的大规模数据集
GithubPyTorchfastMRI人工智能开源项目数据集磁共振成像
fastMRI项目通过减少测量数据,加速MRI扫描,降低医疗成本,减轻患者压力。该项目由Facebook AI Research和NYU Langone Health合作,利用AI技术提升MRI速度,发布了包含膝盖和大脑MRI数据的开源数据集。项目提供数据加载、模型训练等相关工具和实现方法。
pytorch-CycleGAN-and-pix2pix - PyTorch中的高效CycleGAN和pix2pix图像翻译
CycleGANGithubPyTorchpix2pix图像翻译开源项目神经网络
该项目提供了PyTorch框架下的CycleGAN和pix2pix图像翻译实现,支持配对和无配对的图像翻译。最新版本引入img2img-turbo和StableDiffusion-Turbo模型,提高了训练和推理效率。项目页面包含详细的安装指南、训练和测试步骤,以及常见问题解答。适用于Linux和macOS系统,兼容最新的PyTorch版本,并提供Docker和Colab支持,便于快速上手。
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