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深度学习医疗图像处理工具集

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案,涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作,包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发,该项目广泛应用于医学AI研究,提升数据处理效率和模型性能。

pytorch-lightning - 深度学习框架的全方位AI模型训练与部署解决方案
AI模型训练GithubLightning FabricPyTorch Lightning开源项目模型部署深度学习热门
深度学习框架Pytorch-Lightning 2.0版本现已推出,提供清晰稳定的API,支持AI模型的预训练、微调和部署。该框架轻松实现Pytorch代码组织,将科学研究与工程实现分离,帮助研究人员和工程师高效进行模型训练与部署。通过提供各种训练和部署选项以及兼容多种硬件和加速器,Pytorch-Lightning兼顾模型的灵活性和可扩展性,适应从初学者到专业AI研究的不同需求。
SegVol - 突破性的通用交互式三维医学影像分割模型
3D建模CT扫描GithubSegVol人工智能医学图像分割开源项目
SegVol是一个创新的通用交互式三维医学影像分割模型,支持点、框和文本提示输入。该模型在96,000个CT扫描数据集上训练,可分割超过200个解剖类别。SegVol开源了推理代码、训练代码、模型参数以及预训练的ViT参数。通过内部和外部验证,SegVol展现出优秀的分割性能,为医学影像分析提供了新的解决方案。
pytorch-3dunet - 支持语义分割和回归问题的3D U-Net模型实现
3D U-NetGithubpytorch-3dunet安装开源项目训练预测
pytorch-3dunet实现了多种3D U-Net模型及其变体,包括标准3D U-Net、残差3D U-Net和带压缩激励块的残差3D U-Net。该项目支持二元和多分类语义分割以及去噪、学习反卷积等回归问题。项目还支持2D U-Net,提供多种配置示例帮助用户训练和预测。此外,该项目可在Windows和OS X系统上运行,并支持多种损失函数和评估指标,如Dice系数、平均交并比、均方误差等。这一描述更加简洁、流畅,同时保持了准确性。
Great-Deep-Learning-Tutorials - 全面深度学习教程和实用资源集锦
GithubPyTorch人工智能开源项目机器学习深度学习神经网络
该项目汇集了深度学习领域的优质教程和资源,覆盖计算机视觉、自然语言处理、语音处理等多个方向。内容包括入门教程、高级课程、技术博客和开源代码库,涵盖模型量化、AutoML、图神经网络等前沿主题。同时提供深度模型训练的实践指南,适合系统学习和深入研究深度学习的人员参考。
medical-datasets - 医学影像数据集汇总 从MRI到X射线的全面资源
CTGithubMRIX光分割标注医学影像数据集开源项目
medical-datasets是一个综合性医学影像数据集资源库,收录了MRI、CT和X射线等多种模态的影像数据。涵盖从大脑到胸部的多个人体部位,不仅包含原始图像,还提供分割标注和临床诊断等信息。该项目为医学影像分析、人工智能和机器学习领域的研究与应用提供了丰富的数据支持。
clinica - 多模态神经影像分析平台 支持临床研究
BIDS标准ClinicaGithub临床神经影像开源项目数据处理管道机器学习
Clinica是一个开源的临床神经影像研究软件平台,支持多模态数据处理。平台提供多种处理流程,用于分析T1加权MRI、弥散MRI和PET数据。它可将公开数据集转换为BIDS格式,并集成机器学习和深度学习技术。Clinica为神经退行性疾病研究提供了有力工具,尤其适用于阿尔茨海默病等领域。
pytorch_mgie - 多模态大语言模型驱动的图像编辑指导系统
AI绘图GithubGradioMGIE图像编辑大语言模型开源项目
pytorch_mgie是一个基于多模态大语言模型的图像编辑指导系统,采用Apple开源的ml-mgie技术。该项目通过自然语言指令实现图像编辑,并提供Gradio演示界面展示LLaVA-7B模型在图像编辑任务中的应用。项目包含预训练模型和环境配置指南,为研究和开发提供了实验平台。
HistomicsTK - 数字病理图像分析的Python工具包,支持独立和网络集成
Digital Slide ArchiveGithubHistomicsTKHistomicsUIPython开源项目病理影像分析
HistomicsTK是一个用于数字病理图像分析的Python包,可以独立使用或作为Digital Slide Archive的插件。通过HistomicsUI执行图像分析任务,其功能可通过slicer cli web扩展,允许开发者集成自己的图像分析算法。借助机器学习技术和多分辨率图像,HistomicsTK帮助研究组织学、临床结果及基因数据的关系。适用于路径学家和算法研究者,提供如颜色归一化和细胞核分割等功能,支持Linux、Windows和OSX的安装指南。详细信息请访问官网。
fusilli - 多模态数据融合Python库 支持机器学习任务
GithubPyTorchfusilli多模态数据融合开源项目数据分析机器学习
fusilli是一个多模态数据融合Python库,支持表格-表格和表格-图像融合,适用于回归、二分类和多分类任务。基于PyTorch Lightning和PyTorch Geometric构建,提供平台比较不同融合方法。能有效结合血液检测和神经影像等数据类型,用于疾病预测等应用。为研究人员和开发者提供便捷工具,探索多模态数据融合技术。
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