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深度学习医疗图像处理工具集

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案,涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作,包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发,该项目广泛应用于医学AI研究,提升数据处理效率和模型性能。

TotalSegmentator - 全身器官自动分割工具适用于CT和MR影像
CT图像分割GithubMR图像分割TotalSegmentator医学影像开源项目深度学习
TotalSegmentator是一款自动分割CT和MR图像中主要解剖结构的开源工具。基于大规模数据集训练,可在不同设备和协议的医学影像上实现稳健分割,支持117个CT类别和56个MR类别。工具提供多种子任务,如肺血管、体表和脑出血等特定器官分割。支持命令行和Python API调用,可在CPU或GPU上运行,并提供Docker容器部署。
pytorch-blender - 将Blender与PyTorch融合的深度学习框架
BlenderGithubPyTorchblendtorch人工视觉数据开源项目深度学习
blendtorch是一个Python框架,将Blender与PyTorch无缝集成,用于人工视觉数据的深度学习。它使用Eevee实时渲染器生成图像和注释,提高了模型训练效率。该框架支持分布式Blender渲染直接输入PyTorch数据管道,适用于监督学习和域随机化。blendtorch还提供OpenAI Gym支持,可用于强化学习训练。这一工具为人工训练数据生成和深度学习研究提供了灵活高效的解决方案。
dicom - Go语言开源DICOM医学影像解析库
DICOMGithubGo语言医学图像解析开源库开源项目高性能
dicom是一个开源的Go语言库和命令行工具,用于处理DICOM医学影像文件。它支持多帧图像解析、流式处理和数据集编码等功能。该项目采用Go模块和语义化版本,为开发者提供高效易用的DICOM解析工具。
lightning-flash - 跨数据领域和任务的AI模型训练与处理解决方案
AIGithubPyTorchlightning-flash开源项目模型训练深度学习
Lightning Flash提供多任务和多数据领域的AI解决方案,用户只需三步即可完成数据加载、模型配置和微调。项目支持多种预训练模型和优化策略,简化深度学习工作流程,适用于各种数据域和任务类型。其功能包括模型预测、训练策略、优化器和调度器选择,以及自定义数据变换。Flash旨在让用户无需自行开发复杂的研究框架,即可在生产环境中应用AI模型。
torchtune - PyTorch原生库助力简化大语言模型开发
GithubLLMPyTorchtorchtune开源项目微调模型训练
torchtune是一个PyTorch原生库,专为简化大语言模型(LLM)的创建、微调和实验而设计。该库提供了主流LLM的PyTorch实现、易用的微调技术配方、YAML配置文件和多种数据集格式支持。torchtune注重与生态系统工具集成,如Hugging Face、EleutherAI评估工具和PyTorch FSDP等。支持多种模型和微调方法,并优化内存效率,适配不同硬件环境。
awesome-multimodal-in-medical-imaging - 医学影像多模态学习应用资源集锦
Github医学影像多模态学习开源项目报告生成视觉语言模型视觉问答
该项目汇集医学影像多模态学习应用资源,涵盖数据集、综述、报告生成、视觉问答和视觉语言模型等。内容包括大语言模型相关论文,并提供最新论文和代码链接。资源库定期更新,收录超过100篇高质量论文,为医学影像多模态研究提供重要参考。
torchdyn - PyTorch数值深度学习库,支持微分方程和数值方法
GithubPyTorchTorchdyn开源项目微分方程数值方法深度学习
Torchdyn是一个专注于数值深度学习的PyTorch库,涵盖微分方程、积分变换和数值方法。它提供便捷的工具和层,用于构建神经微分方程和复合模型,并支持GPU加速和多种数值方法。该库与PyTorch和pytorch-lightning高度集成,使得用户能够快速上手,推进研究和应用。
MD.ai - 医学影像AI平台助力放射学报告和数据标注
AI工作流程AI工具DICOM临床报告医疗影像AI数据标注
MD.ai作为医学影像AI平台,专注加速放射学AI模型开发。提供DICOM数据标注工具,应用语言模型优化临床报告。支持多设备同步、多语言操作,具备AI辅助标注、PHI检测功能。助力医疗专业人员构建高质量数据集和AI模型,推动放射学AI技术进步。
evotorch - 基于PyTorch的高性能进化计算库
EvoTorchGithubPyTorch优化算法开源项目强化学习进化计算
EvoTorch是一个基于PyTorch的开源进化计算框架,支持黑盒优化、强化学习和监督学习等多种优化问题。它实现了PGPE、CMA-ES和遗传算法等多种进化算法,并通过GPU加速和Ray分布式计算提高优化效率。EvoTorch设计简洁易用,适合解决各类复杂优化问题,为研究人员和工程师提供了强大的工具支持。
nnAudio - 基于PyTorch的快速GPU音频处理工具箱
GPUGithubPyTorchnnAudio开源项目音频处理频谱图
nnAudio是一款基于PyTorch的音频处理工具箱,利用卷积神经网络实现实时频谱图生成和傅里叶核心训练。它具备跨平台兼容性、可训练性和可微分性,支持STFT、梅尔频谱、MFCC、CQT等多种音频处理功能。相比传统工具,nnAudio在GPU上提供更高效的音频分析和处理方案。
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