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HistomicsTK

数字病理图像分析的Python工具包，支持独立和网络集成

HistomicsTKPythonDigital Slide ArchiveHistomicsUIGithub开源项目病理影像分析

HistomicsTK是一个用于数字病理图像分析的Python包，可以独立使用或作为Digital Slide Archive的插件。通过HistomicsUI执行图像分析任务，其功能可通过slicer cli web扩展，允许开发者集成自己的图像分析算法。借助机器学习技术和多分辨率图像，HistomicsTK帮助研究组织学、临床结果及基因数据的关系。适用于路径学家和算法研究者，提供如颜色归一化和细胞核分割等功能，支持Linux、Windows和OSX的安装指南。详细信息请访问官网。

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介绍相关项目
ImageJ - 跨平台的科学图像处理和分析工具
GithubImageJJavaMaven开源软件开源项目科学图像处理
ImageJ是一款公共领域的科学图像处理和分析软件，由Java编写，能在不同平台上运行。主要功能包括作为Maven项目的依赖库，以及通过Ant和Maven从源代码进行构建。ImageJ拥有丰富的社区资源，如官方网站、Wiki、邮件列表和论坛，为用户提供广泛支持。适合科研人员和开发者，欢迎社区贡献。
deepdataspace - 开源计算机视觉数据集工具 提供可视化 标注和分析功能
DeepDataSpaceGithub开源数据集工具开源项目数据可视化数据标注模型分析
DeepDataSpace是一个开源计算机视觉数据集工具，提供交互式数据可视化、探索和智能标注功能。支持多平台和协作工作流，易于安装使用。通过直观界面帮助用户高效管理和分析大规模图像数据集，适用于CV项目开发和研究。
tesserocr - Python封装的OCR引擎简化技术集成
GithubOCRPythonTesseract APItesserocr图像识别开源项目
tesserocr是基于Tesseract OCR引擎的Python封装库，通过Cython集成Tesseract C++ API。它提供简洁的Pythonic接口，支持多线程并发，可与Pillow库配合。tesserocr简化了OCR集成，便于开发者在Python项目中实现高效文字识别。该库支持多种图像格式，提供丰富的API功能，包括文本识别、布局分析和方向检测等。tesserocr支持多种语言识别、图像预处理、文本布局分析等高级功能。它还提供了简单的命令行接口，方便快速测试和使用。该库适用于各种OCR应用场景，如文档数字化、图像文本提取和自动化数据录入等。
TransBTS - 使用Transformer实现多模态脑肿瘤医学图像分割
GithubTransBTSTransBTSV2Transformer多模态数据集开源项目脑肿瘤分割
TransBTS与TransBTSV2采用Transformer技术显著提升多模态脑肿瘤与医学图像体积分割的效率与准确性。项目包括详细的模型实现和相关文献，支持BraTS、LiTS、KiTS等医学图像数据集，并利用Python和Pytorch进行数据预处理、模型训练和测试，支持分布式训练。适用于需要高效精准医学图像分割解决方案的研究人员和工程师。
vsketch - Python绘图仪生成艺术工具包
GithubPythonvsketch开源项目生成艺术绘图工具绘图机
vsketch是一款面向绘图仪用户的Python生成式艺术工具包。它提供类Processing的API，注重易用性和自动化创作流程。vsketch包含CLI工具vsk和简洁API，支持项目管理、交互式渲染和批量导出。兼容Numpy和Shapely等库，为绘图仪艺术创作提供有力支持。无论是初学者还是经验丰富的艺术家，都能利用vsketch快速创作和迭代独特的绘图仪作品。
nltk - 开源Python工具包促进自然语言处理研究
GithubNLTKNLTK文档Python模块开源开源项目自然语言处理
NLTK是一个用于自然语言处理的开源Python工具包，包含模块、数据集和教程。适用于Python 3.8到3.12版本。访问nltk.org获取文档和贡献指南，支持开发。NLTK代码采用Apache 2.0许可，文档采用Creative Commons许可，语料库可用于非商业用途。
medical-datasets - 医学影像数据集汇总 从MRI到X射线的全面资源
CTGithubMRIX光分割标注医学影像数据集开源项目
medical-datasets是一个综合性医学影像数据集资源库,收录了MRI、CT和X射线等多种模态的影像数据。涵盖从大脑到胸部的多个人体部位,不仅包含原始图像,还提供分割标注和临床诊断等信息。该项目为医学影像分析、人工智能和机器学习领域的研究与应用提供了丰富的数据支持。
miditoolkit - Python开源MIDI处理工具包
GithubMIDI文件处理MiditoolkitPython包开源项目符号音乐音乐编程
Miditoolkit是一个开源的Python MIDI处理库，采用ticks作为原生时间单位。它提供MIDI文件的读取、编辑和写入功能，支持钢琴卷帘解析、全局MIDI属性管理、乐器控制和可视化。与其他工具相比，Miditoolkit在纯MIDI和符号音乐处理方面性能更优。它适用于音乐创作、MIDI文件分析和音乐信息检索等领域，为开发者提供了高效、灵活的MIDI处理解决方案。
OCTIS - 主题模型优化与比较的简便工具
GithubOCTISPython库主题模型开源项目贝叶斯优化预处理数据集
OCTIS 提供全面的主题模型预处理、训练和评估解决方案。通过贝叶斯优化方法，找到最佳超参数。支持经典和神经主题模型，并结合多种前沿评估指标。用户可以加载自定义或预处理数据集，支持Python库和简易Web仪表盘管理实验。
genome-spy - 基于WebGL的基因组数据可视化工具包 支持多样本分析与交互
GenomeSpyGithubWebGL基因组可视化开源项目数据可视化生物信息学
GenomeSpy是一款基因组数据可视化工具包，采用Vega-Lite风格的语法和WebGL渲染技术。它能处理数千个患者样本，提供分面、过滤、排序和分组功能。此外，GenomeSpy具备交互式界面，支持会话管理、URL哈希和书签，方便研究人员分析复杂的基因组数据。
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