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HistomicsTK

数字病理图像分析的Python工具包，支持独立和网络集成

HistomicsTKPythonDigital Slide ArchiveHistomicsUIGithub开源项目病理影像分析

HistomicsTK是一个用于数字病理图像分析的Python包，可以独立使用或作为Digital Slide Archive的插件。通过HistomicsUI执行图像分析任务，其功能可通过slicer cli web扩展，允许开发者集成自己的图像分析算法。借助机器学习技术和多分辨率图像，HistomicsTK帮助研究组织学、临床结果及基因数据的关系。适用于路径学家和算法研究者，提供如颜色归一化和细胞核分割等功能，支持Linux、Windows和OSX的安装指南。详细信息请访问官网。

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介绍相关项目
hctsa - MATLAB时间序列分析与特征提取工具包
Githubhctsa开源项目数据可视化时间序列分析机器学习特征提取
hctsa是一款功能强大的MATLAB时间序列分析工具包，专注于特征提取和比较分析。它能从单变量时间序列中提取大量特征，并提供多种分析工具。主要功能包括数据标准化、聚类、降维、特征识别和分类模型评估。该工具包适用于多领域的时间序列研究，能够深入挖掘数据特征，进行全面的比较分析。
SynthSeg - 通用深度学习脑部MRI分割工具 适用多种对比度和分辨率
SynthSeg深度学习脑部扫描分割
SynthSeg是一种深度学习脑部MRI分割工具，可处理不同对比度和分辨率的扫描。无需重新训练即可适用于各年龄段和健康状况的人群，可处理预处理或未预处理的扫描，并能应对白质病变。SynthSeg 2.0版本增加了皮层分区、自动质量控制和颅内容积估计功能，提高了其在分析大规模异质临床脑MRI数据集中的实用性。
awesome-transformers-in-medical-imaging - Transformer在医学影像分析中的最新应用进展
GithubTransformer分割医学图像分析开源项目深度学习计算机视觉
本项目汇总了Transformer在医学影像分析领域的最新研究成果,包括图像分割、分类、重建等多个任务。资源库按时间顺序整理相关论文和开源实现,为研究人员提供全面参考。内容定期更新,旨在促进Transformer在医学影像分析中的应用与发展。
aitlas - 地球观测人工智能工具箱简介
AiTLASGithub人工智能地球观测开源项目机器学习遥感
AiTLAS是一个开源的地球观测人工智能工具箱，集成了先进的机器学习方法和地球观测数据集。它适用于土地利用分类、作物预测、对象定位等多种任务。该工具箱旨在帮助地球观测专家应用新型AI方法，并为AI研究人员提供标准化的地球观测数据。AiTLAS支持Python 3.7+，提供文档和示例，便于安装和使用。
plip - 病理学视觉语言基础模型 革新AI分析
AIGithubPLIP开源项目病理学视觉语言模型预训练模型
PLIP是首个针对病理AI的视觉和语言基础模型，通过大规模预训练实现病理图像和文本描述的特征提取。作为CLIP模型的改进版，PLIP支持图像文本编码和相似度计算，可通过多种API方式使用。该模型为病理图像分析提供新的研究工具，助力医疗AI在病理诊断和研究中的应用。
dice - 数字图像相关工具，适用于全场位移和应变计算
DICeGithubLinuxMac OSWindows开源项目数字图像相关
DICe是一款开源的数字图像相关工具，可计算全场位移和应变，并进行刚体运动跟踪。支持Windows、Linux、Mac等操作系统，并可在高性能计算平台上有效运行。DICe支持任意形状子集和简化全球DIC方法，具备命令行和基础GUI界面。通过定制库接口或源代码集成使用DICe，并可根据教程启用高级功能。详情及安装包获取请访问DICe官方页面。
XrayGLM - 中文胸部X光片智能解读与诊断系统
GithubXrayGLM人工智能医学影像多模态模型开源项目胸部X光
XrayGLM是一个用于解读胸部X光片的中文医疗多模态模型，结合图像识别和自然语言处理技术分析X光影像并生成诊断报告。该模型基于MIMIC-CXR和OpenI数据集训练，支持影像诊断和多轮对话交互，为医疗影像诊断提供智能辅助。XrayGLM的开发促进了中文医学多模态模型的研究进展。
cornerstone3D - Web医疗影像应用开发的JavaScript框架
Cornerstone.jsGithubJavaScript库Web应用医学影像开源项目放射学
Cornerstone3D是一套用于开发Web医疗影像应用的JavaScript库。该框架采用WebGL和WebAssembly技术，实现高效图像渲染和解压缩。它允许自定义加载方案，便于连接各类图像存档。Cornerstone3D是一个开源项目，主要服务于放射学领域，支持DICOMweb标准，可用于构建OHIF Viewer等医疗影像应用。
visual-med-alpaca - 生物医学多模态AI模型实现图像理解和复杂问答
AIGithubLLMVisual Med-Alpaca多模态开源项目生物医学
Visual Med-Alpaca是一个参数高效的开源生物医学基础模型，集成了多模态能力。基于LLaMa-7B架构，该模型通过指令微调和视觉模块扩展，可执行放射影像解读和复杂临床问答等任务。仅需一张消费级GPU即可运行，为生物医学领域提供了灵活高效的AI研究工具。该项目仅供学术研究使用。
med-seg-diff-pytorch - PyTorch实现的医学图像分割扩散模型
DDPMGithubPytorch医学图像分割开源项目扩散概率模型深度学习
med-seg-diff-pytorch是一个基于PyTorch的医学图像分割框架，采用扩散概率模型(DDPM)和特征级条件增强技术。该项目提供简易安装和使用方法，支持自定义数据集训练，并计划增加更多功能。它为医学图像分析领域提供了一个功能强大、使用灵活的开源工具。
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