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Raphtory

Rust编写的高性能图数据库 支持时间旅行和复杂分析

Raphtory是一款高性能图数据库,支持大规模数据处理和复杂分析。具备时间旅行、全文搜索等特性,适用于各类图数据应用场景。易于安装和集成,为复杂图数据分析提供强大支持。


Raphtory

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Raphtory是一个用Rust编写的内存向量化图数据库,提供友好的Python API。它速度极快,可在笔记本电脑上扩展到数亿条边,只需通过pip install raphtory就可以轻松集成到您现有的工作流程中。

它支持时间旅行、全文搜索、多层建模,以及超越简单查询的高级分析,如自动风险检测、动态评分和时间模式分析。

如果您想贡献代码,请查看开放的问题列表悬赏板,或直接在Slack上联系我们。成功的贡献将获得丰厚的奖励!

安装Raphtory

Raphtory可用于Python和Rust。

对于Python,您必须使用3.8或更高版本,可以通过pip安装:

pip install raphtory

对于Rust,Raphtory托管在crates上,适用于Rust 1.77或更高版本,可以通过cargo add将其添加到您的项目中:

cargo add raphtory

运行基本示例

以下是使用我们的Python API时Raphtory的简单示例。如果您喜欢所看到的内容,可以在这里深入学习完整教程。

from raphtory import Graph
from raphtory import algorithms as algo
import pandas as pd

# 创建一个新图
graph = Graph()

# 向图中添加一些数据
graph.add_node(timestamp=1, id="Alice")
graph.add_node(timestamp=1, id="Bob")
graph.add_node(timestamp=1, id="Charlie")
graph.add_edge(timestamp=2, src="Bob", dst="Charlie", properties={"weight": 5.0})
graph.add_edge(timestamp=3, src="Alice", dst="Bob", properties={"weight": 10.0})
graph.add_edge(timestamp=3, src="Bob", dst="Charlie", properties={"weight": -15.0})

# 检查图中唯一节点/边的数量以及最早/最晚时间
print(graph)

results = [["earliest_time", "name", "out_degree", "in_degree"]]

# 使用滚动窗口收集图历史中的一些简单节点指标
for graph_view in graph.rolling(window=1):
    for v in graph_view.nodes:
        results.append(
            [graph_view.earliest_time, v.name, v.out_degree(), v.in_degree()]
        )

# 打印结果
print(pd.DataFrame(results[1:], columns=results[0]))

# 获取一条边,探索其"weight"的历史
cb_edge = graph.edge("Bob", "Charlie")
weight_history = cb_edge.properties.temporal.get("weight").items()
print(
    "Bob和Charlie之间的边有以下权重历史:", weight_history
)

# 比较时间2和时间3之间的权重
weight_change = cb_edge.at(2)["weight"] - cb_edge.at(3)["weight"]
print(
    "Bob和Charlie之间的边的权重变化了",
    weight_change,
    "点",
)

# 运行PageRank并询问排名最高的节点
top_node = algo.pagerank(graph).top_k(1)
print(
    "图中最重要的节点是",
    top_node[0][0],
    ",得分为",
    top_node[0][1],
)

输出:

Graph(number_of_edges=2, number_of_nodes=3, earliest_time=1, latest_time=3)

|   | earliest_time | name    | out_degree | in_degree |
|---|---------------|---------|------------|-----------|
| 0 | 1             | Alice   | 0          | 0         |
| 1 | 1             | Bob     | 0          | 0         |
| 2 | 1             | Charlie | 0          | 0         |
| 3 | 2             | Bob     | 1          | 0         |
| 4 | 2             | Charlie | 0          | 1         |
| 5 | 3             | Alice   | 1          | 0         |
| 6 | 3             | Bob     | 1          | 1         |
| 7 | 3             | Charlie | 0          | 1         |

Bob和Charlie之间的边有以下权重历史: [(2, 5.0), (3, -15.0)]

Bob和Charlie之间的边的权重变化了 20.0 点

图中最重要的节点是 Charlie,得分为 0.4744116163405977

GraphQL

作为Python API的一部分,您可以在Raphtory的GraphQL服务器中托管您的数据。这使得将您的图形分析与Web应用程序集成变得非常简单。

以下是创建图、运行托管此数据的服务器以及使用我们的GraphQL客户端直接查询的简单示例。

from raphtory import Graph
from raphtory.graphql import RaphtoryServer
import pandas as pd

# 我们主要教程中指环王数据的URL
url = "https://raw.githubusercontent.com/Raphtory/Data/main/lotr-with-header.csv"
df = pd.read_csv(url)

# 从数据框加载指环王图
graph = Graph.load_from_pandas(df,"src_id","dst_id","time")

#创建可查询图的字典并使用它启动graphql服务器。这将返回一个我们可以用来查询的客户端
client = RaphtoryServer({"lotr_graph":graph}).start()

#等待服务器启动
client.wait_for_online()
```python
#运行一个基本查询,获取角色的名称和度数
results = client.query("""{
             graph(name: "lotr_graph") {
                 nodes {
                     name
                     degree
                    }
                 }
             }""")

print(results)

输出:

加载边: 100%|██████████████| 2.65K/2.65K [00:00<00:00, 984Kit/s]
游乐场: http://localhost:1736
{'graph': 
    {'nodes': 
        [{'name': 'Gandalf', 'degree': 49}, 
         {'name': 'Elrond', 'degree': 32}, 
         {'name': 'Frodo', 'degree': 51}, 
         {'name': 'Bilbo', 'degree': 21}, 
         ...
        ]
    }
}

GraphQL 游乐场

当你托管一个Raphtory GraphQL服务器时,你会得到一个捆绑的网页游乐场,可以在浏览器中通过相同的端口访问(默认为1736)。在这里你可以在你的图上试验查询并探索模式。下面可以看到游乐场的一个例子,运行的是与上面Python示例相同的查询。

GraphQL 游乐场

入门

为了帮助你快速上手Raphtory,我们在Raphtory网站上提供了一整套教程:

如果你更喜欢API文档,可以直接在这里深入了解!

在线笔记本沙盒

想尝试一下,但无法安装?通过我们的交互式Jupyter笔记本查看Raphtory的运行情况!只需点击下面的徽章即可在线启动Raphtory沙盒,无需安装。

Binder

社区

加入不断壮大的开源爱好者社区,使用Raphtory来推动你的图分析!

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  • 加入我们的 Slack 与我们聊天并获得问题的答案!

贡献者

悬赏板

Raphtory目前正在为贡献提供奖励,如新功能或算法。贡献者将获得纪念品和奖品!

要开始,请查看我们的所需算法列表,其中包括一些容易实现的低挂果实(🍇)。

基准测试

我们托管了一个页面,在每次推送到主分支时触发并保存两个基准测试的结果。在这里查看。

许可证

Raphtory根据GNU通用公共许可证v3.0的条款获得许可(请查看我们的LICENSE文件)。

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