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生物医学数据集库促进机器学习研究

BigBIO生物医学数据集自然语言处理机器学习数据标准化Github开源项目

BigBIO是一个基于Huggingface datasets库开发的生物医学数据加载器库。该项目提供超过126个生物医学数据集的轻量级访问，覆盖10余种语言和12个任务类别。BigBIO致力于提高数据处理的可重复性，完善数据集来源和许可等属性的文档，并简化自然语言提示和多任务学习的元数据集生成。此外，BigBIO还支持多个主流英语生物医学基准测试中的大部分数据集。

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介绍相关项目
loghub - 系统日志数据集资源库 促进AI日志分析研究
AI分析GithubLoghub开源项目日志数据集系统日志
Loghub汇集了多个领域的原始系统日志数据集，包括分布式系统、超级计算机和操作系统等。这些未经处理的数据集保留了原始特征，为AI日志分析研究提供了重要资源。项目已获得450多个学术和工业组织的使用，并提供数据集下载和相关研究论文引用，全面支持日志分析研究。
PULSE - PULSE中文医疗AI模型，处理健康教育和医疗记录
Elo评测GithubPULSE中文医疗大语言模型医学自然语言处理大规模训练开源项目
PULSE是一款专注于中文医疗领域的大语言模型，经过约400万个医学和通用数据的微调训练。它支持多种自然语言处理任务，如健康教育、医师考试、报告解读和医疗记录结构化等。模型提供7B和20B参数版本供下载。注意，虽然模型可生成疾病诊断和治疗建议，但不能替代专业医生的意见。PULSE通过多项数据集及私有数据集的Elo Rating tournament方法验证，性能表现优异。
tuva - 综合医疗数据分析平台 支持多种数据仓库
GithubTuva Project医疗分析开源开源项目数据模型术语集
Tuva Project是一个开源医疗数据分析平台，集成了核心数据模型、数据集市、术语集和数据质量测试功能。该项目支持BigQuery、Databricks、Snowflake等多种数据仓库，适配dbt 1.3.x及更高版本。Tuva Project致力于简化健康数据处理流程，促进医疗数据从业者知识共享。开发者可在GitHub上访问项目代码、术语集和价值集，并通过Slack社区交流经验。
meditron - 医疗大语言模型助力临床决策支持
GithubLlama-2Meditron医学推理医疗大语言模型开源开源项目
Meditron是一套开源医疗大语言模型，包含7B和70B两个版本。这些模型基于Llama-2，通过在医学语料库上持续预训练而来。Meditron-70B在医学推理任务中的表现超越了Llama-2-70B、GPT-3.5和Flan-PaLM。虽然Meditron旨在提升临床决策支持，但在实际医疗应用中仍需谨慎，并进行充分的测试和临床试验。
Data-science - 数据科学项目的综合资源库和实践指南
GitHubGithubMLOpsPython开源项目数据科学机器学习
Data-science项目汇集了丰富的数据科学资源，涵盖MLOps、数据管理、测试和生产力工具等领域。通过文章、代码和视频教程，该项目全面展示了数据科学工作流程，从项目管理到部署。它为数据科学家和机器学习工程师提供了提高效率、构建可靠项目的实用指南。
medAlpaca - 医疗问答大语言模型套件 助力智能医疗对话
GithubMedAlpaca医疗问答大语言模型开源开源项目微调
medAlpaca是一个医疗问答大语言模型项目,基于Stanford Alpaca和AlpacaLoRA开发。该项目提供经过医学文本微调的开源语言模型,可用于开发医疗聊天机器人。medAlpaca使用多种医学数据进行训练,包括医学闪卡、维基和对话数据集。项目还提供详细的数据集描述、训练指南和基准测试结果,旨在推动医疗领域大语言模型的研究与应用。
clinica - 多模态神经影像分析平台 支持临床研究
BIDS标准ClinicaGithub临床神经影像开源项目数据处理管道机器学习
Clinica是一个开源的临床神经影像研究软件平台，支持多模态数据处理。平台提供多种处理流程，用于分析T1加权MRI、弥散MRI和PET数据。它可将公开数据集转换为BIDS格式，并集成机器学习和深度学习技术。Clinica为神经退行性疾病研究提供了有力工具，尤其适用于阿尔茨海默病等领域。
arvados - 管理处理大规模科学和生物医学数据的开源平台
ArvadosGithub大数据处理工作流管理开源平台开源项目生物信息学
Arvados是一个专注于管理、处理和共享大规模科学和生物医学数据的开源平台。其核心组件包括Keep存储系统、Crunch工作流程编排系统、Workbench网络应用和多种开发工具。平台支持生物信息学家扩展计算密集型工作流程，便于开发人员创建生物医学应用，并助力IT管理员管理大规模资源。Arvados特别注重数据溯源和工作流程可重复性，广泛适用于科研和医疗领域。
dataset-viewer - 全面的数据集浏览支持与管理工具
APIGitHubGithubHugging Facebugsdataset viewer开源项目
Dataset viewer 通过 API 提供预处理数据，方便用户浏览和管理 Hugging Face Hub 上的所有数据集。用户可分页查看数据，每页包含 100 行，并通过底部按钮进行导航、过滤、搜索数据和查看基本统计信息。前端组件未开源，遇到问题或需要新功能，可以通过 GitHub 反馈。用户还可通过贡献想法、回答问题、报告错误与改进建议来支持项目改进。
model-zoo - MONAI Model Zoo 提供医学影像模型集合
GithubMONAI Model Zoo医学影像模型开源项目模型下载模型使用贡献指南
MONAI Model Zoo是一个医学影像模型集合，提供MONAI Bundle格式模型。项目包含多种医学影像模型，支持快速下载和使用。除了模型资源，还提供模板bundles，便于开发自定义模型。每个bundle都有详细使用说明和许可条件。MONAI Model Zoo遵循Apache许可证，为医学影像研究和应用提供了有价值的资源。
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