PopTorch 和 PopTorch Geometric
PopTorch - 用于 Graphcore IPU 的 PyTorch 集成
PopTorch 是一套 PyTorch 扩展,使模型能够在 Graphcore IPU 上进行训练、评估和使用。
更多信息可以在 PopTorch 用户指南 中找到。
PopTorch Geometric - 用于 Graphcore IPU 的 PyTorch Geometric 集成
PopTorch Geometric 是一套 PyTorch Geometric 扩展,使图神经网络模型能够在 Graphcore IPU 上进行训练、评估和使用。PopTorch Geometric 依赖于 PopTorch 提供的功能。
更多信息可以在 PopTorch Geometric 用户指南 中找到。
先决条件
这些说明假设你在 Ubuntu 20.04 上构建 PopTorch 和 PopTorch Geometric。
要安装和运行 PopTorch 和 PopTorch Geometric,你需要:
- Python 3.8
- pip3 >= 18.1
- Poplar SDK
sudo apt install -y python3 python3-pip
要从源代码构建 PopTorch 和 PopTorch Geometric,除了上述条件外,你还需要:
- git
- curl
- g++
sudo apt install -y git curl g++
要构建文档,你还需要 LaTeX:
sudo apt install -y texlive-full
安装 Poplar SDK
可以从以下地址下载 Poplar SDK:https://www.graphcore.ai/downloads
设置以下环境变量以指向已安装的 Poplar SDK:
export SDK_PATH=/path/to/poplar_sdk-ubuntu_20_04*
PopTorch 必须与兼容版本的 SDK 一起构建。例如,PopTorch 的 "sdk-release-3.2" 分支必须与 Poplar SDK 3.2 一起构建。
安装
确保 pip3
是最新版本(你需要 pip3 >= 18.1
):
pip3 install -U pip --user
安装 PopTorch wheel(Torch 将在此过程中自动安装):
pip3 install ${SDK_PATH}/poptorch-*.whl
一旦 PopTorch wheel 安装完成,如果需要,可以安装 PopTorch Geometric wheel(PyTorch Geometric 将在此过程中自动安装):
pip3 install ${SDK_PATH}/poptorch_geometric-*.whl
使用
PopTorch wheel 不包含 PopART 和 Poplar 二进制文件,所以在加载 PopTorch 或 PopTorch Geometric 之前,你需要确保它们在你的路径中。这可以通过执行它们各自的 enable.sh
脚本来完成:
. ${SDK_PATH}/poplar-ubuntu_20_04*/enable.sh
. ${SDK_PATH}/popart-ubuntu_20_04*/enable.sh
你可以通过运行以下命令来检查一切是否正常:
python3 -c "import poptorch;print(poptorch.__version__)"
同样适用于 PopTorch Geometric:
python3 -c "import poptorch_geometric;print(poptorch_geometric.__version__)"
更多信息可以在 PopTorch 用户指南 中找到。
构建说明
我们使用 Mambaforge 作为构建环境管理器。
- 克隆 PopTorch 仓库
git clone https://github.com/graphcore/poptorch.git
- 创建一个用于构建的文件夹
mkdir build
cd build
- 创建构建环境并安装依赖项
../poptorch/scripts/create_buildenv.py
- 激活构建环境
. activate_buildenv.sh
- 配置构建
cmake ../poptorch -DSDK_DIR=${SDK_PATH} -GNinja
默认情况下,PopTorch 将以发布模式构建。要以调试模式构建,请添加 -DCMAKE_BUILD_TYPE=Debug
。
要构建文档,请添加 -DBUILD_DOCS=ON
。HTML 和 PDF 文档将生成在 docs/
目录中。
- 编译 PopTorch 和 PopTorch Geometric 库
ninja install
如果你只打算将 PopTorch 或 PopTorch Geometric 用于开发目的,那么到这里就可以停止了。 在 PopTorch 构建文件夹中执行 enable 脚本,然后你就可以开始使用 PopTorch:
. enable.sh
python3 -c "import poptorch;print(poptorch.__version__)"
同样适用于 PopTorch Geometric:
. enable.sh
python3 -c "import poptorch_geometric;print(poptorch_geometric.__version__)"
- (可选)构建 PopTorch wheel 包
ninja poptorch_wheel
wheel 包将创建在 install/dist
目录中。
- (可选)构建 PopTorch Geometric wheel 包
ninja poptorch_geometric_wheel
wheel 包将创建在 install/dist
目录中。
运行测试
要运行测试:
# 运行所有测试,仅在失败时打印输出,并行运行 80 个测试
./test.sh -j80
# PopTorch 有 3 个测试标签:examples、short、long。要运行除 long 之外的所有测试:
./test.sh -j80 -LE long
# 仅运行 short 测试
./test.sh -j80 -L short
# 使用 -R 按名称筛选测试
./test.sh -j80 -R half_
# 获取更多信息:
./test.sh --help
注意:如果你并行运行测试,请确保告诉 PopTorch 在所有 IPU 都在使用时等待一个 IPU 可用:
export POPTORCH_WAIT_FOR_IPU=1
也可以使用 pytest
单独运行测试:
. enable.sh
python3 -m pytest ../poptorch/tests/options_test.py
# 添加 -s 以获取完整输出
# 使用 -k 按名称筛选测试
python3 -m pytest ../poptorch/tests/options_test.py -s -k popart
图神经网络特定的测试位于 tests/gnn/
子目录中:
. enable.sh
python3 -m pytest ../poptorch/tests/gnn/test_basic_gnn.py
# 添加 -s 以获取完整输出
# 使用 -k 按名称筛选测试
python3 -m pytest ../poptorch/tests/gnn/test_basic_gnn.py -s -k GraphSAGE
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