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nucleotide-transformer

Transformer驱动的基因组语言及单核苷酸序列分割模型

Nucleotide TransformersSegmentNTgenomics预训练模型DNA序列解析Github开源项目

nucleotide-transformer项目提供了九种预训练基因组语言模型和两种SegmentNT分割模型。基于Transformer的基因组模型综合了3,200个人类基因组和850个不同物种的基因组数据，能够高精度预测分子表型。Agro NT模型专用于农作物基因组，在基因调控和表达预测上表现优异。这些模型可以实现对DNA序列基因组元素的单核苷酸分辨率分割。

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介绍相关项目
LucaOne - 整合核酸和蛋白质语言的通用生物模型
GithubLucaOne下游任务开源项目生物基础模型统一核酸和蛋白质语言预训练任务
LucaOne是一个整合核酸和蛋白质语言处理的生物基础模型。通过多任务预训练，该模型实现了DNA、RNA和蛋白质序列的高效表示学习。在序列分类、结构预测等多个下游任务中，LucaOne展现出优异性能。项目开源了训练数据、代码和预训练模型，为生物信息学研究提供了实用工具。
FasterTransformer4CodeFuse - 优化的CodeFuse模型推理引擎 高性能支持
CodeFuseFasterTransformerGithub开源项目性能优化模型推理量化
FasterTransformer4CodeFuse是一个针对蚂蚁集团CodeFuse模型的优化推理引擎。它实现了Int8量化、流式输出和快速模型加载，同时改进了提示词处理并提供Python API。项目还支持多GPU tensor并行推理，并提供了详细的性能数据。相比原始FasterTransformer，该项目更适合需要高效推理CodeFuse模型的开发者和研究人员，能够显著提升性能和使用体验。对于寻求高效CodeFuse模型部署方案的团队，这是一个值得考虑的开源选择。
CTranslate2 - 高效的Transformer模型推理库，提供多种性能优化方案
CTranslate2Github并行执行开源项目性能优化模型压缩转换器模型
CTranslate2是一个用于Transformer模型高效推理的C++和Python库，通过权重量化、层融合、批次重排序等技术，显著提升CPU和GPU上的执行速度并减少内存占用。支持多种模型类型，包括编码器-解码器、仅解码器和仅编码器模型，兼容OpenNMT-py、OpenNMT-tf、Fairseq等框架。其主要特点包括自动CPU检测、代码分发、并行和异步执行以及动态内存使用。
sat-3l - 高效的多语言句子分割模型
GithubHuggingfaceTransformersat-3lwtpsplit句子分割多语言开源项目模型
sat-3l模型利用三层Transformer实现了先进的多语言句子分割，提升了文本处理的效率与精准度。详细信息请参阅Segment any Text相关论文。
Transformers-for-NLP-2nd-Edition - BERT到GPT-4的Transformer模型详解
BERTGPT-4GithubOpenAI APITransformers-for-NLP-2nd-Edition开源项目机器学习
本项目涵盖了从BERT到GPT-4的Transformer模型，提供了在Hugging Face和OpenAI环境下的微调、训练及提示工程示例。还包括ChatGPT、GPT-3.5-turbo、GPT-4和DALL-E的使用示例，包括语音到文本、文本到语音、文本到图像生成等内容。详述了GPT-4 API提示工程和最新平台更新，提供实用的指导与教程。
BitNet - 高效压缩大型语言模型的1比特变压器实现
1比特变换器BitNetGithubPyTorch实现大语言模型开源项目模型压缩
BitNet是一种创新的1比特变压器实现，通过BitLinear层替换标准线性投影，实现大型语言模型的高效压缩。该项目提供PyTorch实现，包含BitLinear、BitNetTransformer和BitAttention等核心组件，支持推理和Hugging Face模型集成。BitNet还探索了视觉任务应用，展现了多模态领域的潜力。项目包括训练脚本、性能基准测试和CUDA优化，为研究人员和开发者提供了全面的工具集。
a-PyTorch-Tutorial-to-Transformers - PyTorch实现Transformer模型的详细教程与实践指南
GithubPyTorchTransformer开源项目机器翻译注意力机制编码器-解码器架构
本项目提供了一个基于PyTorch的Transformer模型实现教程。教程深入讲解了Transformer的核心概念,如多头注意力机制和编码器-解码器架构,并以机器翻译为例展示应用。内容涵盖模型实现、训练、推理和评估等环节,适合想要深入理解和应用Transformer技术的学习者。
ctrl - 条件Transformer语言模型的功能与应用
CTRLGithubHuggingface偏见和限制开源项目文本生成模型训练数据语言模型
CTRL模型由Salesforce Research开发，是基于Transformer的语言模型，可以通过控制码实现文本的可控生成。模型适用于创意写作、自动化写作任务及特定格式文本的生成，并可通过微调优化其他自然语言处理应用。其训练数据包括来自多个领域的140GB文本数据，使用TPU v3 Pod及Adagrad优化器进行训练，并评估了环境影响。
table-transformer-structure-recognition-v1.1-all - Table Transformer开源表格结构识别模型
GithubHuggingfaceTable Transformer开源项目文档分析模型深度学习表格识别计算机视觉
Table Transformer是一个开源的表格结构识别模型，基于DETR架构设计。该模型在PubTables1M和FinTabNet.c数据集上进行了预训练，采用'normalize before'设置优化了网络结构。Table Transformer能够准确检测文档中的表格，为表格结构分析提供了有力支持。项目提供了详细文档，便于研究人员和开发者进行深入研究和实际应用。
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