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ncps

NCP、LTC 和 CfC 有线神经模型的 PyTorch 和 TensorFlow 实现

神经电路策略(NCPs)是一种设计稀疏递归神经网络的方法,灵感来源于秀丽隐杆线虫的神经系统。该开源项目提供与PyTorch和TensorFlow兼容的模块,增强可审计的自主性。其安装步骤简便,并且提供了丰富的文档和互动教程,帮助用户从基础到复杂模型的创建。多种示例和教程,包括在Google Colab上的演示,让用户快速掌握NCPs的应用。

神经回路策略(适用于 PyTorch 和 TensorFlow)

DOI ci_badge pyversion PyPI version Documentation Status downloads

📜 论文

神经回路策略实现可审计自主性(开放获取)
闭形式连续时间神经网络(开放获取)

神经回路策略(NCPs)是设计稀疏循环神经网络,其灵感来自于有机体C. elegans的神经系统。 本包的目标是使在 PyTorch 和 keras 中使用 NCP 变得尽可能简单。

📖 文档

import torch
from ncps.torch import CfC

rnn = CfC(20,50) # (输入, 隐藏单元)
x = torch.randn(2, 3, 20) # (批量, 时间, 特征)
h0 = torch.zeros(2,50) # (批量, 单元)
output, hn = rnn(x,h0)

安装

pip install ncps

🔖 Colab 笔记本

我们创建了一些 Google Colab 笔记本,用于对该包进行交互式介绍

端到端示例

使用:模型和连接结构

该包提供了两种模型,液体时间常数(LTC)和闭形式连续时间(CfC)模型。 两种模型都可以作为 tf.keras.layers.Layertorch.nn.Module RNN 层使用。

from ncps.torch import CfC, LTC

input_size = 20
units = 28 # 28 个神经元
rnn = CfC(input_size, units)
rnn = LTC(input_size, units)

上述 RNN 认为是全连接层,即像 LSTM、GRUs 和其他 RNN 一样。 NCPs 的独特之处在于它们的结构化连接图。 要将 LTC 或 CfC 模型与

from ncps.torch import CfC, LTC
from ncps.wirings import AutoNCP

wiring = AutoNCP(28, 4) # 28 个神经元,4 个输出
input_size = 20
rnn = CfC(input_size, wiring)
rnn = LTC(input_size, wiring)

alt

Tensorflow

通过 ncps.tf 模块可以使用 Tensorflow 绑定。

from ncps.tf import CfC, LTC
from ncps.wirings import AutoNCP

units = 28
wiring = AutoNCP(28, 4) # 28 个神经元,4 个输出
input_size = 20
rnn1 = LTC(units) # 全连接 LTC
rnn2 = CfC(units) # 全连接 CfC
rnn3 = LTC(wiring) # NCP 连接的 LTC
rnn4 = CfC(wiring) # NCP 连接的 CfC

然后我们可以将 NCP 单元与任意的 tf.keras.layers 结合,例如构建一个强大的图像序列分类器:

from ncps.wirings import AutoNCP
from ncps.tf import LTC
import tensorflow as tf
height, width, channels = (78, 200, 3)

ncp = LTC(AutoNCP(32, output_size=8), return_sequences=True)

model = tf.keras.models.Sequential(
    [
        tf.keras.layers.InputLayer(input_shape=(None, height, width, channels)),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(
            tf.keras.layers.Conv2D(32, (5, 5), activation="relu")
        ),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(tf.keras.layers.MaxPool2D()),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(
            tf.keras.layers.Conv2D(64, (5, 5), activation="relu")
        ),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(tf.keras.layers.MaxPool2D()),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(tf.keras.layers.Flatten()),
        tf.keras.layers.TimeDistributed(tf.keras.layers.Dense(32, activation="relu")),
        ncp,
        tf.keras.layers.TimeDistributed(tf.keras.layers.Activation("softmax")),
    ]
)
model.compile(
    optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(0.01),
    loss='sparse_categorical_crossentropy',
)
@article{lechner2020neural,
  title={Neural circuit policies enabling auditable autonomy},
  author={Lechner, Mathias and Hasani, Ramin and Amini, Alexander and Henzinger, Thomas A and Rus, Daniela and Grosu, Radu},
  journal={Nature Machine Intelligence},
  volume={2},
  number={10},
  pages={642--652},
  year={2020},
  publisher={Nature Publishing Group}
}
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