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foldseek

高效精准的大规模蛋白质结构比对工具

Foldseek蛋白质结构比对结构搜索结构聚类蛋白质复合物Github开源项目

Foldseek是一款用于大规模蛋白质结构集比对的开源工具。它能快速、敏感地比较海量蛋白质结构,支持对AlphaFoldDB和PDB等数据库进行搜索。Foldseek提供命令行界面和网页服务器,可进行结构搜索、聚类和多聚体比对。采用创新的3Di+AA结构对齐算法,在保证准确性的同时显著提升速度。Foldseek为结构生物学研究提供高效可靠的计算支持,助力蛋白质结构分析。

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介绍相关项目
PubCompare - 实验协议智能搜索与分析系统
AI工具PubCompare实验协议文献比较研究方法科研工具
PubCompare整合了超过4000万个实验协议的数据库和搜索功能。通过人工智能技术，该平台能快速对比和评估协议的相关性及引用情况。系统提供智能注释、关键步骤分析和可重复性评估等功能，有助于降低实验失败率，提升研究效率。PubCompare为研究人员提供丰富的协议资源和分析工具，支持制定更为可靠的实验方案。
DeepSeek-V2 - 兼顾效率与经济性的大规模混合专家语言模型
DeepSeek-V2Github大语言模型开源项目混合专家模型自然语言处理预训练模型
DeepSeek-V2是一款基于专家混合(MoE)架构的大规模语言模型,总参数量达2360亿,每个token激活210亿参数。相较于DeepSeek 67B,该模型在提升性能的同时,显著降低了训练成本和推理资源消耗。DeepSeek-V2在多项标准基准测试和开放式生成任务中表现优异,展现了其在多领域的应用潜力。
DiscovAI-search - 精准的AI工具搜索引擎，帮助高效发现AI产品
AI搜索引擎DiscovAIGithubLLMRedisSupabase开源项目
DiscovAI通过向量搜索、Redis缓存和大语言模型，为用户提供快速且精准的AI工具搜索服务。无需注册即可免费体验。采用Next.js、Vercel AI SDK、Supabase、Pgvector和Upstash等技术，确保界面友好、导航便利。适用于AI爱好者、开发者和研究人员，帮助轻松找到所需的AI工具和解决方案。
awesome-deepseek-coder - DeepSeek Coder开源资源汇总助力智能代码开发
DeepSeek CoderGithub人工智能代码生成开源项目模型
本项目收集整理了DeepSeek Coder相关的开源资源,涵盖官方和社区开发的各种规模模型、量化版本及配套工具。DeepSeek Coder作为高效的代码生成和理解模型,广泛应用于智能编程辅助和代码补全等场景。开发者可通过此资源列表深入了解和使用DeepSeek Coder,促进AI辅助编程技术的应用与创新。
misato-dataset - 大规模蛋白质-配体复合物数据集助力AI驱动的药物发现
AI模型GithubMISATO分子动力学开源项目药物发现蛋白质-配体复合物
MISATO是一个专为结构化药物发现设计的机器学习数据集，包含高质量的蛋白质-配体复合物数据。数据集涵盖了19000多个配体的量子力学计算结果和16000多个蛋白质-配体结构的分子动力学模拟。MISATO旨在提高配体分子精确度、合理表示系统动力学，并促进创新AI药物发现模型的开发。研究人员可免费下载MISATO数据集，使用提供的PyTorch数据加载器进行AI训练和预测。
SeekAll - 多引擎搜索对比浏览器插件
AI工具AI搜索SeekAll多引擎搜索效率工具浏览器插件
SeekAll是一款浏览器多屏助手，支持一键打开多个搜索引擎进行结果对比。内置Perplexity、ThinkAny、Devv等AI搜索引擎，以及Google、Bing等传统搜索引擎。最新版本新增自定义搜索引擎功能和侧边栏垂直标签页模式，优化了搜索效率和标签管理。该插件旨在帮助用户快速在多个窗口中搜索信息，提高信息获取效率。
Prefind - AI智能搜索引擎 整合GPT-4和Claude-3技术
AI工具AI搜索引擎Chrome扩展Claude-3GPT-4Prefind
Prefind是一款集成GPT-4和Claude-3 Opus技术的智能搜索引擎，能准确理解搜索意图，快速提供精准结果。支持多模型对比，具备深度理解能力，搜索速度快捷。免费使用无需注册，可与主流搜索引擎配合。Prefind不仅是搜索引擎，还是持续进化的AI助手，适用于学术研究、在线学习和日常信息检索。其强大的自然语言处理能力让复杂查询变得简单，为用户提供个性化、高质量的搜索体验。
zincsearch - 高效轻量的全文搜索引擎 资源占用低于Elasticsearch
Elasticsearch替代品GithubZincSearch全文搜索引擎开源开源项目轻量级
ZincSearch是一款高效轻量的全文搜索引擎，作为Elasticsearch的替代方案，它仅需少量资源即可运行。ZincSearch采用bluge作为底层索引库，提供直观的操作界面，支持快速部署。该引擎具备全文索引、单一二进制文件安装、Web界面、Elasticsearch API兼容性、内置身份验证和无模式设计等特性。ZincSearch主要适用于应用搜索场景，可处理数百GB级别的数据，并且完全开源。
pagefind - 无需基础设施的静态网站搜索库
GithubPagefind带宽优化开源项目无服务器网站搜索静态搜索
Pagefind是一个全静态搜索库，适用于大型网站，能够最小化用户带宽占用，无需额外基础设施。该库为静态网站提供高效搜索功能，具有轻量级和易集成的特点，无需复杂后端配置即可实现。详细使用文档可在官方网站 pagefind.app 查阅。
client-vector-search - 高性能的客户端向量搜索库，支持浏览器和服务器端
Githubclient-vector-search余弦相似度嵌入技术开源项目搜索库索引创建
client-vector-search是一个高效的客户端向量搜索库，支持嵌入、搜索和缓存操作，适用于浏览器和服务器端。该库默认使用transformers进行文档嵌入，计算嵌入间的余弦相似度，支持客户端索引创建和搜索，并具有浏览器缓存功能。相比OpenAI和Pinecone等VectorDB，它具有更快的性能和更高的效率，特别适用于快速处理数百到数千个向量的应用场景。该项目将持续维护和改进，并计划引入HNSW索引等新功能。
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