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SOTA-MedSeg

医学图像分割前沿挑战与顶级方法概览

医学图像分割MICCAIU-Net深度学习挑战赛Github开源项目

SOTA-MedSeg项目汇总了医学图像分割领域的前沿挑战和顶级方法。涵盖头部、颈部、心脏和腹部等多个身体部位的分割任务,包括脑肿瘤、主动脉瘤和肾脏肿瘤等疾病。项目列出各大挑战赛的最佳方法及性能指标,提供相关论文和代码链接,是了解医学图像分割最新进展的综合资源。

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介绍相关项目
LibtorchSegmentation - 高性能C++图像分割库
C++库GithubLibTorch图像分割开源项目神经网络预训练模型
LibtorchSegmentation是基于LibTorch的C++图像分割库，提供高级API和多种模型架构。支持15种预训练编码器，推理速度比PyTorch CUDA快35%。该库简单易用yet功能强大，适合快速开发和部署各类图像分割应用。
segmentation_models.pytorch - 基于PyTorch的神经网络图像分割库
GithubPyTorch图像分割开源项目神经网络编码器预训练模型
segmentation_models.pytorch 是一个基于 PyTorch 的图像分割库,提供9种分割模型架构和124种编码器。该库 API 简洁,支持预训练权重,并包含常用评估指标和损失函数。它适用于研究和实际应用中的各种图像分割任务,是图像分割领域的实用工具。
clipseg-rd64-refined - 基于文本和图像提示的先进图像分割策略
CLIPSegGithubHuggingface一样本学习图像分割复杂卷积开源项目模型零样本学习
该模型引入先进的复杂卷积技术，支持零样本和单样本图像分割。结合文本与图像提示，该模型在图像分析中提供高效且准确的分割性能。
medspacy - 临床NLP工具库，提供多语言支持和多功能文本处理
GithubmedspaCyspaCy临床文本处理医学NLP开源项目自然语言处理
medspacy是一款基于spaCy框架的临床NLP工具库，提供句子分割、上下文分析、属性识别和章节检测等模块化功能。它适用于临床文本的处理和分析，支持多语言并鼓励扩展更多语言规则。各模块可独立使用，包括概念提取、实体后处理和数据可视化等功能。
HistoSSLscaling - 病理组织图像自监督学习新方法
GithubPhikonViT开源项目掩码图像建模组织病理学自监督学习
HistoSSLscaling项目开发了基于掩码图像建模的自监督学习方法，用于病理组织图像分析。该项目的Phikon模型在4000万张全癌种病理切片上预训练，在多项下游任务中表现出色。项目提供了预训练模型、代码和数据集特征，为计算病理学研究提供支持。
tutorials - 涵盖2D和3D分类、分割、回归及配准任务实例MONAI教程
2D分割3D分割GithubJupyter NotebookMONAIPyTorch开源项目
本资源库包含详尽的MONAI教程，涵盖2D和3D分类、分割、回归及配准任务实例。教程演示如何使用Matplotlib和Jupyter Notebook在PyTorch和MONAI中进行医学图像处理和深度学习操作，并提供Colab环境下的GPU加速指南及数据处理和问题解决方法。教程还介绍了模型部署、实验管理、联邦学习和数字病理学实例，帮助用户掌握和应用MONAI功能。
research-contributions - MONAI驱动的医学影像研究展示平台
GithubMONAI代码实现同行评审开源协作开源项目研究贡献
MONAI Research Contributions平台展示了使用MONAI进行的前沿医学影像研究。该平台展示MONAI的实际应用，为研究人员提供展示机会。平台接受经同行评审的研究贡献，要求大量使用MONAI组件并提供一键复现结果的脚本。这种方式为展示尖端研究提供快速通道，同时确保代码质量和版本兼容性。
Mask3D - 改进3D语义实例分割方法，兼容多种数据集
3D实例分割GithubICRA 2023Mask3DPyTorchScanNet开源项目
Mask3D是一个提升3D语义实例分割的开源项目，支持ScanNet、ScanNet200、S3DIS和STPLS3D数据集。项目集成了PyTorch、PyTorch Lightning和Hydra工具，提供高效的架构和训练流程，包括数据预处理、模型训练与测试。此外，Mask3D在多个挑战中表现优异，包括在ECCV 2022的Urban3D挑战中获得第二名。
AlizaMS - 多功能DICOM查看器 为医学影像分析提供全面支持
3D渲染DICOMGithub医学影像去识别化多平面重建开源项目
AlizaMS是一款功能全面的DICOM查看器，集成2D和3D视图、体积渲染和多平面重建等核心功能。它具备快速目录扫描和DICOMDIR文件处理能力，同时保证DICOM数据的一致性匿名化。该软件支持RTSTRUCT轮廓显示、多视图研究和超声校准区域精确测量。AlizaMS还提供2D+t和3D+t动画效果，内置DICOM元数据查看器和2024b字典。软件兼容多数IOD类型，包括结构化报告和灰度软拷贝呈现状态。
Entity - 开源工具箱实现开放世界高质量图像分割
EntitySegGithub图像分割开放世界分割开源工具箱开源项目高质量分割
EntitySeg是一个专注于开放世界和高质量图像分割的开源工具箱。它集成了多种前沿算法，如开放世界实体分割、超高分辨率图像分割和类别无关半监督学习。该工具箱支持多个研究项目，应用范围广泛，从基础图像分割到复杂场景理解。EntitySeg为计算机视觉领域的研究人员和开发者提供了实用的工具和资源。
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