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schnetpack

原子级系统深度学习建模工具包

SchNetPack是一个开源的深度学习工具包,用于原子级系统建模。它提供了构建和训练神经网络的基础组件,可预测分子和材料的势能面及量子化学性质。该工具包支持SchNet和PaiNN等先进模型,能够计算偶极矩、极化率等多种属性,并集成了分子动力学模拟功能。SchNetPack简化了新模型的开发和评估流程,为原子级机器学习研究提供了有力支持。

maml - 材料科学机器学习的高级Python接口包
Githubmaml开源项目机器学习材料科学潜在能量面特征工程
maml是一个为材料科学机器学习设计的Python包,提供高级接口简化开发流程。它整合了scikit-learn和tensorflow等机器学习库,以及pymatgen和matminer等材料科学工具,实现特征提取和模型构建。maml支持多种局部环境特征,如双谱系数和Behler-Parrinello对称函数,并包含势能面建模、X射线吸收光谱预测等应用模块。
REINVENT4 - 人工智能驱动的多功能分子设计工具
GithubREINVENT分子设计化学信息学开源项目强化学习迁移学习
REINVENT 4是一款基于强化学习的先进分子设计工具,支持从头设计、骨架跳跃和R基团替换等多种任务。它根据多组分评分标准生成优化分子,并通过迁移学习提高设计效率。该工具兼容Linux、Windows和MacOS平台,支持GPU和CPU运行,为药物研发和化学创新提供了有力支持。
sparseml - 神经网络优化工具,简化代码实现高效稀疏模型
GithubSparseML开源项目推理优化模型优化神经网络稀疏化
SparseML是开源模型压缩工具包,使用剪枝、量化和蒸馏算法优化推理稀疏模型。可导出到ONNX,并与DeepSparse结合,在CPU上实现GPU级性能。适用于稀疏迁移学习和从零开始的稀疏化,兼容主流NLP和CV模型,如BERT、YOLOv5和ResNet-50,实现推理速度和模型大小的显著优化。
corenet - 用于训练多任务深度神经网络的工具库
CoreNetGithub开源项目模型训练深度学习神经网络计算机视觉
CoreNet是一款多功能深度神经网络工具库,支持训练各种规模的标准和创新模型。它适用于基础模型、计算机视觉和自然语言处理等多个领域。该项目提供可复现的训练方案、预训练模型权重和针对Apple Silicon优化的MLX示例,有助于推动AI研究和应用的发展。
deepsnap - 高效灵活的图神经网络库 支持异构图和标准化流程
DeepSNAPGithubNetworkXPyTorch Geometric图深度学习开源项目异构图
DeepSNAP是一个专为图神经网络设计的Python库,连接NetworkX和PyTorch Geometric,提供灵活的图操作和标准化流程。它支持高效的图操作和转换、异构图处理,并提供数据集分割、负采样等功能。DeepSNAP的API易于使用,适用于节点分类、链接预测和图分类等多种图学习任务。
PackPack - 智能一键保存的在线内容管理助手
AI书签管理AI分析AI工具PackPack.AI内容保存智能搜索
PackPack是一款基于AI技术的在线内容管理工具,支持一键保存新闻、社交媒体、文章和图片等多种内容。通过智能搜索、内容摘要和图像分析等功能,实现高效的信息组织和检索。PackPack提供无干扰阅读体验和跨设备同步,是一个便捷的内容收藏和管理解决方案,有助于提升工作和学习效率。
DMFF - 革新分子模拟和力场参数化的全可微分子力场
DMFFGithub分子力场参数优化开源项目机器学习自动微分
DMFF是一个基于Jax的Python包,实现全可微分子力场模型。它简化力场参数化,支持点电荷和多极化模型,适用于水、生物大分子和有机聚合物系统。DMFF集成自动微分技术和AI优化,支持GPU加速,为分子系统研究和力场开发提供高效工具。
Reinvent - 分子设计与优化的开源人工智能工具
GPUGithubPythonREINVENT分子设计开源项目机器学习
REINVENT 3.2是一个开源的分子设计与优化工具,结合深度学习和强化学习技术实现分子生成和优化。该基于Python的项目支持多种运行模式,使用JSON配置文件控制,并利用CUDA加速的GPU进行计算。REINVENT 3.2提供详细的安装指南、系统要求和使用教程,支持Jupyter notebook交互式使用,便于研究人员快速上手和实验。此外,项目还包含单元测试框架,可广泛应用于药物研发和材料设计等领域的分子设计任务。
quacc - 多功能的计算材料科学和量子化学平台
Atomic Simulation EnvironmentGithubquacc工作流管理开源项目计算材料科学量子化学
quacc(Quantum Accelerator)是一个计算材料科学和量子化学平台,专为大数据时代设计。该平台提供预制工作流程,支持本地、HPC和云端运行,通过统一接口兼容多种工作流管理方案。quacc基于原子模拟环境和Materials Project基础设施,整合社区资源。由普林斯顿大学Rosen研究组维护,quacc为研究者提供多功能、高效的计算工具。
torchani - 基于PyTorch的神经网络势能模型库 实现高精度分子动力学模拟
GithubPyTorchTorchANI分子动力学开源项目机器学习神经网络
TorchANI是一个开源的PyTorch实现的ANI神经网络势能模型库。该项目提供高精度分子动力学模拟功能,支持ANI2x、ANI1x和ANI1ccx等多种模型参数。TorchANI具备易用API和GPU加速能力,可通过pip或conda安装。作为活跃维护的开源项目,TorchANI欢迎社区贡献。
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