fastMRI

原始 MRI 测量值和临床 MRI 图像的大规模数据集

fastMRI 磁共振成像人工智能 PyTorch 数据集 Github 开源项目

fastMRI项目通过减少测量数据，加速MRI扫描，降低医疗成本，减轻患者压力。该项目由Facebook AI Research和NYU Langone Health合作，利用AI技术提升MRI速度，发布了包含膝盖和大脑MRI数据的开源数据集。项目提供数据加载、模型训练等相关工具和实现方法。

SegVol - 突破性的通用交互式三维医学影像分割模型

3D建模CT扫描GithubSegVol人工智能医学图像分割开源项目

SegVol是一个创新的通用交互式三维医学影像分割模型，支持点、框和文本提示输入。该模型在96,000个CT扫描数据集上训练，可分割超过200个解剖类别。SegVol开源了推理代码、训练代码、模型参数以及预训练的ViT参数。通过内部和外部验证，SegVol展现出优秀的分割性能，为医学影像分析提供了新的解决方案。

MD.ai - 医学影像AI平台助力放射学报告和数据标注

AI工作流程AI工具DICOM临床报告医疗影像AI数据标注

MD.ai作为医学影像AI平台，专注加速放射学AI模型开发。提供DICOM数据标注工具，应用语言模型优化临床报告。支持多设备同步、多语言操作，具备AI辅助标注、PHI检测功能。助力医疗专业人员构建高质量数据集和AI模型，推动放射学AI技术进步。

SyntheticTumors - 合成肿瘤数据助力AI提升真实肿瘤分割效果

AIGithub医学影像合成肿瘤开源项目深度学习肿瘤分割

SyntheticTumors项目开发了创新策略生成合成肝脏肿瘤数据，用于训练AI模型。研究发现，使用合成肿瘤数据训练的模型在真实肿瘤分割任务中表现优于使用真实肿瘤数据训练的模型。项目提供了多个合成肿瘤示例，展示了其与真实肿瘤的视觉相似性。这种方法为医学影像分析和AI辅助诊断提供了新的研究方向。

biomedical - 生物医学数据集库促进机器学习研究

BigBIOGithub开源项目数据标准化机器学习生物医学数据集自然语言处理

BigBIO是一个基于Huggingface datasets库开发的生物医学数据加载器库。该项目提供超过126个生物医学数据集的轻量级访问，覆盖10余种语言和12个任务类别。BigBIO致力于提高数据处理的可重复性，完善数据集来源和许可等属性的文档，并简化自然语言提示和多任务学习的元数据集生成。此外，BigBIO还支持多个主流英语生物医学基准测试中的大部分数据集。

Awesome-Foundation-Models-in-Medical-Imaging - 医学影像基础模型研究文献资源汇总

Github人工智能医学影像基础模型开源项目深度学习计算机视觉

Pytorch-Medical-Segmentation - 基于PyTorch的医学图像分割框架支持2D和3D多模态分析

GithubPytorch医学图像分割开源项目深度学习神经网络

Pytorch-Medical-Segmentation是一个开源医学图像分割框架，支持2D和3D多模态分析。该项目集成多种先进算法，兼容主流医学影像格式，提供灵活配置选项。内置训练推理流程和评估指标，便于研究人员和开发者快速实现各类医学图像分割任务。

torchio - 深度学习医疗图像处理工具集

GithubPythonTorchIO医药图像开源项目数据增强深度学习

此工具集为深度学习医疗图像处理提供高效解决方案，涵盖读取、预处理、采样、增强和写入3D医疗图像等功能。支持多种图像转换操作，包括随机仿射变换和特定领域伪影模拟。受NiftyNet启发，该项目广泛应用于医学AI研究，提升数据处理效率和模型性能。

ModelsGenesis - 3D医疗影像自监督预训练模型

3D医学影像GithubModels Genesis医学图像分析开源项目自学习迁移学习

此项目推出了名为Generic Autodidactic Models的预训练模型，专为3D医学影像应用设计，特别适合标注数据有限的情况。这一模型通过自监督学习实现自我训练，无需人工标注，并能生成各种应用场景的目标模型。Models Genesis性能显著优于从零开始训练的3D模型，甚至超过了包括ImageNet模型在内的2D方法，尤其在分割肝脏、肿瘤和海马体方面表现卓越。

pytorch_connectomics - PyTorch Connectomics加速大脑神经连接图谱构建

GithubPyTorch Connectomics图像分割开源项目深度学习框架神经连接重建连接组学

PyTorch Connectomics是一个面向神经科学领域的开源深度学习框架，专门用于处理电子显微镜采集的大脑图像数据。该框架支持连接组学中的自动和半自动语义及实例分割，提供多任务学习、主动学习和半监督学习功能。它采用分布式和混合精度优化技术，能高效处理大规模数据集。框架包含多种编码器-解码器架构，如定制3D UNet和特征金字塔网络模型，并提供全面的体积数据增强功能。由哈佛大学视觉计算组维护，PyTorch Connectomics致力于加速大脑神经连接图谱的重建过程。

ffn - 专为大脑组织体积EM数据集实例分割的神经网络

Flood-Filling NetworksGithubTensorFlow图像处理实例分割开源项目神经网络

Flood-Filling Networks (FFNs) 是一种专为复杂大型形状实例分割设计的神经网络模型，特别适用于大脑组织的体积电子显微镜数据集。FFN模型在处理大规模、高分辨率的神经影像数据时表现出色，能够准确识别和分割复杂的神经元结构。该开源项目在FIB-25数据集上展现了优秀性能，为神经科学研究提供了强大的分割工具，适合需要高精度神经元分割的研究人员使用。

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