stk

强大的Python分子构建与操作库

stk Python库分子构建分子设计数据库 Github 开源项目

stk是一个功能丰富的Python库，用于构建和操作复杂分子结构。它支持自动分子设计、分子数据库创建和属性分析。stk提供灵活API，适用于多种化学和材料科学研究。该库已应用于有机笼、共价有机骨架和共轭聚合物等领域的设计与优化研究。

文档

treelib - 简单易用的Python树结构实现库

GithubPython库treelib开源项目数据结构树结构

treelib是一个Python树结构实现库，提供简洁API接口用于创建、管理和操作树形数据结构。该项目支持多个Python版本，拥有完善的文档和活跃的社区。treelib采用black代码格式化规范，保证代码质量。这个库适用于各级开发者，可在多种项目中应用树结构。

mlstacks - 简化MLOps基础设施部署的开源工具

GithubMLOpsMLStacksTerraformZenML基础设施部署开源项目

MLStacks是一个开源Python工具，通过Terraform实现快速部署MLOps基础设施。虽然主要设计用于ZenML，但也兼容其他MLOps工具和平台。用户只需编写YAML规范文件并使用CLI部署，MLStacks即可自动完成剩余工作。目前支持在AWS、GCP和本地K3D上部署模块化MLOps堆栈。该工具旨在简化部署流程，方便用户评估不同MLOps工具组合。

lark - Python解析工具包，灵活高效支持全上下文无关语法

GithubLarkPython上下文无关语法开源项目解析工具包解析树

Lark是一款专为Python设计的解析工具包，注重易用性、性能和模块化。它支持所有上下文无关语法，适用于大多数编程语言和部分自然语言解析。Lark集成了Earley和LALR(1)解析器，并提供多种词法分析器，用户可根据需求平衡功能和速度。该工具包具备出色的歧义处理能力，能自动构建带注释的解析树，同时提供多种高级功能和实用工具。Lark适合各层级用户，从入门者到专业人士均可轻松使用。

fastcore - 扩展Python功能的开源工具库

GithubPythonfastcore多重调度开源项目柯里化混合

fastcore是一个开源Python库，旨在扩展和优化Python的功能。它融合了多种编程语言的优秀特性，包括Julia的多重派发、Ruby的混入和Haskell的柯里化。该库简化了并行处理，优化了标准库，并将NumPy的概念引入Python的list类型。fastcore提供测试函数、混入、委托和组合等功能，支持函数式编程和并行处理。通过多重派发方法和可部分反转的转换管道，fastcore为Python开发者提供了增强编程效率的工具。

streamlit - 将 Python 脚本快速转换为交互式 Web 应用程序的工具

GithubPythonStreamlit开源软件开源项目数据应用社区云平台

Streamlit能够在几分钟内将Python脚本转变为交互式Web应用程序，大大缩短开发时间。用户可以创建仪表板、生成报告或开发聊天应用，并通过Community Cloud平台部署和管理这些应用。Streamlit简洁易用，支持快速原型设计和实时编辑，完全开源且免费，是开发各类数据应用的理想工具。

foldcomp - 高效压缩和索引大规模蛋白质结构数据集的开源工具

FoldcompGithub开源项目数据存储氨基酸编码生物信息学蛋白质结构压缩

Foldcomp是一个开源的蛋白质结构压缩和索引工具。通过编码主链和侧链的扭转角，它将每个氨基酸残基压缩至13字节，大幅降低存储需求。Foldcomp支持单链PDB文件压缩，提供命令行和Python API接口，可进行压缩、解压缩、序列提取等操作。此外，Foldcomp还提供了多个预构建的大规模蛋白质结构数据库，如AlphaFoldDB和ESMAtlas，便于研究人员使用。

misato-dataset - 大规模蛋白质-配体复合物数据集助力AI驱动的药物发现

AI模型GithubMISATO分子动力学开源项目药物发现蛋白质-配体复合物

MISATO是一个专为结构化药物发现设计的机器学习数据集，包含高质量的蛋白质-配体复合物数据。数据集涵盖了19000多个配体的量子力学计算结果和16000多个蛋白质-配体结构的分子动力学模拟。MISATO旨在提高配体分子精确度、合理表示系统动力学，并促进创新AI药物发现模型的开发。研究人员可免费下载MISATO数据集，使用提供的PyTorch数据加载器进行AI训练和预测。

pandas - Python数据分析与处理的开源利器

DataFrameGithubPythonpandas开源开源项目数据分析

pandas是Python生态系统中的核心数据分析库，提供高性能、易用的数据结构和工具。它支持处理结构化数据，包括数据清洗、转换、合并、分组分析等操作。pandas可读写多种格式的数据源，如CSV、Excel、SQL数据库等。作为开源项目，pandas由活跃社区维护，持续优化以满足数据科学家、分析师和开发者的需求。

pykaldi - Python 语音识别工具

GithubKaldiOpenFstPyKaldiPython开源项目语音识别

PyKaldi是一款Python脚本工具，为Kaldi语音识别工具包和OpenFst库提供了易用的Python包装器。它适用于语音识别研究人员和专业人士，可在Python中调用低级Kaldi函数、操作对象，并实现新工具。PyKaldi是对Kaldi的有力补充，其高层次的应用模块如ASR、对齐和分段，使大部分Python程序员都能上手。如果需要在Python中操控Kaldi和OpenFst对象，PyKaldi是一个理想的选择。

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